RStudio简介
RStudio是R语言的集成开发环境(IDE)，它是一个独立的开源项目，它将许多功能强大的编程工具集成到一个直观、易于学习的界面中。RStudio可以在所有主要平台(Windows、Mac、Linux)上运行，也可以通过web浏览器(使用服务器安装)运行。如果你是一个R新手或者偏爱界面版的R环境，那么你会喜欢上RStudio，本书的目的之一即是缩短你与RStudio之间的距离。
RStudio作为一个定期发布的稳定版本，其实在这之间每天都有发布。
这本书，正如它所写的那样，描述了其中一个版本：
0.95.75;当前稳定的版本是0.94.102。这里描述的一些特性，比如项目特性，目前在稳定的版本中是不可用的。
在深入RStudio之前，我们将首先快速概述R和ide。
什么是R语言？
R是一个统计计算和图形的开源软件环境。R在Windows、Mac OS X和许多UNIX平台(例如 Linux)。对于大多数平台，R以二进制格式发布，以便于安装。R软件最初是由Robert Gentleman和Ross Ihaka发起的。这种语言深受S语言的影响，而S语言最初是由约翰·钱伯斯和他的同事在贝尔实验室开发的。从那时起，在R的核心开发团队的指导和人才的帮助下，R已经发展成为学术界许多学科和各行业统计计算的通用语言。
R不仅仅是它的核心语言。它有一个世界性的存储系统全面的R档案网络(CRAN) -http://cran.r-project.org -为用户贡献的包（packages），以扩充R语言的功能。截至2011年，CRAN上有3000多个这样的软件包，其他平台上还有更多。总的来说，R目前拥有解决大量问题的功能，并且仍有巨大的发展空间。
R是围绕其核心脚本语言设计的，但也允许与用C、c++、Fortran、Java等语言编写的编译代码集成，用于计算密集型任务或利用为其他语言提供的工具。
什么是IDE？
与其他编程语言一样，R是通过用户编写的函数扩展(或开发)的。一个集成开发环境(IDE)，例如RStudio，被设计来促进这样的工作。此外，与使用图形用户界面的许多其他统计软件包不同，典型的用户主要通过命令行与R进行交互。然后，R的IDE还必须包括以交互方式发出命令的方法。在这方面R并不是唯一的，交互式科学编程语言的ide已经成熟，包括以下特性:
- 发出命令的控制台。
- 源代码编辑器;在它的核心，开发涉及到编程的行为，并且这个任务不可避免地需要一个源代码编辑器来完成。这样的编辑已经存在一段时间了，现在对编辑的期望很高。典型的期望包括:
- 一组丰富的快捷键
- 自动源代码格式化，括号辅助，关键字突出显示
- 代码折叠和易于导航通过一个文件和文件之间
- —上下文敏感的帮助
- 编译或运行软件的接口
- 项目管理功能
- 辅助调试
- 与报告撰写工具的集成
- 对象浏览器;在交互式使用中，用户的工作空间包括已定义的变量。对象浏览器允许用户快速识别每个此类变量的类型和值。
- 对象编辑器;在对象浏览器中，通常提供了检查或编辑对象的方法。
- 与基础文档的集成。
- 绘图管理工具
已存在的R语言IDE，如表一：
Table 1-1. Some existing IDEs for R
| Name | Platforms | Description |
|---|---|---|
| ESS | All | ESS (http://ess.r-project.org) is a powerful and commonly used interface for R that integrates the venerable emacs editor with R. There are numerous conveniences, but some find that it is difficult to learn and has an old-school feel, which precludes adoption. |
| Eclipse | All | The open-source StatET plugin (http://www.walware.de/goto/statet) turns Eclipse, a Java-based multipurpose IDE, into a full-featured IDE for R. |
| SciViews | All | An R API and extension for the Komodo code editor. |
| JGR | All | Java-based editor that interfaces with R through the rJava and JRI pack�ages. The Deducer package adds a suite of data analysis tools. |
| Tinn-R | Windows | An extension for the Tinn editor that allows integration with an underlying R process. |
| Notepad++ | Windows | With the NpptoR extension allows the Notepad++ editor to interact with an R process. |
| RGui | Windows | The Windows GUI for R has many of the features of an IDE. |
什么是Rstudio?
