【Mac版】基于pytorch环境安装PyG库+DGL库

搭建GNN环境教程

1、创建python=3.6的conda虚拟环境

conda create -n env_gnn python=3.6

2、用conda安装pytorch1.6.0的cpu版本

pytorch官网安装命令。

conda install pytorch==1.6.0 torchvision==0.7.0 -c pytorch

import torch进行检验，没有问题。

3、pip安装cpu版本的PyG

pytorch-geometric(github项目)。
pytorch-geometric官方安装指南。

pip install torch-scatter==latest+cpu -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.6.0.html
pip install torch-sparse==latest+cpu -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.6.0.html
pip install torch-cluster==latest+cpu -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.6.0.html
pip install torch-spline-conv==latest+cpu -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.6.0.html
pip install torch-geometric

import torch_geometric进行检验，没有问题。

4、conda安装cpu版本的DGL

deep graph library官方安装指南。

conda install -c dglteam dgl

import dgl进行检验，没有问题。

查看GNN环境

conda list

显示所有安装的库。

# Name                    Version                   Build  Channel
appnope                   0.1.0                    py36_0  
ase                       3.20.1                   pypi_0  
blas                      1.0                         mkl  
cached-property           1.5.2                    pypi_0  
certifi                   2020.6.20                pypi_0  
chardet                   3.0.4                    pypi_0  
cycler                    0.10.0                   pypi_0  
decorator                 4.4.2                    pypi_0  
dgl                       0.5.2                    py36_0  
freetype                  2.5.5                         2  
future                    0.18.2                   pypi_0  
googledrivedownloader     0.4                      pypi_0  
h5py                      3.0.0                    pypi_0  
idna                      2.10                     pypi_0  
intel-openmp              2019.4                      233  
ipykernel                 4.6.1                    py36_0  
ipython                   6.1.0                    py36_0  
ipython_genutils          0.2.0                    py36_0  
isodate                   0.6.0                    pypi_0  
jbig                      2.1                           0  
jedi                      0.10.2                   py36_2  
jinja2                    2.11.2                   pypi_0  
joblib                    0.17.0                   pypi_0  
jpeg                      9b                            0  
jupyter_client            5.1.0                    py36_0  
jupyter_core              4.3.0                    py36_0  
kiwisolver                1.2.0                    pypi_0  
libcxx                    10.0.0                        1  
libgfortran               3.0.1                h93005f0_2  
libpng                    1.6.30                        1  
libtiff                   4.0.6                         3  
llvmlite                  0.34.0                   pypi_0  
markupsafe                1.1.1                    pypi_0  
matplotlib                3.3.2                    pypi_0  
mkl                       2019.4                      233  
mkl-service               2.3.0            py36hfbe908c_0  
mkl_fft                   1.2.0            py36hc64f4ea_0  
mkl_random                1.1.1            py36h959d312_0  
networkx                  2.5                      pypi_0  
ninja                     1.7.2                         0  
numba                     0.51.2                   pypi_0  
numpy                     1.19.2           py36h456fd55_0  
numpy-base                1.19.2           py36hcfb5961_0  
olefile                   0.44                     py36_0  
openssl                   1.0.2l                        0  
pandas                    1.1.4                    pypi_0  
path.py                   10.3.1                   py36_0  
pexpect                   4.2.1                    py36_0  
pickleshare               0.7.4                    py36_0  
pillow                    8.0.1                    pypi_0  
pip                       20.2.4                   pypi_0  
prompt_toolkit            1.0.15                   py36_0  
ptyprocess                0.5.2                    py36_0  
pygments                  2.2.0                    py36_0  
pyparsing                 2.4.7                    pypi_0  
python                    3.6.2                         0  
python-dateutil           2.8.1                    pypi_0  
pytorch                   1.6.0                   py3.6_0  
pytz                      2020.1                   pypi_0  
pyzmq                     16.0.2                   py36_0  
rdflib                    5.0.0                    pypi_0  
readline                  6.2                           2  
requests                  2.24.0                   pypi_0  
scikit-learn              0.23.2                   pypi_0  
scipy                     1.5.3                    pypi_0  
setuptools                36.4.0                   py36_1  
simplegeneric             0.8.1                    py36_1  
six                       1.10.0                   py36_0  
sqlite                    3.13.0                        0  
threadpoolctl             2.1.0                    pypi_0  
tk                        8.5.18                        0  
torch-cluster             1.5.7                    pypi_0  
torch-geometric           1.6.1                    pypi_0  
torch-scatter             2.0.5                    pypi_0  
torch-sparse              0.6.7                    pypi_0  
torch-spline-conv         1.2.0                    pypi_0  
torchvision               0.7.0                  py36_cpu  
tornado                   4.5.2                    py36_0  
tqdm                      4.51.0                   pypi_0  
traitlets                 4.3.2                    py36_0  
urllib3                   1.25.11                  pypi_0  
wcwidth                   0.1.7                    py36_0  
wheel                     0.29.0                   py36_0  
xz                        5.2.3                         0  
zlib                      1.2.11                        0