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indigo&python | 对化学反应的反应中心原子进行mapping

indigo通用化学信息库

安装indigo方法

反应中心指的是在化学反应中，周围环境发发生了变化的原子，需要对这些原子进行编号

# 用indigo对反应中的原子做了mapping之后才能提取反应中心
from indigo import *

indigo = Indigo()
# time unit:  milliseconds
indigo.setOption("aam-timeout", 60000)

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