RStudio项目以一种新颖的方式为IDE提供了大多数需要的特性，使得使用r变得更容易、更高效。
- IDE的主要组件都很好地集成到一个四面板布局中，其中包括用于交互式R会话的控制台、用于组织项目文件的带选项卡的源代码编辑器，以及用于组织较少中心组件的带笔记本的面板。
- 源代码编辑器功能丰富，并与内置控制台集成。
- 通过选项卡完成和帮助页面查看器组件，控制台和源代码编辑器与R的内部帮助系统紧密相连。
- 设置不同的项目很容易，在它们之间进行切换甚至更容易。
- RStudio提供了许多方便且易于使用的管理工具，用于管理包、工作区、文件等。
- IDE可用于三种主要操作系统，可以通过web浏览器进行远程访问。
- RStudio比Emacs/ESS更容易学习，比Emacs/ESS更容易配置和安装
Eclipse/StatET拥有比JGR更好的编辑器，比JGR更有组织性
Sciviews不同于notepad++和RGui，它可以在更多的平台上使用，而不只是windows。
RStudio程序可以在桌面上运行，也可以通过web浏览器运行。桌面版适用于Windows、Mac OS X和Linux平台，在所有平台上的表现都类似，只是快捷键略有不同。
为了实现这种跨平台性，RStudio在其设计中利用了大量现有的web技术。对于桌面应用程序，它巧妙地将它们显示在Qt(一个跨平台应用程序和UI框架)提供的行业标准HTML小部件中，以创建桌面应用程序。因此，R用户可以有一个丰富和一致的编程环境R他们的方式-桌面-或基于网络。基于web的使用并不在“云”中(尽管该服务可能即将提供)，而是可以通过部门或组织内的可信服务器来完成。
RStudio是J. J. Allaire的创意，他和他的兄弟之前在开发用于web开发的ColdFusion IDE和脚本语言方面取得了巨大的成功。阿莱尔目前加入非常能干的约瑟夫·程，约书亚·保尔森，和保罗·迪克里斯提娜。在很短的时间内，他们的初始测试版已经可用，他们已经证明是非常响应用户输入。RStudio正在积极开发中。
因此，这本书中所讨论的内容可能会随着你的阅读而改变。抱歉，但你用这个新功能可能比我所描述的更好.
和R一样，RStudio也是一个开源项目。它规定的目标已经实现了
-是开发一个强大的工具，支持创建值得信赖的高质量分析所需的实践和技术。代码库是在AGPLv3许可下发布的，可以从GitHub上获得(https://github.com/rstudio/rstudio)。RStudio是建立在许多其他开源项目之上的。其中最明显的是GWT，谷歌的Web Toolkit;Qt，诺基亚的图形工具包;以及JavaScript代码编辑器Ace (http://ace.ajax.org)。RStudio的About对话框中列出了其他的杠杆项目。
大部分代码是用c++和Java编写的，它们都是使用GWT的语言。
使用RStudio
我们将从启动RStudio的过程开始，将安装问题推迟一段时间。由于RStudio可以从桌面或通过服务器使用，所以有两种启动它的方法。
桌面版本
对于桌面版本，RStudio与大多数其他应用程序一样启动。在图1-1中，我们看到在Mac OS x下运行的应用程序。对于Windows用户，安装过程会留下一个菜单项。对于Linux用户，命令rstudio将打开窗口。它也可以安装一个菜单项，就像Ubuntu一样，它出现在菜单项中。
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在图1-1中，我们看到三个主要组件:控制台，任何R用户都应该熟悉它;工作空间浏览器(没有项目，因为初始工作空间是空的)和历史记录接口。后两个是包含其他组件的笔记本的一部分。源代码组件(或代码编辑器)在屏幕快照中没有打开，因为没有打开文件供编辑或查看。
服务器版
启动服务器版本需要知道服务器的适当URL。
我们为这本书使用了一个本地URL，但是真正的价值来自于在更广泛的internet上使用RStudio作为资源。在访问RStudio时，必须首先进行身份验证。
这样做的基本屏幕如图1-2所示。身份验证取决于服务器，但默认情况下是根据计算机上的用户帐户进行身份验证，因此web管理员应该提供访问RStudio的安全方法。
通过身份验证后，布局看起来与桌面版本比较相似
从图1-1到图1-3可以看到这个。一个主要的区别是菜单栏的位置。在桌面图中，在Mac OS X下，菜单栏按照操作系统的自定义放置，与应用程序分离，位于屏幕顶部
-不集成到RStudio GUI中。对于服务器版本，菜单栏出现在应用程序主工具栏的上方。
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在使用服务器版本时，每个用户只能打开一个实例。如果在不同的机器上启动了一个新会话，或者只是在同一个浏览器的不同选项卡上启动了一个新会话，旧的会话就会断开连接并发出通知。
