本文转载自:https://ouxinyu.github.io/Blogs/20140723001.html
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特别感谢在学习和使用Caffe和CNN的过程中,超级大神Yanqing Jia, Eric Tzeng, Evan Shelhamer, Ross Girshick, Sergey Karayev,Sergio Gadarrama给予的帮助。
特别说明:
0. Caffe 官网地址:http://caffe.berkeleyvision.org/
1. 本文为作者亲自实验完成,但仅限用于学术交流使用,使用本指南造成的任何不良后果由使用者自行承担,与本博主无关,谢谢!
2. 本文旨在为新手提供一个参考,请高手勿要吐槽,有暴力倾向者,请绕道,谢谢!
3. 本文使用2014年11月16日下载版本完成,已包含NVidia cuDNN组件的配置。
4. 最后更新时间:2014年11月16日。本次更新删除了大多数口水话,并调整了章节顺序,默认同时支持Python接口和Matlab接口。软件中已经修正的问题,本文不再累赘叙述,因此尽量下载最新版的Caffe源程序。
洋洋洒洒一大篇,就没截图了,经过几个月的使用,使用Caffe还是建议在Ubuntu系统下完成,因为不需要太多的编程,Windows版需要一定的编程基础,且因为没有官方Release版,所以更新和FixBug都麻烦一些.这里有个建议是,如果将来要做大数据集,最好事先给Linux留多点空间,比如Imagenet,估计500G都不为过。不过也可以全部使用软链接链接到Windows的NTFS磁盘,我后期实验都是使用这个方法。另外,请阅读完,至少一个部分再进行动手操作,避免多余的工作,写作能力有限,尽请见谅。
这篇安装指南,适合零基础,新手操作,请高手勿要吐槽!
简单介绍一下:Caffe,一种ConvolutionalNeural Network的工具包,和Alex的cuda-convnet功能类似,但各有特点。都是使用C++ CUDA进行底层编辑,Python进行实现,原作主要部署于Ubuntu,也有大神发布了Windows版,但其他相关资料较少,不适合新手使用,所以还是Ubuntu的比较适合新手。(相对而言)
本文主要包含5个部分,包括:
o 第一部分 Linux安装
o 第二部分 nVidia驱动和CUDA Toolkit的安装和调试(*.run方法)
o 第二部分 nVidia驱动和CUDA Toolkit的安装和调试(*.deb方法,特别推荐)
o 第三部分 Python安装和调试
o 第四部分 Matlab安装和调试
o 第五部分 Caffe的安装和测试
第一部分 Linux安装
Linux的安装,如果不是Linux粉,只是必须,被迫要用它来作作科研什么的,建议安装成双系统,网上方法很多,这里我就不详细写了,安装还算是傻瓜式的,和windows的过程类似,至于语言,如果觉得难度还不够大的话,完全可以装E文版的,甚至日文,德文~~~,我是装的简体中文版,我总共用分出的500G的空间来安装Ubuntu 14.04,这个版本是最新的版本,有个好处是,可以直接访问Windows8.1的NTFS分区,不用做额外的操作,而且支持中文,例如:$ cd /media/yourname/分区名字/文件夹名,当然GUI就更方便了.
我的分区设置如下:
根分区: \ 100G,
Swap交换分区:16G,这里,我设置和我的内存一样,据说小于16G的内存,就设置成内存的1.5-2倍
boot分区:200M
Home分区:剩余的空间,鉴于Imagenet,PASCAL VOC之类的大客户,建议500G,至少300G以上。
PS:解决启动分区错误
基本上,重装起来,都会破坏原来的启动分区表,还原Windows分区的一个简单办法:
$ sudo gedit etc/default/grub
设置:GRUB_DEFAULT = 2
$ sudo update-grub
该方法适用于安装双系统后,"看得到Linux,看不到Windows”的情况,反过来的话,请大家自己百度吧。
第二部分:nVidia驱动和CUDA Toolkit的安装和调试
PS:这里其实可以参考nVidia官方提供的CUDA安装手册,非常相近,32页的,不过是全英文的,我就是参考这个文档完成后面的配置和验证工作。https://developer.nvidia.com/rdp/cuda-65-rc-toolkit-download#linux。一般要输入你的用户名和密码,就是下载6.5的那个账号。
一、Verify You Have a CUDA-Capable GPU
执行下面的操作,然后验证硬件支持GPU CUDA,只要型号存在于https://developer.nvidia.com/cuda-gpus,就没问题了
$ lspci | grep -i nvidia
二、Verify You Have a Supported Version of Linux
$ uname -m && cat /etc/*release
重点是“x86_64”这一项,保证是x86架构,64bit系统
三、Verify the System Has gcc Installed
$ gcc --version
没有的话就先安装吧,这个是必须的用来编译CUDA Toolkit,不过Ubuntu 14.04是默认有的
四、Download the NVIDIA CUDA Toolkit
下载地址:https://developer.nvidia.com/cuda-toolkit
