在本篇文章中,我们将介绍回归树及其基本数学原理,并从头开始使用Python实现一个完整的回归树模型。
为了简单起见这里将使用递归来创建树节点,虽然递归不是一个完美的实现,但是对于解释原理他是最直观的。
首先导入库
import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt
首先需要创建训练数据,我们的数据将具有独立变量(x)和一个相关的变量(y),并使用numpy在相关值中添加高斯噪声,可以用数学表达为
这里的 是噪声。代码如下所示。
def f(x): mu, sigma = 0, 1.5 return -x**2 + x + 5 + np.random.normal(mu, sigma, 1) num_points = 300 np.random.seed(1) x = np.random.uniform(-2, 5, num_points) y = np.array( [f(i) for i in x] ) plt.scatter(x, y, s = 5)
回归树
在回归树中是通过创建一个多个节点的树来预测数值数据的。下图展示了一个回归树的树结构示例,其中每个节点都有其用于划分数据的阈值。
给定一组数据,输入值将通过相应的规格达到叶子节点。达到节点M的所有输入值可以用X的子集表示。从数学上讲,让我们用一个函数表达此情况,如果给定的输入值达到节点M,则可以给出1个,否则为0。
找到分裂数据的阈值:通过在每个步骤中选择2个连续点并计算其平均值来迭代训练数据。计算的平均值将数据分为两个的阈值。
首先让我们考虑随机阈值以演示任何给定的情况。
threshold = 1.5 low = np.take(y, np.where(x < threshold)) high = np.take(y, np.where(x > threshold)) plt.scatter(x, y, s = 5, label = 'Data') plt.plot([threshold]*2, [-16, 10], 'b--', label = 'Threshold line') plt.plot([-2, threshold], [low.mean()]*2, 'r--', label = 'Left child prediction line') plt.plot([threshold, 5], [high.mean()]*2, 'r--', label = 'Right child prediction line') plt.plot([-2, 5], [y.mean()]*2, 'g--', label = 'Node prediction line') plt.legend()
蓝色垂直线表示单个阈值,我们假设它是任意两点的均值,并稍后将其用于划分数据。
我们对这个问题的第一个预测是所有训练数据(y轴)的平均值(绿色水平线)。而两条红线是要创建的子节点的预测。
很明显这些平均值都不能很好地代表我们的数据,但它们的差异也是很明显的:主节点预测(绿线)得到所有训练数据的均值,我们将其分为2个子节点,这2个子节点有自己的预测(红线)。与绿线相比这2个子节点更好地代表了它们对应的训练数据。回归树就是将不断地将数据分成2个部分——从每个节点创建2个子节点,直到达到给定的停止值(这是一个节点所能拥有的最小数据量)。它会提前停止树的构建过程,我们将其称为预修剪树。
为什么会有早停的机制?如果我们要继续进行分配直到节点只有一个值是,这创建一个过度拟合的方案,每个训练数据都只能预测自己。
说明:当模型完成时,它不会使用根节点或任何中间节点来预测任何值;它将使用回归树的叶子(这将是树的最后一个节点)进行预测。
为了得到最能代表给定阈值数据的阈值,我们使用残差平方和。它可以在数学上定义为
让我们看看这一步是如何工作的。
既然计算了阈值的SSR值,那么可以采用具有最小SSR值的阈值。使用该阈值将训练数据分为两个(低和高部分),其中其中低部分将用于创建左子节点,高部分将用于创建右子节点。
def SSR(r, y): return np.sum( (r - y)**2 ) SSRs, thresholds = [], [] for i in range(len(x) - 1): threshold = x[i:i+2].mean() low = np.take(y, np.where(x < threshold)) high = np.take(y, np.where(x > threshold)) guess_low = low.mean() guess_high = high.mean() SSRs.append(SSR(low, guess_low) + SSR(high, guess_high)) thresholds.append(threshold) print('Minimum residual is: {:.2f}'.format(min(SSRs))) print('Corresponding threshold value is: {:.4f}'.format(thresholds[SSRs.index(min(SSRs))]))
在进入下一步之前,我将使用pandas创建一个df,并创建一个用于寻找最佳阈值的方法。所有这些步骤都可以在没有pandas的情况下完成,这里使用他是因为比较方便。
df = pd.DataFrame(zip(x, y.squeeze()), columns = ['x', 'y']) def find_threshold(df, plot = False): SSRs, thresholds = [], [] for i in range(len(df) - 1): threshold = df.x[i:i+2].mean() low = df[(df.x <= threshold)] high = df[(df.x > threshold)] guess_low = low.y.mean() guess_high = high.y.mean() SSRs.append(SSR(low.y.to_numpy(), guess_low) + SSR(high.y.to_numpy(), guess_high)) thresholds.append(threshold) if plot: plt.scatter(thresholds, SSRs, s = 3) plt.show() return thresholds[SSRs.index(min(SSRs))]
