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摘要:本文主要介绍了Python在生物信息学中的应用,特别是在基因组学和蛋白质组学领域。文章详细讲述了各个原理,并以代码实例展示了实际应用。我们将探讨如何利用Python分析基因组数据,解析蛋白质序列,以及进行比对分析等。文章目录1.引言2.分析基因组数据2.1读取和解析FASTA文件2.2基因频率分析2.3代码实例3.蛋白质组学3.1解析蛋白质序列3.2蛋白质序列比对3.3代码实例4.总结1.引
- 队列在计算机系统中的应用
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队列在计算机系统中有广泛的应用,主要用于管理任务和处理数据流。以下是队列的一些常见应用场景:1.任务调度操作系统:操作系统使用队列管理进程调度,如先来先服务(FCFS)调度算法。线程池:线程池通过队列管理待执行任务,确保任务按顺序处理。2.数据缓冲I/O操作:队列用于缓冲输入输出数据,平衡生产者和消费者速度。网络通信:网络数据包通过队列缓冲,确保按顺序处理。3.消息传递消息队列:在分布式系统中,消
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- 实战篇:GBase 8a MPP Cluster 安装部署过程
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一、什么是结构体指针?在C语言中,结构体是一种用户自定义的数据类型,可以将不同类型的变量组合在一起形成一个更复杂的数据结构。而结构体指针则是指向结构体变量地址的指针。通过结构体指针,我们可以动态访问结构体成员、传递结构体到函数以及进行内存管理等操作。结构体指针提供了一个更加灵活和高效的方式来操作结构体,特别是在处理大型数据结构时,指针的使用可以节省内存并提高程序性能。二、如何声明结构体指针?结构体
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Lumberyard:Lumberyard物理系统详解Lumberyard物理系统概述物理引擎介绍Lumberyard,亚马逊的游戏引擎,集成了强大的物理引擎,用于模拟游戏世界中的真实物理行为。其物理引擎基于PhysX,一个由NVIDIA开发的物理模拟技术,广泛应用于游戏开发中。PhysX支持复杂的物理交互,包括刚体动力学、软体物理、流体动力学等,能够为游戏提供逼真的物理效果。物理系统在Lumbe
- C# 线程池 ThreadPool 的深入解析与应用
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在多线程编程中,线程池(ThreadPool)是一种高效利用系统资源的方式。通过合理使用线程池,可以显著提高应用程序的性能和响应能力。本文将深入解析C#中的ThreadPool类,并展示如何在实际应用中有效地使用它。你是否曾经面临过创建过多线程导致系统资源耗尽的问题?C#提供的ThreadPool类可以帮助你优雅地管理线程,避免这些问题。本文将带你一步步深入了解ThreadPool并展示其在实际项
- C#—线程池详解
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C#—线程池详解核心机制说明自动回收与重用线程池中的线程在完成任务后不会销毁,而是回到池中等待新任务。无需手动“重新启用”,线程池会自动调度可用线程处理新任务。线程回收策略空闲线程超过一定时间(默认约20秒)后会被自动回收突发大量任务时,线程池会按需创建新线程(受SetMinThreads/SetMaxThreads限制)线程池概述线程池(ThreadPool)是.NET提供的一种线程管理机制,通
- java list 按照某个字段排序
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可以使用Collections.sort()方法对JavaList按照某个字段排序。假设有一个名为personList的List,其中的元素为Person对象,Person对象的某个字段为age,可以按照age字段来排序。第一种方法是通过实现Comparator接口来定义排序规则,然后使用Collections.sort()方法进行排序:publicclassPersonComparatorimp
- Harmony------应用程序框架
小码狼
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1.应该程序框架基础多Module设计机制模块化开发:一个应用多个功能,每个功能可作为一个模块,Module中可以包含源代码、资源文件、第三方库、配置文件等,每一个Module可以独立编译,实现特定的功能支持多设备:每个Module都会标注所支持的设备类型,可以根据需要组合Module类型ability类型的module:用于实现应用的功能和特性,每个ability类型的module编译后,会生成
