参考文章
之前在逻辑回归的文章中简单提到过F1-score,但并没有详细对其进行说明和代码实现。这里补一下。
混淆矩阵
(又称误差矩阵
)是评判模型结果的指标,属于模型评估的一部分。混淆矩阵多用于判断分类器的优劣,适用于分类型数据模型。如分类树、逻辑回归、线性判别分析等方法。
除了混淆矩阵外,常见的分类型模型判别标准还有
ROC曲线
和AUC面积
,本篇不对另外两种进行拓展。
为了便于理解,我们从二分类混淆模型开始,引出四个基本指标(又称一级指标),并进一步引出其他指标。
TP(True Positive,真阳性):样本的真实类别是正类,并且模型预测的结果也是正类。
FP(False Positive,假阳性):样本的真实类别是负类,但是模型将其预测成为正类。
TN(True Negative,真阴性):样本的真实类别是负类,并且模型将其预测成为负类。
FN(False Negative,假阴性):样本的真实类别是正类,但是模型将其预测成为负类。
通过混淆矩阵统计出的一级指标,可以进一步衍生出以下二级指标。
含义: 分类模型所有判断正确的结果占总观测值的比重。(准确率是针对整个模型)
公式:
A c c = T P + T N T P + T N + F P + F N Acc = \frac{TP+TN}{TP+TN+FP+FN} Acc=TP+TN+FP+FNTP+TN
注意别把准确率和精确率搞混了。
含义:在模型预测为正类的所有结果中,模型预测正确的比重。
公式:
P c = T P T P + F P Pc = \frac{TP}{TP+FP} Pc=TP+FPTP
召回率又称
灵敏度(Sensitivity)
。
含义:在真实值为正类的所有结果中,模型预测正确的比重。
公式:
R c = T P T P + F N Rc = \frac{TP}{TP+FN} Rc=TP+FNTP
含义:在真实值为负类的所有结果中,模型预测正确的比重。
公式:
S c = T N T N + F P Sc = \frac{TN}{TN+FP} Sc=TN+FPTN
相对于前三个二级指标,特异度用的比较少。
通过二级指标可以引出三级指标F Score
。
F-Score是可以综合考虑精确度(Precision)
和召回率(Recall)
的调和值,公式如下:
F S c o r e = ( 1 + β 2 ) P r e c i s i o n × R e c a l l β 2 P r e c i s i o n + R e c a l l F~Score = (1+\beta^2)\frac{Precision\times Recall}{\beta^2Precision+Recall} F Score=(1+β2)β2Precision+RecallPrecision×Recall
此时称为F1-Score或F1-Measure
。公式(即 β = 1 \beta=1 β=1):
F 1 S c o r e = 2 P r e c i s i o n × R e c a l l P r e c i s i o n + R e c a l l F1~Score = \frac{2Precision\times Recall}{Precision+Recall} F1 Score=Precision+Recall2Precision×Recall
现在将二分类拓展至多分类混淆矩阵。为了便于理解,这里举一个具体的示例。
准确率是对于整体而言的,指分类模型所有预测正确的结果占总观测值的比重。可以很容易看出,对于多分类混淆矩阵,所有预测正确的结果就是对角线之和
。
于是这个示例的准确率为:
A c c = 23 + 25 + 30 23 + 3 + 2 + 4 + 25 + 6 + 5 + 2 + 30 = 78 100 = 0.78 \begin{split} Acc & = \frac{23+25+30}{23+3+2+4+25+6+5+2+30} \\ & = \frac{78}{100} \\ & = 0.78 \end{split} Acc=23+3+2+4+25+6+5+2+3023+25+30=10078=0.78
精确率是对于单个类别而言。所以这里需要把 C 1 , C 2 , C 3 C1,C2,C3 C1,C2,C3的精确度都算出来。这里就只举例 C 1 C1 C1的精确度如何计算。
某类的精确率:在模型预测为本类的所有结果中,模型预测正确的比重。(分母为对行求和)
令 C 1 C1 C1的精确率为 P c 1 Pc_1 Pc1 :
P c 1 = 23 23 + 3 + 2 = 0.821 \begin{split} Pc_1 = & \frac{23}{23+3+2} \\ & = 0.821 \end{split} Pc1=23+3+223=0.821
某类的召回率:在真实值为本类的所有结果中,模型预测正确的比重。(分母为对列求和)
令 C 1 C1 C1的召回率为 R c 1 Rc_1 Rc1 :
R c 1 = 23 23 + 4 + 5 = 0.719 \begin{split} Rc_1 = & \frac{23}{23+4+5} \\ & = 0.719 \end{split} Rc1=23+4+523=0.719
一般都用不着,不过这里还是算一遍吧。
要计算这个东西,需要把上面的图统计为二分类混淆矩阵的形式才好解释。
特异度:在真实值为负类的所有结果中,模型预测正确的比重。
令 C 1 C1 C1的特异度为 S c 1 Sc_1 Sc1 :
S c 1 = T N T N + F P = 63 5 + 63 = 0.93 \begin{split} Sc_1 & = \frac{TN}{TN+FP} \\ & = \frac{63}{5+63} \\ & = 0.93 \end{split} Sc1=TN+FPTN=5+6363=0.93
F 1 S c o r e 1 = 2 P c 1 R c 1 P c 1 + R c 1 = 2 × 0.821 × 0.719 0.821 + 0.719 = 0.767 \begin{split} F1~Score_1 &= \frac{2Pc_1Rc_1}{Pc_1+Rc_1} \\ & = \frac{2\times0.821\times0.719 }{0.821+0.719} \\ & = 0.767 \end{split} F1 Score1=Pc1+Rc12Pc1Rc1=0.821+0.7192×0.821×0.719=0.767