验证地址:https://developer.nvidia.com/rdp/cuda-rc-checksums
$ md5sum filename
例如:md5sum cuda_6.5.11_rc_linux_64.run,这个文件的正确 md5 = a47b0be83dea0323fab24ca642346351
这个感觉蛮重要,我第一次安装的时候md5就没通过,强制安装,结果就有问题,后面重新下载了再安装了一次
五、Handle Conflicting Installation Methods
根据官网介绍,之前安装的版本都会有冲突的嫌疑
所以,之前安装的Toolkit和Drievers就得卸载,屏蔽,等等
六、Graphical Interface Shutdown
退出GUI,也就是X-Win界面,操作方法是:同时按:CTRL+ALT+F1(F2-F6),切换到TTY1-6命令行模式。
关闭桌面服务:
$ sudo stop lightdm
七、Interaction with Nouveau
Nouveau是一个开源的显卡驱动,Ubuntu 14.04默认安装了,但是它会影响nVidia驱动的安装,所以只有请他回老家了,sorry!
$ sudo vi/etc/modprobe.d/nvidia-graphics-drivers.conf
写入:blacklist nouveau
保存并退出: wq!
检查:$ cat nvidia-graphics-drivers.conf
$ sudo vi /etc/default/grub
末尾写入:rdblacklist=nouveau nouveau.modeset=0
保存并退出: wq!
检查:$ cat /etc/default/grub
八、Installation CUDA 6.5
切换到cuda_6.5.11_rc_linux_64.run所在的目录,然后执行安装命令:
$ sudo sh cuda_6.5.11_rc_linux_64.run
再次提醒,安装前一定要执行 md5sum,至于如果发现md5检测不一致,怎么办?别逗了,去nVidia重新下载就行了,地球人都知道,别无限循环就好^_^!
这里会一路问你各种问题,基本上就是Accept-yes-Enter-yes-Enter-yes-Enter,其实就是让你接受协议,然后安装的默认位置确认等等,recruit就别自定义安装位置了,默认才是天堂。
九、Extra Libraries
安装一些必要的库文件,譬如:OpenGL (e.g., Mesa), GLU, GLUT, and X11 (including Xi, Xmu, and GLX).
$ sudo apt-get install freeglut3-devbuild-essential libx11-dev libxmu-dev libxi-dev libgl1-mesa-glx libglu1-mesalibglu1-mesa-dev
十、驱动装完了,可以回到GUI界面了,也可以继续留这里玩文本。。。
$ sudo start lightdm
十一、POST-INSTALLATION ACTIONS
1. Environment Setup
$ export PATH=/usr/local/cuda-6.5/bin:$PATH
$ exportLD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-6.5/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
PS:如果出现安装失败,重启系统,重新安装一遍基本都可以解决,实在不行就卸载原来的驱动再安装一遍。
a. 卸载现有驱动
$ sudo nvidia-installer --uninstall
b. 重装CUDA Toolkit
$ sudo sh cuda_6.5.11_rc_linux_64.run
好了,到这里所有nVidia CUDA的安装就结束了,下面看看Caffe如何安装
第二部分:nVidia驱动和CUDA Toolkit的安装和调试(*.deb方法)
PS:特别推荐*.deb的方法,目前已提供离线版的deb文件,该方法比较简单,不需要切换到tty模式。这里以CUDA 7.0为例。
一、CUDA Repository
获取CUDA安装包,安装包请自行去NVidia官网下载。
$ sudo dpkg -icuda-repo-ubuntu1410-7-0-local_7.0-28_amd64.deb
$ sudo apt-get update
二、CUDA Toolkit
$ sudo apt-get install -y cuda
三、Environment Variables
$ export CUDA_HOME=/usr/local/cuda-7.0
$ export LD_LIBRARY_PATH=${CUDA_HOME}/lib64
$ PATH=${CUDA_HOME}/bin:${PATH}
$ export PATH
第三部分 Python安装和调试
1. 安装IDE运行环境
选择一个适合你的IDE运行环境,我是用的是Spyder,因为它内置了 iPython环境,Caffe有不少的程序是基于 iPython环境完成的。安装方法很简单,直接在Ubuntu软件中心搜索“spyder”即可安装。
2. 配置和编译pycaffe(见第五部分)
第四部分 Matlab安装和调试
1.下载
由于该软件为商业软件,请大家自行寻找,安装学习,并确保不使用做商业目的,下载24小时删除......
