Debug要坚持一元论

坚持一元论debug

一元论（Monism）是认为世界只有一个本原的马原哲学学说，是本体论的分支的一个哲学学说。唯物主义的一元论肯定世界的本原是物质，唯心主义的一元论肯定世界的本原是精神。 出自E.H.海克尔《作为宗教和科学之间的纽带的一元论》。
马克思主义哲学认为，在唯物主义的一元论中，只有唯物辩证法的一元论才科学地论证和全面地贯彻了物质是世界的本原的观点。

解决错误提示：/usr/lib64/libfontconfig.so.1: undefined symbol: FT_Done_MM_Var

最近遇到一个极其BT的问题，我原来的目的是要安装R Shiny-server。

在安装了centos之后陆续安装了conda，R，Rstudio-server等科学计算工具和环境，之后重启发现就启动不了图形界面了，但ssh依然能够连接。

这个问题之所以BT，因为表现形式非常多样，新手很难把这些问题联系到一起，最后发现其实就是一个小问题导致了所有这些问题，故文以记之。

在ssh下startx之后报错：

/usr/libexec/gnome-session-binary: symbol lookup error: /usr/lib64/libharfbuzz.so.0: undefined symbol: 
FT_Done_MM_Var

我想既然能够登录，没有GUI也没关系，于是继续其他安装。知道安装了Shiny-server之后，测试网页报错，回到log一看：

Warning in pngfun(filename = filename, width = width, height = height, res = res,  :
  无法打开链结到X11显示''
Warning: Error in .External2: 无法打开PNG设备
  127: pngfun
  126: startPNG
  125: drawPlot
  111: <reactive:plotObj>
   95: drawReactive
   82: origRenderFunc
   81: output$distPlot
   1: runApp
   

既然无法打开PNG设备的话，我启动R看了看，输入capabilities()看了看，原来jpeg，png，tiff这几个都是false，搜索一下发现可能和我没有编译安装cairo包有关。

于是到R下面想install.packages(“Cario”)的时候，在安装依赖的时候发现有个包叫“systemfonts”安装不上，报错如下：

Error: package or namespace load failed for ‘systemfonts’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 无法载入共享目标对象‘/usr/local/lib64/R/library/00LOCK-systemfonts/00new/systemfonts/libs/systemfonts.so’：:
  /usr/lib64/libfontconfig.so.1: undefined symbol: FT_Done_MM_Var
错误: 载入失败
停止执行
ERROR: loading failed
* removing ‘/usr/local/lib64/R/library/systemfonts’

这下就糊涂了，到底问题出在哪里？直觉告诉我肯定于FT_Done_MM_Var这个函数有关。

在搜索了很长时间之后，找到一条线索，原因可能是conda安装的时候覆盖了freetype这个包，改变了库链接，所以导致其他库找不到函数了。

于是抱着试一试的态度，先卸载了可能受影响的fontconfig包，然后下载freetype编译，编译后发现少了harfbuzz，又下载下来再次编译，之后make安装，问题解决了。这下startx也能启动了，shiny-server工作也正常了。

conda uninstall fontconfig #可选
 yum install harfbuzz-devel
 wget https://download.savannah.gnu.org/releases/freetype/freetype-2.10.0.tar.bz2
.configure --prefix=/usr/local/freetype
make && make install

如下图：

从这件事得出一个结论，有时候一个问题可能表现出很多形式，但debug务必需要坚持一元论。

完。