- MYSQL数据备份与恢复(mysqldump)
一诚学编程
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MySQL备份之mysqldump表级别备份还原格式:mysqldump[OPTIONS]database[tables]实例:把db_user数据库中的tb_student数据表进行备份备份:#mysqldumpdb_usertb_student>/tmp/sqlbak/tb_student.sql-p还原:#mysql数据库名称/tmp/sqlbak/db_itheima.sql-p还原:#m
- 适配器模式(Adapter Pattern)详解:如何通过适配器解决接口不兼容的问题
江沉晚呤时
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在软件开发中,我们经常遇到不同系统或组件之间的接口不兼容的问题。如何将这些不兼容的接口进行整合,使得它们能够协同工作,成为一个常见的挑战。适配器模式(AdapterPattern)正是为了解决这个问题而设计的一种结构型设计模式。适配器模式通过提供一个中间层,将不兼容的接口适配成客户端需要的接口,从而让它们能够正常协作。本文将深入探讨适配器模式的概念、工作原理以及在C#中的实现,帮助开发者在实际项目
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- 测试工程师指南:基于需求文档构建本地安全知识库的完整实战
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需求文档是测试工程师日常工作的核心工具,如何快速检索需求文档中的关键信息(文本、表格、图片等),并将其转化为可供AI查询的知识库,是提升工作效率的重要手段。本文将通过对需求文档(docx格式)的处理,详细讲解如何构建一个安全的本地知识库,并通过代码实现具体操作,确保每一步都可落地。一、本地知识库的安全性与连接方案在构建本地知识库时,安全性是首要考虑的因素,尤其是对于需求文档这样的敏感数据。以下是本
- Vue+EasyExcel来操作文件上传下载
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Excel导入导出在管理一个系统时,总会有许多的数据,为了方便浏览查看数据,系统总会提供「导出Excel」的功能;有导出就有导入,在要向数据库中插入大量的数据时,我们向程序提供准备好的Excel,然后程序读取表格内容,并将数据添加到数据库中。实现这个「导入/导出Excel」的功能也不复杂,我们使用第三方的类库即可实现。比如:Apachepoi、JavaExcel(JXL)和阿里巴巴开源的Easye
- 西门子PLC转MQTT协议OPC协议网关应用案例
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BL102是一款采集西门子、三菱、欧姆龙、台达、AB、施耐德等各种PLC数据转换为ModbusTCP、OPCUA、MQTT、华为云IoT、亚马逊云IoT、阿里云IoT、金鸽云等协议的网关。BL102下行支持:西门子、三菱、欧姆龙、台达、AB、施耐德等各种PLC。BL102上行支持:ModbusTCP、MQTT、OPCUA、华为云IoT、阿里云IoT、AWSIoT、金鸽云等协议。BL102支持OPC
- 一次Linux下 .net 调试经历
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背景:Xt160Api,之前在windows下用.net调用,没有任何问题。但是移植到Linux去后,.net程序调用init(config_path)总是报错/root/test找不到traderApi.ini(/root/test是程序目录)然后退出程序解决过程:于是考虑是不是参数传错了,但是无论这个参数是什么,报错内容始终如此。甚至某些情况下,比如加了几句Console.WriteLIne(
- 每日一题之地宫取宝
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题目描述X国王有一个地宫宝库。是n×m个格子的矩阵。每个格子放一件宝贝。每个宝贝贴着价值标签。地宫的入口在左上角,出口在右下角。小明被带到地宫的入口,国王要求他只能向右或向下行走。走过某个格子时,如果那个格子中的宝贝价值比小明手中任意宝贝价值都大,小明就可以拿起它(当然,也可以不拿)。当小明走到出口时,如果他手中的宝贝恰好是k件,则这些宝贝就可以送给小明。请你帮小明算一算,在给定的局面下,他有多少
- github 上拉取,修改,增加分支及提交