2. 预准备
选择Mathworks.Matlab.R2014a.Unix.iso -右键 -使用磁盘映像挂载器打开”
进入装载的虚拟光盘,拷贝全部文件至home/Matlab文件夹
(PS:我的原则是能GUI就GUI,喜欢CMD的可以参照执行)
复制Crack/install.jar至 home/Matlab/java/jar/并覆盖源文件
$ sudo cp install.jar/home/Matlab/java/jar/
3. 授权安装文件夹
$ chmod a+x Matlab -R
4. 安装
$ sudo ./install
选项:不使用Internet安装
序列号: 29797-39064-48306-32452
默认路径:/usr/local/MATLAB/R2014b
激活文件:license.lic
拷贝 libmwservices.so至 /usr/local/MATLAB/R2014b/bin/glnxa64
$ sudo cp libmwservices.so/usr/local/MATLAB/R2014b/bin/glnxa64/
安装完毕,程序默认启动路径:
/usr/local/MATLAB/R2014b/bin/matlab
这里有个问题:
5.解决编译器gcc/g++版本问题。(这里因为折腾了一会,所以只做参考,基本流程就2步,有问题,大家可以自己尝试。)
因为Ubuntu 15.04的gcc/g++版本是4.9.2,而Matlab 2014a(2015a)的版本是4.7.x所以在使用matla调用mex文件的时候,基本上都会报错,根据报错信息,考虑如下两步解决方案。
1. 降级安装gcc/g++版本为4.7.x
(1). 下载gcc/g++ 4.7.x
(2). 链接gcc/g++实现降级
2. 暴力引用新版本GLIBCXX_3.4.17
通过命令“strings /usr/local/MATLAB/R2014a/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX_” 可以看一下,是否已经成功包含了GLIBCXX_3.4.17,如果已经存在,基本上就成功了。
6.编译Matlab用到的caffe文件(见第五部分)
第五部分 Caffe的安装和测试
对于Caffe的安装严格遵照官网的要求来:http://caffe.berkeleyvision.org/installation.html
一、安装BLAS
这里可以选择(ATLAS,MKL或者OpenBLAS),我这里使用MKL,首先下载并安装英特尔®数学内核库 Linux*版MKL,下载链接是:https://software.intel.com/en-us/intel-education-offerings,请下载Student版,先申请,然后会立马收到一个邮件(里面有安装序列号),打开照着下载就行了。下载完之后,要把文件解压到home文件夹(或直接把tar.gz文件拷贝到home文件夹,为了节省空间,安装完记得把压缩文件给删除喔~),或者其他的ext4的文件系统中。
接下来是安装过程,先授权,然后安装:
$ tar zxvfcpp_studio_xe_2013_sp1_update3.tar.gz(如果你是直接拷贝压缩文件过来的)
$ chmod a+x/home/username/cpp_studio_xe_2013_sp1_update3 -R
$ sudo ./install_GUI.sh
二、MKL与CUDA的环境设置
1. 新建intel_mkl.conf,并编辑之:
$ sudo gedit /etc/ld.so.conf.d/intel_mkl.conf
/opt/intel/lib/intel64
/opt/intel/mkl/lib/intel64
2. 新建cuda.conf,并编辑之:
$ sudo gedit /etc/ld.so.conf.d/cuda.conf
/usr/local/cuda/lib64
/lib
3. 完成lib文件的链接操作,执行:
$ sudo ldconfig -v
三、安装OpenCV 3.0
下载官网原版OpenCV:http://opencv.org/,自己编译,具体方法参考我前面的文章。
四、安装其他依赖项
1. Google Logging Library(glog),下载地址:https://code.google.com/p/google-glog/,然后解压安装:
$ tar zxvf glog-0.3.3.tar.gz
$ ./configure
$ make
$ sudo make install
如果没有权限就chmod a+x glog-0.3.3 -R ,或者索性 chmod 777 glog-0.3.3 -R ,装完之后,这个文件夹就可以kill了。
2. 其他依赖项,确保都成功
$ sudo apt-get install libprotobuf-devlibleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libboost-all-dev libhdf5-serial-dev
$ sudo apt-get install libgflags-devlibgoogle-glog-dev liblmdb-dev protobuf-compiler
五、安装Caffe并测试
1. 安装pycaffe必须的一些依赖项:
$ sudo apt-get install python-numpypython-scipy python-matplotlib python-sklearn python-skimage python-h5pypython-protobuf python-leveldb python-networkx python-nose python-pandaspython-gflags Cython ipython
