GAN在医学图像生成中的应用

GAN在医学图像生成中的应用

  • 1、重建
  • 2、合成

GAN在医学图像生成中的应用_第1张图片

GAN框架由生成器(G)、鉴别器(D)以及真实数据X的训练数据集组成。G生成器,是一个多层网络参数θG,旨在找到一种映射x = G(z,θG)。通过映射,G生成假数据。另一方面,鉴别器D(x;θD)旨在把假样本和真实数据区分开来。
min ⁡ G max ⁡ D V ( D , G ) = E x ∼ p d a t a ( x ) [ l o g ( D ( x ) ) ] + E z ∼ p z ( z ) [ 1 − l o g ( D ( G ( z ) ) ) ] (1) \min_{G} \max_{D}V(D,G)=\mathbb{E}_{x\sim p_{data}(x)}[log(D(x))] + \mathbb{E}_{z \sim p_z(z)}[1-log(D(G(z)))] \tag1 GminDmaxV(D,G)=Expdata(x)[log(D(x))]+Ezpz(z)[1log(D(G(z)))](1)

GAN的主要优点是通过关注数据的潜在概率密度,找到模型的数据分布。虽然GANs与CNNs相比具有这样的内在优势,但也存在一些挑战:

  • 1). 崩溃问题(mode collapse):当G崩溃时,将所有不同的输入映射到相同的数据;
  • 2). 不稳定性:导致相同输入产生不同的输出。这些现象的主要原因与优化过程中梯度消失有关

虽然批处理归一化(batch normalization)是解决GAN不稳定性的一种方法,但它不足以使GAN的性能达到最优稳定性。因此,已经引入了许多GANs的子类来解决这些缺陷。部分框架如图所示:

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1、重建

对丢失的图像数据进行重建,可以在诊断过程中起到有效的作用。由于GAN在数据合成方面的良好性能,使其具有相当大的潜力。在一些医学影像中,如磁共振成像(MRI),需要较长的获取时间,患者的无意识(即由于呼吸)和自主(即由于不舒适的情况)运动是非常常见的。这些运动导致图像中器官的一些关键信息丢失。基于GAN的方法则试图在不完全(零填充)和完全采样的MR图像之间找到映射。
表2和表3总结了一些GANs的特性和性能。在医学图像的重建中,GANs似乎可以提供很好的性能,在损失函数中加入一些操作,突出纹理细节和特殊特征。

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2、合成

最初,GAN被提议作为**完全无监督的生成框架,其目标是在训练数据分布之后将随机噪声映射到真实的图像。**利用conditional GAN,成功地转变为监督生成框架。本文将原始GAN框架称为无条件或无监督GAN,与conditional GAN相反。要强调的是,区分这些不同的概念对文献进行相应的分类是非常重要的。

两种框架的属性被利用来合成某些类型的医学图像,这些图像既可以来自单独的噪声,也可以来自先前的知识(参见条件图像合成),例如元数据甚至是用于映射的图像数据。从一种形态到另一种形态的图像。
Discussion

1 GAN在医疗领域的优势

基于GAN的深度生成模型能够产生逼真的图像,在医疗图像独有的两个挑战中,Gan具有得天独厚的优势:

  • 标注的稀缺性:通常,标注在医学图像中too expensive且难以获得。针对此类问题的基于监督学习的深度神经网络具有挑战性。正如合成和转化中的多项研究所证明的那样,GAN可以利用这两个即将到来的框架
  • 不成对的数据:找到正确的数据(按像素或按区域)是极具挑战性的。GAN框架十分强大,例如cycle GAN从不成对的训练图像中学习独特的模式并产生逼真的输出。

2 缺点

本文确定当前形式的GAN中可能阻碍其在医学界发展的三个主要缺点:

  • 合成数据的可信度:基本网络 - 发生器和鉴别器仍然是深度神经网络,其机制尚未得到很好的研究。在医学图像中,强度通常与某些含义相关,例如,可以基于CT数据的HU大致分类组织类型。目前GAN重建中缺少这种关联和映射,这一缺点足以让临床医生不信任GAN合成的图像。
  • 不稳定的训练:许多文献指出GAN训练的数值是不稳定的。这会导致mode cllaspe等情况。state of the art的工作在真实图像的GAN训练中着重于解决这些数值不稳定问题。然而,在医学成像中,图像模式本身不清晰,如何识别这样的问题尚不清楚。
  • 评估指标:评估reconstruction结果的最佳方法仍不清楚。在医学成像中,研究人员主要依靠传统指标(如PSNR或MSE)来评估GAN重建质量。然而这种指标的缺点是人们选择GAN的主要原因。

参考:医学图像领域的GANs

参考:

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