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1.github中ssh配置1.1gitconfig--globaluser.name“你的名字”gitconfig--globaluser.email“你的邮箱”1.2生成id_rsa.pubssh-keygen-trsa-C"姓名/邮箱"1.3ssh配置将生成的id_rsa.pub中的内容拷贝到key中2.拉取项目gitclonegit@xxxx3.本地创建新分支gitcheckout-bxx
- JAVA中运算符要注意的地方
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本文章主要突出其与C语言的区别1.增量运算符+=-=*=%=1.a+=1.0a+=1.0;a=(int)(a+1.0);这两个等价而不是单纯的等价于a=a+1.02.a=a++publicstaticvoidmain(String[]args){inta=10;a=a++;System.out.println(a);}在上述代码中,a的结果是什么呢?是不是a=11?但其实不是的a=10其实这样赋值
- [Unity] GPU动画实现(一)——介绍
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当谈到戴森球计划的时候,我师兄说里面的动画都是一个叫GPU动画的东西来实现的,几乎一切图形功能名字扯到GPU的时候,通常都是高性能的体现,让我不禁好奇GPU动画是什么东西。定义首先什么是GPU动画,GPU动画是将动画的顶点信息记录下来,通过Shader在顶点着色器阶段重新设置顶点的位置,从而渲染出动画。因此GPU动画是典型的空间换时间的方案。实现步骤本系列主要目标是实现GPU动画,围绕这个目标要做
- Easyexcel操作文件
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常见问题汇总1.往文件里写数据时,如果没有对应的实体类时,需要创建一个List>来保存一行的数据privateMapconvertToMap(ResultSetrs){LinkedHashMaprow=newLinkedHashMap;for(inti=0;i>data=newArrayListrowData=newHashMap<>();rowData.put(0,"张三");rowData.p
- Markdig:强大的 .NET Markdown 解析器详解
江沉晚呤时
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在现代开发中,Markdown已经成为了一种广泛使用的轻量级标记语言,特别是在文档、博客和内容管理系统中,Markdown为开发者提供了快速、简洁的格式化文本方式。而在.NET生态中,Markdig是一款非常强大的Markdown解析器,它不仅支持标准的Markdown语法,还提供了许多扩展功能,让开发者能够灵活地定制Markdown文本的解析与渲染。本文将详细介绍Markdig的基本用法、扩展功
- 缓存:节省使用大模型的成本
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稍有经验的程序员对缓存都不陌生,在任何一个正式的工程项目上都少不了缓存的身影。硬件里面有缓存,软件里面也有缓存,缓存已经成了程序员的必修课。我们为什么要使用缓存呢?主要就是为了减少访问低速服务的次数,提高访问速度。大模型显然就是一个低速服务,甚至比普通的服务还要慢。为了改善大模型的使用体验,人们已经做出了一些努力,比如采用流式响应,提升第一个字出现在用户面前的速度。缓存,显然是另外一个可以解决大模
- pytorch中的DataLoader
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在PyTorch中,DataLoader是一个工具类,用于高效地加载数据并准备数据输入到模型中。它支持数据的批量加载、随机打乱、并行加载和迭代操作,是训练深度学习模型的关键组件之一。1.基本功能DataLoader的主要职责是从数据集中提取样本,并根据设置返回一个批次的数据。它与Dataset类结合使用:Dataset:定义数据集的来源、结构以及如何获取单个数据样本。DataLoader:负责从D
- linux系统命令——权限
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一、有哪些权限读(r)——对应数字4写(w)——对应数字2执行(x)——对应数字1二、权限及数字的对应4对应r--2对应-w-1对应--x5对应r-x6对应rw-7对应rwx三、文件的基本属性如图:①中如果是"一"表示文件类型为文件;如果是"d"表示文件类型是文件夹;如果是"l"表示文件类型为链接②表示文件属主(即谁创建的文件)的权限③中表示文件属主所属组(即文件属主所在的组)中的用户的权限④表示
