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Cytoscape 简介

1. 简介

  • Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件
  • 其核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据结合成可视化网络
  • 支持插件扩展，可以附加计算分析和其他功能
  • 官网：http://www.cytoscape.org/download.php

2. 基本概念

  • Cytoscape 的重要组织方式是网络
  • 其中，因子、基因、蛋白等分子用点表示，称为node
  • 两个点之间的交互关系用连接表示，称为edge

3. 安装

  • 需要提前安装JAVA

4. 简单演示

  • 导入数据


    Cytoscape 简介_第1张图片
    image.png
  • 操作技巧网上有很多教程
  1. Cytoscape史上最全攻略
    Cytoscape 简介_第2张图片
    image.png

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