docker中可以用pycharm么_使用docker来配置pycharm开发和训练环境

本文主要介绍使用docker＋pycharm方式来搭建pytoch训练平台

操作流程如下：

一、宿主机docker环境安装

二、新建Docker镜像

有两种方式：

１、直接新建Ｄockerfile的方式生成

1)新建一个Dockerfile文件

ARG CUDA="11.0"ARG CUDNN="8"FROM nvidia/cuda:${CUDA}-cudnn${CUDNN}-devel-ubuntu16.04RUN echo'debconf debconf/frontend select Noninteractive' | debconf-set-selections#install basics

RUN apt-get update -y \&& apt-get install -y apt-utils git curl ca-certificates bzip2 cmake tree htop bmon iotop g++\&& apt-get install -y libglib2.0-0 libsm6 libxext6 libxrender-dev#Install Miniconda

RUN curl -so /miniconda.sh https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh \&& chmod +x /miniconda.sh \&& /miniconda.sh -b -p /miniconda \&& rm /miniconda.sh

ENV PATH=/miniconda/bin:$PATH#Create a Python 3.6 environment

RUN /miniconda/bin/conda install -y conda-build \&& /miniconda/bin/conda create -y --name py36 python=3.6.7\&& /miniconda/bin/conda clean -ya

ENV CONDA_DEFAULT_ENV=py36

ENV CONDA_PREFIX=/miniconda/envs/$CONDA_DEFAULT_ENV

ENV PATH=$CONDA_PREFIX/bin:$PATH

ENV CONDA_AUTO_UPDATE_CONDA=false

RUN conda install-y ipython

RUN pip install requests ninja yacs cython matplotlib opencv-python tqdm#Install PyTorch 1.0 Nightly

ARG CUDA

RUN conda install pytorch-nightly cudatoolkit=${CUDA} -c pytorch \&& conda clean -ya#Install TorchVision master

RUN git clone https://github.com/pytorch/vision.git \&&cd vision \&&python setup.py install#install apex

RUN git clone https://github.com/NVIDIA/apex.git \&&cd apex \&& python setup.py install --cuda_ext --cpp_ext#install PyTorch Detection

ARG FORCE_CUDA="1"ENV FORCE_CUDA=${FORCE_CUDA}

RUN mkdir workspace

WORKDIR/workspace

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2)使用dockerfile生成一个新镜像，注意最后一个点

sudo docker build -t pc2mx_orig:v0.1 .

２、采用下载基本ubuntu镜像方式生成

三、安装Pycharm

四、配置docker环境

第一步：

新建目录：mkdir /etc/systemd/system/docker.service.d

新建文件：sudo nano /etc/systemd/system/docker.service.d/http-proxy.conf

[Service]

ExecStart=ExecStart= /usr/bin/dockerd -H tcp:0.0.0.0:2375 unix:///var/run/docker.sock

第二步：

刷新配置：sudo systemctl daemon-reload

重启docker守护进程：sudo systemctl restart docker

第三步：启动pycharm

目前pycharm 2020.3版本以上才支持docker配置

需使用sudo权限打开，否则会出现连接不上unix:///var/run/docker.sock的问题

sudo ./pycharm.sh

配置pycharm：

1)File-> Settings ->Build,Execution,Deployment->Docker;  Connect to Docker daemon with:选择unix socket

2)File->Settings-> Project-> Python Interpreter->Add ->Dokcer-> ImageName:选择镜像名

3)Run->Edit Configuration

配置Environment variables,Python InterpreterkWorking directory,Docker container settings.

第四步：运行pycharm程序

如果docker中安装了所有工程需要的包，就可以正常工作了。一般情况下，总会缺少一些包：)

问题１：

如果缺少相应包，如：ModuleNotFoundError: No module named 'scipy'

解决方法：

１．在docker环境中安装scipy: pip install scipy　　(此时，直接运行pycharm程序还是会报错，因为新安装的配置不会立即更新)

2.   保存当前容器为新镜像，以免丢失新安装的配置:sudo docker commit -a "jimchen" CONTAINER_ID NEW_IMAGE_ID

更多docker使用方法见该链接：Docker常用操作

３．重新配置pycharm到该新镜像

pip install matplotlib, opencv-python,

问题２：

docker环境安装了cuda,但本地没有安装cuda

AssertionError:

Found no NVIDIA driver on your system. Please check that you

have an NVIDIA GPU and installed a driver from

http://www.nvidia.com/Download/index.aspx

解决方法：

pycharm-> Run/Debug configuration->Docker container settings

添加　--gpus all　#使用docker中配置的cuda环境

-v local_dir(绝对路径):docker_dir(绝对路径)　  #映射本地目录到docker目录

问题３：

数据集路径找不到，加载失败

解决方法：

pycharm-> Run/Debug configuration->Ｗorking directory

设置工作目录为映射到docker的目录：local_dir(绝对路径)，并把数据集存放在当前目录

问题４：

共享内存不足：ERROR: Unexpected bus error encountered in worker. This might be caused by insufficient shared memory (shm).

解决方法：

pycharm-> Run/Debug configuration->Docker container settings

添加配置项：--shm-size 8G(16G),设置多大视当前训练环境的硬件配置而定。

问题５：

docker 环境里默认python为版本3.6,而pytorch需要使用的是python3.8版，在配置pycharm时，碰到如下问题：

Error response from daemon: OCI runtime create failed: container_linux.go:349 : starting container process caused “exec: \“python\”: executable file not found in $PATH”: unknown

解决方法：

sudo ln -s /usr/bin/python3.８ /usr/bin/python　　　＃设置python3.8为默认版本

问题6：

在docker里安装了很多软件，但是在pycharm中选择好相应的docker镜像后就是看不到所安装的软件

解决方法：

在pycharm菜单，File->Settings->Python Interpreter里，点击右侧add ,出现add python interpreter界面，选择Docker一栏，然后在右边分别选择Docker，已经做好的Docker镜像，和python路径，这里要注意：该路径为docker中的python绝对路径。如果不填，就会出现上面现象，装了再多的软件，在列表中也显示不出来。

问题7：

配置好环境后，运行训练脚本，报如下错误：5089d32082ed:/miniconda3/bin/python -u /workspace/DL_Arch_Main/work/MDC_DSL/script_training.py

/miniconda3/bin/python: /miniconda3/bin/python: cannot execute binary file

解决方法：

打开菜单Run->Run/Debug Configurations，在Docker container settings中，打开编辑窗口，加入选项：--entrypoint=