Week 2 L3-4 细菌中复制叉模型 解旋酶 SSB 拓扑异构酶 旋转酶 冈崎片段修复 聚合酶 DNA复制模型

http://mooc.guokr.com/note/16870/

3.1Replication in Living Cells

3.2The Replication Fork and Associated Proteins

lagging strand向解璇的反方向进行

3.3DNA Helicase解旋酶

DNA Helicase使得DNA双链解螺旋

3.4 A Basic Helicase Assay for DNA Unwinding解璇

检测解旋酶活性的实验

3.5 Other Helicase Properties and Assays

极性：只向一个方向移动。
只能结合单链DNA。
检测解旋酶方向的实验

3.6单链结合蛋白（SSB，Single-Stranded Binding Protein）

防止解开的链重新闭合。通过与lagging strand template迅速结合的方式

4.1Topoisomerase 拓扑异构酶and Topological Problems of the Replication Fork

解开过度螺旋的DNA或重新缠绕螺旋不足的DNA

4.2Types of Topoisomerases and Mechanisms

I型切断一条链，使得一条链穿过切口。
II 型切断双链。它可以解开两个相连的环状DNA。

4.3 A Type II Topoisomerase - DNA Gyrase旋转酶

能促进DNA解璇
需要能量

4.4 DNA Topology

DNA拓扑结构

4.5 Assays for Topoisomerase

通过观察拓扑异构酶作用后的DNA状况。紧密缠绕的DNA移动速度快，而松散缠绕的DNA移动速度快，使用凝胶电泳。

4.6 冈崎片段修复Okazaki Fragment Repair

去除RNA引物
DNA连接酶将5端的P连接到3端的OH

4.7 不同的DNA聚合酶Different DNA Polymerases

不同的DNA聚合酶

4.8 The DNA Polymerase III Holoenzyme全酶

4.9 细菌中酶怎样在复制叉处协同工作？ Enzymes at the Bacterial Replication Fork

4.10 The Trombone Model长号模型 of DNA Replication

总的模型概述
http://sites.fas.harvard.edu/~biotext/animations/replication1.swf