Linux软件下载以及修改环境变量

一、什么是环境变量

小编的理解就是，告诉系统去哪找到你的文件。简单的例子，当你下载了一个软件Samtools，你想要运行该软件时，如果你不在该软件所在的文件夹，
你就需要在软件命令前加上软件所在的路径，而你将该软件添加了环境变量，随便你在哪个文件位置，你都可以运行该软件的命令，这就是修改环境变量的好处。
总之，修改环境变量就是告诉系统除了在当前目录下面寻找此程序外, 还应到哪些目录下去寻找，这些目录就是我们修改环境变量添加进去的。

二、怎么在linux上下载软件

推荐两种方法：

• 使用wget下载（以下载samtool软件为例子）
  1.在windows系统，打开网页找到samtools所在的网站，点击下载软件。

  
  
  

  image
  
  

  2.复制上图中箭头所指的链接；然后在服务器软件安装文件夹下使用下面命令

$ wget https://nchc.dl.sourceforge.net/project/samtools/samtools/1.9/samtools-1.9.tar.bz2

3.这样软件就进入该文件夹了，用下面命令进行解压

$ tar -jxvf samtools-1.9.tar.bz2

在软件命令前添加软件所在的路径应该就可以使用了。

• 使用Miniconda安装 （但目前很多软件好像下不了了）
  相当于windows系统的360，自动下载并修改环境变量。小编还是认为这个软件很人性化的。Miniconda的下载编译方法见百度。

三、怎么修改环境变量

介绍两种修改环境变量的方法

• 永久修改，也就是以后都可以随时使用了
  PATH:软件所在文件夹路径' >> ~/.bashrc
  $ source ~/.bahsrc

• 临时修改，只对当前的shell有效
  PATH

• 如有疑问，可通过个人主页微信进群交流