- 机器学习中输入输出Tokens的概念详解
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随着深度学习技术的快速发展,大语言模型(LargeLanguageModels,LLMs)已经成为自然语言处理(NLP)领域的一个热点研究方向。这些模型不仅能够生成高质量的文本,还能在多种任务中展现出卓越的表现,比如机器翻译、问答系统、文本摘要等。在大语言模型的工作流程中,Tokens的概念扮演着至关重要的角色。本文将详细介绍大语言模型如何使用Tokens,以及如何计算Tokens的数量。什么是T
- 基于Gradio实现的增删改查(CRUD)模板系统设计方案
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基于Gradio实现的增删改查(CRUD)模板系统设计方案,结合了交互界面优化与数据持久化方案,支持本地JSON存储和动态界面更新:一、系统架构设计数据存储层采用JSON文件实现数据持久化(data.json)数据结构示例:{"items":[{"id":1,"name":"示例项目","category":"测试","status":"进行中"}]}界面交互层使用gr.Blocks实现多组件布局
- 【深度学习基础】第二十四课:softmax函数的导数
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深度学习基础深度学习人工智能
【深度学习基础】系列博客为学习Coursera上吴恩达深度学习课程所做的课程笔记。1.softmax函数softmax函数详解。2.softmax函数的导数假设神经网络输出层的激活函数为softmax函数,用以解决多分类问题。在反向传播时,就需要计算softmax函数的导数,这也就是本文着重介绍的内容。我们只需关注输出层即可,其余层和之前介绍的二分类模型一样,不再赘述。我们先考虑只有一个样本的情况
- Enum 枚举
120153216
enum枚举
原文地址:http://www.cnblogs.com/Kavlez/p/4268601.html Enumeration
于Java 1.5增加的enum type...enum type是由一组固定的常量组成的类型,比如四个季节、扑克花色。在出现enum type之前,通常用一组int常量表示枚举类型。比如这样:
public static final int APPLE_FUJI = 0
- Java8简明教程
bijian1013
javajdk1.8
Java 8已于2014年3月18日正式发布了,新版本带来了诸多改进,包括Lambda表达式、Streams、日期时间API等等。本文就带你领略Java 8的全新特性。
一.允许在接口中有默认方法实现
Java 8 允许我们使用default关键字,为接口声明添
- Oracle表维护 快速备份删除数据
cuisuqiang
oracle索引快速备份删除
我知道oracle表分区,不过那是数据库设计阶段的事情,目前是远水解不了近渴。
当前的数据库表,要求保留一个月数据,且表存在大量录入更新,不存在程序删除。
为了解决频繁查询和更新的瓶颈,我在oracle内根据需要创建了索引。但是随着数据量的增加,一个半月数据就要超千万,此时就算有索引,对高并发的查询和更新来说,让然有所拖累。
为了解决这个问题,我一般一个月会进行一次数据库维护,主要工作就是备
- java多态内存分析
麦田的设计者
java内存分析多态原理接口和抽象类
“ 时针如果可以回头,熟悉那张脸,重温嬉戏这乐园,墙壁的松脱涂鸦已经褪色才明白存在的价值归于记忆。街角小店尚存在吗?这大时代会不会牵挂,过去现在花开怎么会等待。
但有种意外不管痛不痛都有伤害,光阴远远离开,那笑声徘徊与脑海。但这一秒可笑不再可爱,当天心
- Xshell实现Windows上传文件到Linux主机
被触发
windows
经常有这样的需求,我们在Windows下载的软件包,如何上传到远程Linux主机上?还有如何从Linux主机下载软件包到Windows下;之前我的做法现在看来好笨好繁琐,不过也达到了目的,笨人有本方法嘛;
我是怎么操作的:
1、打开一台本地Linux虚拟机,使用mount 挂载Windows的共享文件夹到Linux上,然后拷贝数据到Linux虚拟机里面;(经常第一步都不顺利,无法挂载Windo
- 类的加载ClassLoader
肆无忌惮_
ClassLoader
类加载器ClassLoader是用来将java的类加载到虚拟机中,类加载器负责读取class字节文件到内存中,并将它转为Class的对象(类对象),通过此实例的 newInstance()方法就可以创建出该类的一个对象。
其中重要的方法为findClass(String name)。
如何写一个自己的类加载器呢?
