睡眠多导图数据集 Sleep-EDF简介

由于某种原因接触到睡眠分期相关项目，以下翻译Sleep-EDF公开数据集介绍并加上自己的理解以便日后查阅。

1.数据集简介

sleep-edf（European Data Format即欧洲数据格式：一种用于交换和存储多通道生物和物理信号的简单而灵活的格式），其中Version 2的数据库包含197个整夜的PolySomnoGraphic睡眠记录，其中包含EEG，EOG，下巴EMG和事件标记。一些记录还包含呼吸和体温。训练有素的技术人员会根据Rechtschaffen和Kales手册手动对相应的睡眠多导图（睡眠模式）进行打分，这个数据的标记必须要专业的从事人员，但自己在调研AASM评分手册的时候 得到一些启发，后期可以尝试以量化的标准形成一个相对值得信赖的ground truth，可用于有监督分类。
Version1的数据集中只包含61个整晚的PSG。

2. 具体元数据表示形式（微观表示）

以*PSG.edf为后缀的文件是包含EEG（来自Fpz-Cz和Pz-Oz电极位置），EOG（只有水平），下颌肌EMG和事件标记的整夜多睡眠睡眠记录。 SC* PSG.edf类型文件（请参阅“睡眠录像带研究（sleep cassette）”）通常还包含口鼻呼吸和直肠体温。

*Hypnogram.edf文件包含与PSG对应的睡眠模式的注释。这些模式（催眠图）包括睡眠阶段W，R，1、2、3、4，M（身体移动时间）和？ （未评分）。所有催眠图都是由训练有素的技术人员（根据催眠图文件名中的第八个字母来区分）手动评分，但基于Fpz-Cz / Pz-Oz脑电图而不是C4-A1 / C3-A2脑电图，如[4]所建议）。

所有EDF标头字段也符合EDF +规范，并且未记录的信号已从ST*PSG.edf文件中删除。

3. 数据集中包含的实验（宏观表示）

3.1 睡眠盒式磁带研究和数据

顾名思义，是利用便携式的记录仪将数据存储在磁带中的方式采集。153个SC *文件（SC =睡眠盒式磁带）是在1987-1991年的一项研究中对年龄在25-101岁的健康白人中对睡眠的影响进行研究而获得的，没有任何与睡眠有关的药物。随后在受试者住所的两个日夜时段记录了两个大约20小时的PSG。受试者继续正常活动，但佩戴了鲍勃（Bob）1987年论文[7]第VI.4章（第92页）中所述的类似Walkman的盒式磁带录音机。

文件以SC4ssNEO-PSG.edf的形式命名，其中ss是主题编号，N是夜晚。被试36和52的头一个晚上以及被试13的第二个晚上由于盒式磁带故障而丢失。
EOG和EEG信号均以100 Hz采样。对脑膜下EMG信号进行电子高通滤波，整流和低通滤波，然后以uV rms（均方根）表示的所得EMG包络以1Hz采样。鼻腔气流，直肠体温和事件标记也以1Hz采样。
具体信息在文件头与SC-subjects.xls进一步描述了相关主题和记录。

3.2 睡眠遥测研究和数据

相比上面，遥测是指 利用射频发射的记录仪，将采集到的信号实时发射到计算机上的采集方式。在1994年替马西泮（一种安定药）22名白人男性和女性的睡眠影响进行的一项研究中，获得了44个ST *文件（ST =睡眠遥测），而没有其他药物。受试者入睡时轻度困难，但其他方面健康。在医院的两个晚上记录了大约9个小时的PSG，其中一个在服用替马西泮后，另一个在服用安慰剂后。受试者佩戴了微型遥测系统，该系统具有很好的信号质量。

文件以ST7ssNJ0-PSG.edf的形式命名，其中ss是主题编号，N是夜晚。
EOG，EMG和EEG信号以100 Hz采样，事件标记为1 Hz。物理标记尺寸ID + ME与以下事实有关：按下标记（M）按钮会产生相对于基线值的两秒偏移，该基线值标识遥测单位（如果为正，则ID = 1或2）或标记为错误（E）在遥测链接中是否为负。在文件头与描述性电子表格ST-subjects.xls中有详细的描述。

4. 获取方式

  wget -r -N -c -np https://physionet.org/files/sleep-edfx/1.0.0/
  

终端下直接通过wget下载

5. 参考链接

    https://www.physionet.org/content/sleep-edfx/1.0.0/

睡眠分期项目初显成效，日后继续更新~