BioStar handbook生信入门

      刚刚从本科生步入研究生阶段,本科是211的纯生物狗,对于实验技能和生物知识理解还算可以,现在在985学校读研究生,刚刚开始研究生生活三个多月,从纯实验操作到依靠计算机为基础进行研究,对于我有较大的转变,步入生信领域其实是我开心的事情,其一是我对计算机很感兴趣,其二就是生物学基础吧,还有较好的发展。

      这样子在网络上畅聊还是第一次,所以写这篇文章发表在小组内也犹豫了很久,平时许多事情大多通过自学等途径,当然这样效率蛮低。希望不要嫌弃我的啰嗦,哈哈。

      下面开始正文,接触生信三个月来,从完全的小白到现在的接触皮毛,距离我想要的还有很大一段路要走。

      目前基本了解和接触的内容:

1. 数据库:NCBI  UCSC  GenBank等会简单的运用,阅读完一本生信教材,对转录和DNA,蛋白质,基因等有了初步的数据理解,了解基本的BLAST和FASTA内容。

2.编程工具:R和Python完成了初步的认识,但是实例做的很少,代码敲的很少。希望接下来加大使用频率,尽快熟练掌握。

3.实验室这学期要完善服务器和网站,所以在学习Typo3 Script编写网站,但是代码阶段还没进行,Html知识和PHP内容也需要但还没有学习。还有服务器构建也不会,但想学习。

4.基于研究内容,真核生物复制起始点相关,所以要通过机器学习和相关算法进行研究,也没有进行。

5.生信领域的算法和研究思路,还有使用工具等了解也很少,总的来说,内容很多,比如RNA-seq和Chip-seq,biostar,全基因组分析,高通量测序,几代测序方法等,都只是听过但都不了解,而且觉得还有许多没听过的内容。对于这样杂的小内容平时要多收集和整理。

6.文献方面,最近在阅读文献,由于读的比较少可能,许多单词不认识,一篇文章一两页可能就要阅读一晚上,但是现在有记录文献总结的习惯。

7.从公众号和其他平台得到了一些视频和书籍资料,看视频但是不太基础,目前听不太懂,实例的研究思路不到位。

8.之后想要通过编写完成一个数据库的建立,所以还要学习C++和java的内容,但是可能要搁置较久了。

      截止今天,尝试开始在幕布上写一些自己的心得和生信学习过程,新人上路,多谢这三个月来老师和各位同学,博主等的帮助,蟹蟹这个平台让我有勇气开始记录自己的成长~~东西太多,话有点多,请多担当。

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