$ sudo apt-get install protobuf-c-compilerprotobuf-compiler
2. 切换到Caffe的下载文件夹,然后执行:
$ cp Makefile.config.exampleMakefile.config
修改新生成的Makefile.config文件,修改“BLAS := mkl”,这个非常重要。
3. 配置路径,实现caffe对Python和Matlab接口的支持,编辑Makefile.config:
PYTHON_LIB := /usr/local/lib
MATLAB_DIR := /usr/local/MATLAB/R2014b
4. 这里非常重要的是,为了确保支持Caffe Notebook里的程序,需要使用到IDE环境,并且支持iPython接口。
5. 安装配置nVidia cuDNN加速Caffe模型运算
a. 编辑确保Makefile.config,启用GPU “# CPU_ONLY := 1”,并设置 “USE_CUDNN := 1”。
b. 安装cuDNN
cuDNN 介绍和下载地址:cuDNNIntrodution and Download(下载在最下面,需要注册)
$ sudo cp cudnn.h /usr/local/include
$ sudo cp libcudnn.so /usr/local/lib
$ sudo cp libcudnn.so.6.5 /usr/local/lib
$ sudo cp libcudnn.so.6.5.18 /usr/local/lib
c. 链接cuDNN的库文件
$ sudo ln -sf/usr/local/lib/libcudnn.so.6.5.18 /usr/local/lib/libcudnn.so.6.5
$ sudo ldconfig -v
6. 编译caffe-master!!!"-j8"是使用CPU的多核进行编译,可以极大地加速编译的速度,建议使用。
$ make all -j2
$ make test -j2
$ make runtest -j2
编译Python和Matlab用到的caffe文件
$ make pycaffe -j2
$ make matcaffe -j2
六、使用MNIST数据集进行测试
Caffe默认情况会安装在$CAFFE_ROOT,就是解压到那个目录,例如:$home/username/caffe-master,所以下面的工作,默认已经切换到了该工作目录。下面的工作主要是,用于测试Caffe是否工作正常,不做详细评估。具体设置请参考官网:http://caffe.berkeleyvision.org/gathered/examples/mnist.html
1. 数据预处理
$ sh data/mnist/get_mnist.sh
2. 重建lmdb/leveldb文件。Caffe支持三种数据格式输入网络,包括Image(.jpg, .png等),leveldb,lmdb,根据自己需要选择不同输入吧。
$ sh examples/mnist/create_mnist.sh
生成mnist-train-lmdb和 mnist-train-lmdb文件夹,这里包含了lmdb格式的数据集
3. 训练mnist
$ sh examples/mnist/train_lenet.sh
至此,Caffe安装的所有步骤完结,下面是一组简单的数据对比,实验来源于MNIST数据集,主要是考察一下不同系统下CPU和GPU的性能。可以看到明显的差别了,虽然MNIST数据集很简单,相信复杂得数据集,差别会更大,Ubuntu+GPU是唯一的选择了。
测试平台:i7-4770K/16G/GTX 770/CUDA 6.5
MNIST Windows8.1 on CPU:620s
MNIST Windows8.1 on GPU:190s
MNIST Ubuntu 14.04 on CPU:270s
MNIST Ubuntu 14.04 on GPU:160s
MNIST Ubuntu 14.04 on GPU with cuDNN:32s
Cifar10_full on GPU wihtout cuDNN:73m45s = 4428s (Iteration 70000)
Cifar10_full on GPU with cuDNN:20m7s = 1207s (Iteration 70000)
对比测试1:2*E5-2620(12CPUs)/128G/TeslaK20M/CUDA5.5/CentOS 6.4
MNIST CentOS 6.4 on GPU:294s
对比测试2:Tesla K40M/CUDA6.5/ubuntu 14.04
MNIST on GPU with cuDNN:30s
对比测试3:GTX 660/CUDA6.5/ubuntu 14.04
MNIST on GPU with cuDNN:49s
对比试验1是一个不太公平的测试,毕竟性能差很大,很可能不单单是由Tesla K20s和GTX 770带来的,也可能是因为CentOS或者是CUDA5.5的影响,但总体上的结论和Caffe官网的 reference performancenumbers 一致,对于普通用户:GTX的性价比高很多。对比试验2展现了Tesla K40的强大性能,相信对于复杂图像,它应该有更强劲的表现。(感谢香港城市大学 Ph.D Jingjing、南京理工大学 Ph.D JinLu、华中科技大学 MS LiuMaolin 提供的测试环境和测试数据。)