首先写一个便于测试的类Student
- html5写的玫瑰花
知了ing
html5
<html>
<head>
<title>I Love You!</title>
<meta charset="utf-8" />
</head>
<body>
<canvas id="c"></canvas>
- google的ConcurrentLinkedHashmap源代码解析
矮蛋蛋
LRU
原文地址:
http://janeky.iteye.com/blog/1534352
简述
ConcurrentLinkedHashMap 是google团队提供的一个容器。它有什么用呢?其实它本身是对
ConcurrentHashMap的封装,可以用来实现一个基于LRU策略的缓存。详细介绍可以参见
http://code.google.com/p/concurrentlinke
- webservice获取访问服务的ip地址
alleni123
webservice
1. 首先注入javax.xml.ws.WebServiceContext,
@Resource
private WebServiceContext context;
2. 在方法中获取交换请求的对象。
javax.xml.ws.handler.MessageContext mc=context.getMessageContext();
com.sun.net.http
- 菜鸟的java基础提升之道——————>是否值得拥有
百合不是茶
1,c++,java是面向对象编程的语言,将万事万物都看成是对象;java做一件事情关注的是人物,java是c++继承过来的,java没有直接更改地址的权限但是可以通过引用来传值操作地址,java也没有c++中繁琐的操作,java以其优越的可移植型,平台的安全型,高效性赢得了广泛的认同,全世界越来越多的人去学习java,我也是其中的一员
java组成:
- 通过修改Linux服务自动启动指定应用程序
bijian1013
linux
Linux中修改系统服务的命令是chkconfig (check config),命令的详细解释如下: chkconfig
功能说明:检查,设置系统的各种服务。
语 法:chkconfig [ -- add][ -- del][ -- list][系统服务] 或 chkconfig [ -- level <</SPAN>
- spring拦截器的一个简单实例
bijian1013
javaspring拦截器Interceptor
Purview接口
package aop;
public interface Purview {
void checkLogin();
}
Purview接口的实现类PurviesImpl.java
package aop;
public class PurviewImpl implements Purview {
public void check
- [Velocity二]自定义Velocity指令
bit1129
velocity
什么是Velocity指令
在Velocity中,#set,#if, #foreach, #elseif, #parse等,以#开头的称之为指令,Velocity内置的这些指令可以用来做赋值,条件判断,循环控制等脚本语言必备的逻辑控制等语句,Velocity的指令是可扩展的,即用户可以根据实际的需要自定义Velocity指令
自定义指令(Directive)的一般步骤
&nbs
- 【Hive十】Programming Hive学习笔记
bit1129
programming
第二章 Getting Started
1.Hive最大的局限性是什么?一是不支持行级别的增删改(insert, delete, update)二是查询性能非常差(基于Hadoop MapReduce),不适合延迟小的交互式任务三是不支持事务2. Hive MetaStore是干什么的?Hive persists table schemas and other system metadata.
- nginx有选择性进行限制
ronin47
nginx 动静 限制
http {
limit_conn_zone $binary_remote_addr zone=addr:10m;
limit_req_zone $binary_remote_addr zone=one:10m rate=5r/s;...
server {...
location ~.*\.(gif|png|css|js|icon)$ {
- java-4.-在二元树中找出和为某一值的所有路径 .
bylijinnan
java
/*
* 0.use a TwoWayLinkedList to store the path.when the node can't be path,you should/can delete it.
* 1.curSum==exceptedSum:if the lastNode is TreeNode,printPath();delete the node otherwise
- Netty学习笔记
bylijinnan
javanetty
本文是阅读以下两篇文章时:
http://seeallhearall.blogspot.com/2012/05/netty-tutorial-part-1-introduction-to.html
http://seeallhearall.blogspot.com/2012/06/netty-tutorial-part-15-on-channel.html
我的一些笔记
===
- js获取项目路径
cngolon
js
//js获取项目根路径,如: http://localhost:8083/uimcardprj
function getRootPath(){
//获取当前网址,如: http://localhost:8083/uimcardprj/share/meun.jsp
var curWwwPath=window.document.locati
- oracle 的性能优化
cuishikuan
oracleSQL Server
在网上搜索了一些Oracle性能优化的文章,为了更加深层次的巩固[边写边记],也为了可以随时查看,所以发表这篇文章。
1.ORACLE采用自下而上的顺序解析WHERE子句,根据这个原理,表之间的连接必须写在其他WHERE条件之前,那些可以过滤掉最大数量记录的条件必须写在WHERE子句的末尾。(这点本人曾经做过实例验证过,的确如此哦!
