[R语言学习笔记] - Rstudio更变Package默认安装路径

场景

一般来说，R的开发者都用Rstudio，目前最好的R语言IDE。在需要升级R内核的时候，无论是原生内核还是Microsoft R Open 内核，免不了重新安装。这时候，之前的开发环境依赖的package就会很麻烦，除了原有package因版本不兼容最新内核需要重装外，其他的package都要复制到新的library目录下，这样很麻烦，也会导致很多冗余。

解决方案

1. 思路就是每次升级完内核后，将默认的library目录配置成原有的路径，如遇到版本不支持，再重新安装新版package。
2. 这里就涉及到install.package的默认目录更改操作了。在网上查到有下图这样的操作。确实更变了安装目录，但缺点是每次都需要输入指定目录，操作繁琐。
3. 最佳的方案应该是更改配置文件中的默认的目录信息。这里参考方案。修改R内核（可以为R原生内核，或者微软的R Open内核）目录下的Rprofile.site文件。在文件末尾增加代码libPaths(c("path1", "path2"))，用于设置library path。这里需要注意的是，Rstudio中的默认安装路径为.libPaths中的第一项，所以请注意。

#Rprofile.site
.libPaths(c("your package path", .libPaths()))

5. 更变完毕后，重新打开Rstudio，就能看见Default目录为我们指定的目录了。
   
6. stackoverflow上关于这个问题的讨论在 传送门。
7. 批量升级package。使用installed.packages()，version，packageStatus()查看package安装情况及r版本信息。使用update.packages(checkBuilt=TRUE)批量升级package。
8. 使用RGui调用installr::updateR()直接对版本升级。（需要安装installr包）。

关于R/Rstudio环境的整合配置，有兴趣可以看这里。