前景题要:现在已经通过某种多分类器(例如softmax分类器)求出了测试集的预测结果。现在需要对预测结果进行评估。
数据如下:
y_true is : [0 1 3 2 3 0 2 2 3 3 3 0 1 4 4 0 1 3 2 2 1 3 2 0 2 4 1 0 1 0 4 3 3 3 2 1 0 3 0]
y_predict is : [0 1 3 0 2 0 2 2 1 2 3 0 0 4 4 0 1 4 2 2 0 3 2 1 2 4 3 1 1 3 4 3 0 2 2 3 2 2 1]
def statistics_confusion(y_true,y_predict):
"""
统计混淆矩阵
:param y_true: 真实label
:param y_predict: 预测label
:return:
"""
confusion = np.zeros((5, 5))
for i in range(y_true.shape[0]):
confusion[y_predict[i]][y_true[i]] += 1
return confusion
输出:
def cal_Acc(confusion):
"""
计算准确率
:param confusion: 混淆矩阵
:return: Acc
"""
return np.sum(confusion.diagonal())/np.sum(confusion)
输出:
Acc is 0.5641025641025641
def cal_Pc(confusion):
"""
计算每类精确率
:param confusion: 混淆矩阵
:return: Pc
"""
return confusion.diagonal()/np.sum(confusion,axis=1)
输出:
Pc is [0.5 0.42857143 0.58333333 0.57142857 0.8 ]
每列对应一个类的精确率。
def cal_Rc(confusion):
"""
计算每类召回率
:param confusion: 混淆矩阵
:return: Rc
"""
return confusion.diagonal()/np.sum(confusion,axis=0)
输出:
Rc is [0.44444444 0.42857143 0.875 0.36363636 1. ]
每列对应一个类的召回率。
def cal_F1score(PC,RC):
"""
计算F1 score
:param PC: 精准率
:param RC: 召回率
:return: F1 score
"""
return 2*np.multiply(PC,RC)/(PC+RC)
输出:
F1-score is [0.47058824 0.42857143 0.7 0.44444444 0.88888889]
每列对应一个类的F1 score。
为了让结果和代码更加美观,可以打一下包。
import numpy as np
class Myreport:
def __init__(self):
self.__confusion = None
def __statistics_confusion(self,y_true,y_predict):
self.__confusion = np.zeros((5, 5))
for i in range(y_true.shape[0]):
self.__confusion[y_predict[i]][y_true[i]] += 1
def __cal_Acc(self):
return np.sum(self.__confusion.diagonal()) / np.sum(self.__confusion)
def __cal_Pc(self):
return self.__confusion.diagonal() / np.sum(self.__confusion, axis=1)
def __cal_Rc(self):
return self.__confusion.diagonal() / np.sum(self.__confusion, axis=0)
def __cal_F1score(self,PC,RC):
return 2 * np.multiply(PC, RC) / (PC + RC)
def report(self,y_true,y_predict,classNames):
self.__statistics_confusion(y_true,y_predict)
Acc = self.__cal_Acc()
Pc = self.__cal_Pc()
Rc = self.__cal_Rc()
F1score = self.__cal_F1score(Pc,Rc)
str = "Class Name\t\tprecision\t\trecall\t\tf1-score\n"
for i in range(len(classNames)):
str += f"{classNames[i]} \t\t\t{format(Pc[i],'.2f')} \t\t\t{format(Rc[i],'.2f')}" \
f" \t\t\t{format(F1score[i],'.2f')}\n"
str += f"accuracy is {format(Acc,'.2f')}"
return str
测试:
myreport = Myreport()
print(myreport.report(y_true = y_true,y_predict=y_predict,classNames=['C1','C2','C3','C4','C5']))
输出:
from sklearn.metrics import classification_report # 结果评估
myreport = Myreport()
print("=====自己实现的结果=====")
print(myreport.report(y_true = y_true,y_test=y_predict,classNames=['C1','C2','C3','C4','C5']))
print("=====使用sklrean的结果=====")
print(classification_report(y_true, y_predict, target_names=['C1','C2','C3','C4','C5']))
只能说一模一样。