- Shell变量和数组使用详解
daizj
linuxshell变量数组
Shell 变量
定义变量时,变量名不加美元符号($,PHP语言中变量需要),如:
your_name="w3cschool.cc"
注意,变量名和等号之间不能有空格,这可能和你熟悉的所有编程语言都不一样。同时,变量名的命名须遵循如下规则:
首个字符必须为字母(a-z,A-Z)。
中间不能有空格,可以使用下划线(_)。
不能使用标点符号。
不能使用ba
- 编程中的一些概念,KISS、DRY、MVC、OOP、REST
dcj3sjt126com
REST
KISS、DRY、MVC、OOP、REST (1)KISS是指Keep It Simple,Stupid(摘自wikipedia),指设计时要坚持简约原则,避免不必要的复杂化。 (2)DRY是指Don't Repeat Yourself(摘自wikipedia),特指在程序设计以及计算中避免重复代码,因为这样会降低灵活性、简洁性,并且可能导致代码之间的矛盾。 (3)OOP 即Object-Orie
- [Android]设置Activity为全屏显示的两种方法
dcj3sjt126com
Activity
1. 方法1:AndroidManifest.xml 里,Activity的 android:theme 指定为" @android:style/Theme.NoTitleBar.Fullscreen" 示例: <application
- solrcloud 部署方式比较
eksliang
solrCloud
solrcloud 的部署其实有两种方式可选,那么我们在实践开发中应该怎样选择呢? 第一种:当启动solr服务器时,内嵌的启动一个Zookeeper服务器,然后将这些内嵌的Zookeeper服务器组成一个集群。 第二种:将Zookeeper服务器独立的配置一个集群,然后将solr交给Zookeeper进行管理
谈谈第一种:每启动一个solr服务器就内嵌的启动一个Zoo
- Java synchronized关键字详解
gqdy365
synchronized
转载自:http://www.cnblogs.com/mengdd/archive/2013/02/16/2913806.html
多线程的同步机制对资源进行加锁,使得在同一个时间,只有一个线程可以进行操作,同步用以解决多个线程同时访问时可能出现的问题。
同步机制可以使用synchronized关键字实现。
当synchronized关键字修饰一个方法的时候,该方法叫做同步方法。
当s
- js实现登录时记住用户名
hw1287789687
记住我记住密码cookie记住用户名记住账号
在页面中如何获取cookie值呢?
如果是JSP的话,可以通过servlet的对象request 获取cookie,可以
参考:http://hw1287789687.iteye.com/blog/2050040
如果要求登录页面是html呢?html页面中如何获取cookie呢?
直接上代码了
页面:loginInput.html
代码:
<!DOCTYPE html PUB
- 开发者必备的 Chrome 扩展
justjavac
chrome
Firebug:不用多介绍了吧https://chrome.google.com/webstore/detail/bmagokdooijbeehmkpknfglimnifench
ChromeSnifferPlus:Chrome 探测器,可以探测正在使用的开源软件或者 js 类库https://chrome.google.com/webstore/detail/chrome-sniffer-pl
- 算法机试题
李亚飞
java算法机试题
在面试机试时,遇到一个算法题,当时没能写出来,最后是同学帮忙解决的。
这道题大致意思是:输入一个数,比如4,。这时会输出:
&n
- 正确配置Linux系统ulimit值
字符串
ulimit
在Linux下面部 署应用的时候,有时候会遇上Socket/File: Can’t open so many files的问题;这个值也会影响服务器的最大并发数,其实Linux是有文件句柄限制的,而且Linux默认不是很高,一般都是1024,生产服务器用 其实很容易就达到这个数量。下面说的是,如何通过正解配置来改正这个系统默认值。因为这个问题是我配置Nginx+php5时遇到了,所以我将这篇归纳进
- hibernate调用返回游标的存储过程
Supanccy2013
javaDAOoracleHibernatejdbc
注:原创作品,转载请注明出处。
上篇博文介绍的是hibernate调用返回单值的存储过程,本片博文说的是hibernate调用返回游标的存储过程。
此此扁博文的存储过程的功能相当于是jdbc调用select 的作用。
1,创建oracle中的包,并在该包中创建的游标类型。
---创建oracle的程
- Spring 4.2新特性-更简单的Application Event
wiselyman
application
1.1 Application Event
Spring 4.1的写法请参考10点睛Spring4.1-Application Event
请对比10点睛Spring4.1-Application Event
使用一个@EventListener取代了实现ApplicationListener接口,使耦合度降低;
1.2 示例
包依赖
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