1、项目背景
为通过项目实战增加对知识图谱的认识,几乎找了所有网上的开源项目及视频实战教程。
果然,功夫不负有心人,找到了中科院软件所刘焕勇老师在github上的开源项目,基于知识图谱的医药领域问答项目QABasedOnMedicaKnowledgeGraph。
项目地址:https://github.com/liuhuanyong/QASystemOnMedicalKG
用了两个晚上搭建了两套,Mac版与Windows版,哈哈,运行成功!!!
从无到有搭建一个以疾病为中心的一定规模医药领域知识图谱,以该知识图谱完成自动问答与分析服务。该项目立足医药领域,以垂直型医药网站为数据来源,以疾病为核心,构建起一个包含7类规模为4.4万的知识实体,11类规模约30万实体关系的知识图谱。 本项目将包括以下两部分的内容:
1、基于垂直网站数据的医药知识图谱构建
2、基于医药知识图谱的自动问答
2、项目环境
2.1 windows系统
搭建中间有很多坑,且行且注意。
配置要求:要求配置neo4j数据库及相应的python依赖包。neo4j数据库用户名密码记住,并修改相应文件。
安装neo4j,neo4j 依赖java jdk 1.8版本以上:
java jdk安装方法可参考:windows系统下安装JDK8,下载地址:https://download.oracle.com/otn-pub/java/jdk/8u201-b09/42970487e3af4f5aa5bca3f542482c60/jdk-8u201-windows-x64.exe
安装neo4j可参考博文:windows安装neo4j,下载地址:https://go.neo4j.com/download-thanks.html?edition=community&release=3.4.1&flavour=winzip
安装python可参考:Windows环境下安装python2.7
根据neo4j 安装时的端口、账户、密码配置设置设置项目配置文件:answer_search.py & build_medicalgraph.py (github下载项目时根据个人需要也可使用git)
数据导入:python build_medicalgraph.py,导入的数据较多,估计需要几个小时。
python build_medicalgraph.py导入数据之前,需要在该文件main函数中加入:
启动问答:python chat_graph.py
2.2 Mac系统
mac本身自带python、java jdk环境,可直接安装neo4j图数据库,项目运行步骤与windows基本一样。
问题解答:
安装过程中如遇问题可联系Wechat: dandan-sbb。
2.3 Neo4j数据库展示
2.4 问答系统运行效果
3、项目介绍
该项目的数据来自垂直类医疗网站寻医问药,使用爬虫脚本data_spider.py,以结构化数据为主,构建了以疾病为中心的医疗知识图谱,实体规模4.4万,实体关系规模30万。schema的设计根据所采集的结构化数据生成,对网页的结构化数据进行xpath解析。
项目的数据存储采用Neo4j图数据库,问答系统采用了规则匹配方式完成,数据操作采用neo4j声明的cypher。
项目的不足之处在于疾病的引发原因、预防等以大段文字返回,这块可引入事件抽取,可将原因结构化表示出来。
3.1 项目目录
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├── README.md
├── __pycache__ \\编译结果保存目录
│ ├── answer_search.cpython-36.pyc
│ ├── question_classifier.cpython-36.pyc
│ └── question_parser.cpython-36.pyc
├── answer_search.py
├── answer_search.pyc
├── build_medicalgraph.py \\知识图谱数据入库脚本
├── chatbot_graph.py \\问答程序脚本
├── data
│ └── medicaln.json \\本项目的全部数据,通过build_medicalgraph.py导neo4j
├── dict
│ ├── check.txt \\诊断检查项目实体库
│ ├── deny.txt \\否定词库
│ ├── department.txt \\医疗科目实体库
│ ├── disease.txt \\疾病实体库
│ ├── drug.txt \\药品实体库
│ ├── food.txt \\食物实体库
│ ├── producer.txt \\在售药品库
│ └── symptom.txt \\疾病症状实体库
├── document
│ ├── chat1.png \\系统运行问答截图01
│ ├── chat2.png \\系统运行问答截图01
│ ├── kg_route.png \\知识图谱构建框架
│ ├── qa_route.png \\问答系统框架图
├── img \\README.md中的所用图片
│ ├── chat1.png
│ ├── chat2.png
│ ├── graph_summary.png
│ ├── kg_route.png
│ └── qa_route.png
├── prepare_data
│ ├── build_data.py \\数据库操作脚本
│ ├── data_spider.py \\网络资讯采集脚本
│ └── max_cut.py \\基于词典的最大向前/向后脚本
├── question_classifier.py \\问句类型分类脚本
├── question_classifier.pyc
├── question_parser.py \\问句解析脚本
├── question_parser.pyc
3.2 知识图谱的实体类型
3.3 知识图谱的实体关系类型
3.4 知识图谱的属性类型
3.5 问答项目实现原理
本项目的问答系统完全基于规则匹配实现,通过关键词匹配,对问句进行分类,医疗问题本身属于封闭域类场景,对领域问题进行穷举并分类,然后使用cypher的match去匹配查找neo4j,根据返回数据组装问句回答,最后返回结果。
问句中的关键词匹配:
根据匹配到的关键词分类问句
问句解析
查找相关数据
根据返回的数据组装回答
3.6 问答系统支持的问答类型
4、项目总结
基于规则的问答系统没有复杂的算法,一般采用模板匹配的方式寻找匹配度最高的答案,回答结果依赖于问句类型、模板语料库的覆盖全面性,面对已知的问题,可以给出合适的答案,对于模板匹配不到的问题或问句类型,经常遇到的有三种回答方式:
1、给出一个无厘头的答案;
2、婉转的回答不知道,提示用户换种方式去问;
3、转移话题,回避问题;
例如,本项目中采用了婉转的方式回答不知道:
基于知识图谱的问答系统的主要特征是知识图谱,系统依赖一个或多个领域的实体,并基于图谱进行推理或演绎,深度回答用户的问题,基于知识图谱的问答系统更擅长回答知识性问题,与基于模板的聊天机器人有所不同的是它更直接、直观的给用户答案。对于不能回答、或不知道的问题,一般直接返回失败,而不是转移话题避免尴尬。
整个问答系统的优劣依赖于知识图谱中知识的数量与质量。也算是利弊共存吧!知识图谱图谱具有良好的可扩展性,扩展了知识图谱也就是扩展了问答系统的知识库。如果问句在射程范围内,可轻松回答,但如果不幸脱靶,则体验大打折扣。
从知识图谱的角度分析,大多数知识图谱规模不足,主要原因还是数据来源以及技术上知识的抽取与推理困难。