创建子节点
在将数据分成两个部分后就可以为低值和高值找到单独的阈值。需要注意的是这里要增加一个停止条件;因为对于每个节点,属于该节点的数据集中的点会变少,所以我们为每个节点定义了最小数据点数量。如果不这样做,每个节点将只使用一个训练值进行预测,会导致过拟合。
可以递归地创建节点,我们定义了一个名为TreeNode的类,它将存储节点应该存储的每一个值。使用这个类我们首先创建根,同时计算它的阈值和预测值。然后递归地创建它的子节点,其中每个子节点类都存储在父类的left或right属性中。
在下面的create_nodes方法中,首先将给定的df分成两部分。然后检查是否有足够的数据单独创建左右节点。如果(对于其中任何一个)有足够的数据点,我们计算阈值并使用它创建一个子节点,用这个新节点作为树再次调用create_nodes方法。
class TreeNode(): def __init__(self, threshold, pred): self.threshold = threshold self.pred = pred self.left = None self.right = None def create_nodes(tree, df, stop): low = df[df.x <= tree.threshold] high = df[df.x > tree.threshold] if len(low) > stop: threshold = find_threshold(low) tree.left = TreeNode(threshold, low.y.mean()) create_nodes(tree.left, low, stop) if len(high) > stop: threshold = find_threshold(high) tree.right = TreeNode(threshold, high.y.mean()) create_nodes(tree.right, high, stop) threshold = find_threshold(df) tree = TreeNode(threshold, df.y.mean()) create_nodes(tree, df, 5)
这个方法在第一棵树上进行了修改,因为它不需要返回任何东西。虽然递归函数通常不是这样写的(不返回),但因为不需要返回值,所以当没有激活if语句时,不做任何操作。
在完成后可以检查此树结构,查看它是否创建了一些可以拟合数据的节点。这里将手动选择第一个节点及其对根阈值的预测。
plt.scatter(x, y, s = 0.5, label = 'Data') plt.plot([tree.threshold]*2, [-16, 10], 'r--', label = 'Root threshold') plt.plot([tree.right.threshold]*2, [-16, 10], 'g--', label = 'Right node threshold') plt.plot([tree.threshold, tree.right.threshold], [tree.right.left.pred]*2, 'g', label = 'Right node prediction') plt.plot([tree.left.threshold]*2, [-16, 10], 'm--', label = 'Left node threshold') plt.plot([tree.left.threshold, tree.threshold], [tree.left.right.pred]*2, 'm', label = 'Left node prediction') plt.plot([tree.left.left.threshold]*2, [-16, 10], 'k--', label = 'Second Left node threshold') plt.legend()
这里看到了两个预测:
第一个左节点对高值的预测(高于其阈值)
第一个右节点对低值(低于其阈值)的预测
这里我手动剪切了预测线的宽度,因为如果给定的x值达到了这些节点中的任何一个,则将以属于该节点的所有x值的平均值表示,这也意味着没有其他x值参与 在该节点的预测中(希望有意义)。
这种树形结构远不止两个节点那么简单,所以我们可以通过如下调用它的子节点来检查一个特定的叶子节点。
tree.left.right.left.left
这当然意味着这里有一个向下4个子结点长的分支,但它可以在树的另一个分支上深入得多。
预测
我们可以创建一个预测方法来预测任何给定的值。
def predict(x): curr_node = tree result = None while True: if x <= curr_node.threshold: if curr_node.left: curr_node = curr_node.left else: break elif x > curr_node.threshold: if curr_node.right: curr_node = curr_node.right else: break return curr_node.pred
预测方法做的是沿着树向下,通过比较我们的输入和每个叶子的阈值。如果输入值大于阈值,则转到右叶,如果小于阈值,则转到左叶,以此类推,直到到达任何底部叶子节点。然后使用该节点自身的预测值进行预测,并与其阈值进行最后的比较。
使用x = 3进行测试(在创建数据时,可以使用上面所写的函数计算实际值。-3**2+3+5 = -1,这是期望值),我们得到:
predict(3) # -1.23741