工作空间
当R启动时，其过程如下:
- 在工作目录中启动R。
- 如果存在，则执行. rprofile文件的命令。
- 如果存在，则加载. rdata文件。
- 遵循?Startup中描述的其他操作。
当退出时，用户被询问“保存工作区图像?”当工作空间被保存时，它将内容写到一个. rdata文件中，这样当R重新启动时，工作空间可以在会话之间保持。(你也可以用save.image启动它。)
此过程允许R用户将希望在每个会话中运行的命令放置在. rprofile文件中，并为每个目录拥有. rdata文件，以便不同的全局工作区可以用于不同的项目。
项目
RStudio提供了一个非常有用的“Projects”特性，允许用户在项目之间快速切换。每个项目在源组件中可能有不同的工作目录、工作区和文件集合。当前项目名称列在主应用程序工具栏最右侧的组合框中，该组合框允许在打开的项目、打开现有项目或创建新项目之间切换。
新项目只需要一个名称和一个工作目录。这个特性非常适合RStudio，因为当它作为web应用程序运行时，由于web连接的性质，需要序列化和恢复会话。在项目之间切换与选择开放项目一样简单。RStudio只序列化旧的文件并还原新选择的文件。
R
RStudio不需要运行特殊版本的R，只要它是一个相当现代的版本。它将与来自CRAN或用户编译版本的二进制版本一起工作。因此，当RStudio启动时，它必须能够定位R的一个版本，这个版本可能驻留在许多不同的地方。通常RStudio只找到正确的，但是可以绕过搜索过程。在线文档http://www.rstudio.org/docs/advanced/versions_of_r详细说明了如何指定使用哪个R安装。简而言之，它取决于底层操作系统。对于Windows桌面用户来说，可能是这样
使用在选项对话框中指定的RStudio | 7(“选项对话框”在第9页)
Mac OS X用户可以设置一个环境变量，如下图所示:
$ export RSTUDIO_WHICH_R=/usr/local/bin/R
基于web的用户真的没有选择，因为这是由谁来配置服务器决定的。
组件布局
RStudio接口由工具栏和菜单栏下面的几个主要组件组成。虽然这个位置可以调整，但默认布局在以下位置使用四个主面板或窗格:
左上角是一个用于编辑文件的源浏览器笔记本(参见“源代码”)
编辑"在63页)或查看一些数据集。在图1-3中，这是不可见的，因为该会话没有打开任何文件。左下角是一个与R进程交互的控制台(第3章)。
右上角是一个记事本小部件，用于存放一个工作空间浏览器(“Workspace”)
浏览器"在第38页)和历史浏览器("命令历史"在第36页)。右下角是一个笔记本，用来记录与文件交互的选项卡(“the”)
文件浏览器"在71页)，情节("浏览器"在45页)，包
(“包维护”在第73页)，以及帮助系统组件(“帮助”)
页面查看器"在第42页)。
控制台窗格有一些特权:它总是可见的，并且有一个标题栏。其他组件使用记事本小部件，页面选项卡用作标题栏。这些页面具有特定于页面的工具栏(可能不止一个)，在使用源组件也与上下文相关。
用户可以更改每个窗格的默认空间分配。在界面的左右两边中间出现了一个窗框，可以让用户调整空间的横向分配。此外，每一面都有另一个窗框来分配两个窗格之间的垂直空间。此外，每个窗格的标题栏都有图标，用于为组件添加阴影、垂直最大化组件或共享空间。
常快捷键
可以使用鼠标轻松地在组件之间切换。同样，视图菜单栏也有用于此任务的子项。对于高级用户，键盘加速器列在
表1-2是有用的。(通过帮助>可以获得完整的键盘快捷键列表
快捷键菜单项。)
| Description | Windows& Linux | Mac | |
|---|---|---|---|
| Move cursor to Source Editor | Ctrl+1 | Ctrl+1 | |
| Move cursor to Console | Ctrl+2 | Ctrl+2 | |
| Show workspace | Ctrl+3 | Ctrl+3 | |
| Show data | Ctrl+4 | Ctrl+4 | |
| Show history | Ctrl+5 | Ctrl+5 | |
| Show files | Ctrl+6 | Ctrl+6 | |
| Show plots | C | trl+7 | Ctrl+7 |
| Show packages Ctrl+8 | Ctrl+8 | ||
| Show help | Ctrl+9 | Ctrl+9 |
对话框项
通过选项对话框调整RStudio首选项。这个对话框有四个面板可以调整:通用属性、编辑属性(图3-4)、外观属性和窗格布局(图1-4)。