计算误差
这里用相对平方误差验证数据
def RSE(y, g): return sum(np.square(y - g)) / sum(np.square(y - 1 / len(y)*sum(y))) x_val = np.random.uniform(-2, 5, 50) y_val = np.array( [f(i) for i in x_val] ).squeeze() tr_preds = np.array( [predict(i) for i in df.x] ) val_preds = np.array( [predict(i) for i in x_val] ) print('Training error: {:.4f}'.format(RSE(df.y, tr_preds))) print('Validation error: {:.4f}'.format(RSE(y_val, val_preds)))
可以看到误差并不大,结果如下
概括的步骤
更深入的模型
一个更适合回归树模型的数据:因为我们的数据是多项式生成的数据,所以使用多项式回归模型可以更好地拟合。我们更换一下训练数据,把新函数设为
def f(x): mu, sigma = 0, 0.5 if x < 3: return 1 + np.random.normal(mu, sigma, 1) elif x >= 3 and x < 6: return 9 + np.random.normal(mu, sigma, 1) elif x >= 6: return 5 + np.random.normal(mu, sigma, 1) np.random.seed(1) x = np.random.uniform(0, 10, num_points) y = np.array( [f(i) for i in x] ) plt.scatter(x, y, s = 5)
在此数据集上运行了上面的所有相同过程,结果如下
比我们从多项式数据中获得的误差低。
最后共享一下上面动图的代码:
import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from matplotlib.animation import FuncAnimation #===================================================Create Data def f(x): mu, sigma = 0, 1.5 return -x**2 + x + 5 + np.random.normal(mu, sigma, 1) np.random.seed(1) x = np.random.uniform(-2, 5, 300) y = np.array( [f(i) for i in x] ) p = x.argsort() x = x[p] y = y[p] #===================================================Calculate Thresholds def SSR(r, y): #send numpy array return np.sum( (r - y)**2 ) SSRs, thresholds = [], [] for i in range(len(x) - 1): threshold = x[i:i+2].mean() low = np.take(y, np.where(x < threshold)) high = np.take(y, np.where(x > threshold)) guess_low = low.mean() guess_high = high.mean() SSRs.append(SSR(low, guess_low) + SSR(high, guess_high)) thresholds.append(threshold) #===================================================Animated Plot fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(2,1, sharex = True) x_data, y_data = [], [] x_data2, y_data2 = [], [] ln, = ax1.plot([], [], 'r--') ln2, = ax2.plot(thresholds, SSRs, 'ro', markersize = 2) line = [ln, ln2] def init(): ax1.scatter(x, y, s = 3) ax1.title.set_text('Trying Different Thresholds') ax2.title.set_text('Threshold vs SSR') ax1.set_ylabel('y values') ax2.set_xlabel('Threshold') ax2.set_ylabel('SSR') return line def update(frame): x_data = [x[frame:frame+2].mean()] * 2 y_data = [min(y), max(y)] line[0].set_data(x_data, y_data) x_data2.append(thresholds[frame]) y_data2.append(SSRs[frame]) line[1].set_data(x_data2, y_data2) return line ani = FuncAnimation(fig, update, frames = 298, init_func = init, blit = True) plt.show()
到此这篇关于Python手写回归树的实现的文章就介绍到这了,更多相关Python 回归树内容请搜索脚本之家以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持脚本之家!