matlab pr曲线实例,再理解下ROC曲线和PR曲线 | 丕子
大家都发表下对着俩曲线的理解吧。
分类、检索中的评价指标很多，Precision、Recall、Accuracy、F1、ROC、PR Curve......
一、历史
wiki上说，ROC曲线最先在二战中分析雷达信号，用来检测敌军。诱因是珍珠港事件；由于比较有用，慢慢用到了心理学、医学中的一些检测等应用，慢慢用到了机器学习、数据挖掘等领域中来了，用来评判分类、检测结果的好坏。
百科：ROC曲线指受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve), 是反映敏感性和特异性连续变量的综合指标,是用构图法揭示敏感性和特异性的相互关系，它通过将连续变量设定出多个不同的临界值，从而计算出一系列敏感性和特异性，再以敏感性为纵坐标、(1-特异性)为横坐标绘制成曲线，曲线下面积越大，诊断准确性越高。在ROC曲线上，最靠近坐标图左上方的点为敏感性和特异性均较高的临界值。
二、原理
这里就拿最经典的二分类(0、1)问题讨论吧，分类器分类之后，往往会得到对每个样本是哪一类的一个估计，像是LR模型就会将这个估计规范化到【0,1】，根据这个估计，你选择一个阈值p_0，就可以将分类结果映射到0,1了；分类效果好不好跟真实的label比比就行了。
所以你手里有decision和label两个向量，用来做分类结果的评估。
要看ROC的原理，总离不开上面这个表格，ROC绘制的就是在不同的阈值p_0下，TPR和FPR的点图。所以ROC曲线的点是由不同的p_0所造成的。所以你绘图的时候，就用不同的p_0采点就行。
Precision-Recall曲线，这个东西应该是来源于信息检索中对相关性的评价吧，precision就是你检索出来的结果中，相关的比率；recall就是你检索出来的结果中，相关的结果占数据库中所有相关结果的比率；所以PR曲线要是绘制的话，也是对cutoff进行遍历，这样也得到了不同的precision和recall的点。例如你选择了一个cutoff，从而根据cutoff判别分类的结果1或0。1就是检索返回的结果，0就是没有返回的结果。
数据库里有500条记录，其中50个是相关的(正样本)，你通过一个cutoff，返回了75个1，其中只有45个是真正相关的；
那么在这个cutoff对应下的recall=45/50=0.9,precision=45/75=0.6。坐标就是(0.9,0.6)，在这里绘制一个点吧。
可以看出TPR和Recall的形式是一样的，就是查全率了，FPR就是保证这样的查全率你所要付出的代价，就是把多少负样本也分成了正的了。
上面是我的理解，不知道对不对。
三、AUC的计算
为了更好的衡量ROC所表达结果的好坏，Area Under Curve(AUC)被提了出来，简单来说就是曲线右下角部分占正方形格子的面积比例；那么计算这个东西其实就很简单了，根据reference的paper，有很多很多计算方法，这里推荐一种近似采样的方法：采样。
你的分类器能够将正例排在负例前面的概率是多少，也就是采样中正例的decision>负例的decision的概率。
1
2
3
4
5
6auc sample(neg.decision,1000,replace=T))
## or
aucs sample(neg.decision,1000,replace=T)))
auc2
其实这个可以等价于对于不规则图形的面积的采样估计了。谁能给推导一下？
四、ROC中最优的p_0的计算
简单理解下的话，保证TPR同时代价FPR要尽量的小，是不是可以建立max(TPR+(1-FPR))的模型，然后选p_0呢？
paper中有更加详细的方法。谁给详细介绍下？
五、ROC和PR曲线之间的关系和不同
当正负样本差距不大的情况下，ROC和PR的趋势是差不多的，但是当负样本很多的时候，两者就截然不同了，ROC效果依然看似很好，但是PR上反映效果一般，还需要继续努力啊。解释起来也简单，假设就1个正例，100个负例，那么基本上TPR可能一直维持在100左右，然后突然降到0.
ROC and precision-recall curves under class skew. (a) ROC curves, 1:1; (b) precision-recall curves, 1:1; (c) ROC curves, 1:10 and (d) precisionrecall
六、具体例子和代码
(1)数据集
用的libsvm的那个270个样本的数据集，用LR模型做了一下：
0.688312721844616 1
0.461679176682519 0
0.405016268379421 1
0.693999977303342 0
0.391868684948981 0
0.526391961908057 0
0.570470938139219 1
0.708771207269333 1
0.700976655664182 1
0.713584109310541 1
0.545180177320974 0
0.646156295395112 0
0.347580513944893 0
0.391577777998607 1
....
(2)ROC曲线和PR曲线
R语言的ROCR绘制的图形：
代码：
01
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09
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13
14
15
16library(ROCR)
a=read.table("toy.txt")
a
pred
perf
auc.tmp
auc
auc
plot(perf,colorize=TRUE,lwd=5,xlab="FPR",ylab="TPR", main=paste("AUC=",auc*100,"%"))
grid(5, 5, lwd = 1)
lines(par()$usr[1:2], par()$usr[3:4], lty=2, lwd=2, col="grey")
自己写代码绘制图像和估算AUC的值,AUC和ROCR包计算的还是很接近的：
01
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35
36
37a
a
label
decision
ngrids
TPR
FPR
p0
for(i in 1:ngrids)
{
p0[i]
pred_label p0[i])
TPR[i]
FPR[i]
}
## compute AUC
pos.decision
neg.decision
auc sample(neg.decision,1000,replace=T))
## or
aucs sample(neg.decision,1000,replace=T)))
auc2
plot(FPR, TPR, col=4,lwd=5, type="l", main=paste("AUC=",auc2*100,"%"))
grid(5, 5, lwd = 1)
points(c(0,1), c(0,1), type="l", lty=2, lwd=2, col="grey")
##
cut.op
PR曲线：
01
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03
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08
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26
27
28
a
a
label
decision
ngrids
P
R
p0
A
for(i in 0:ngrids)
{
p0[i]
pred_label p0[i])
R[i]
P[i]
A[i]
}
plot(R, P, col=4,lwd=5, type="l",xlab="Recall",ylab="Precision", main="PR Curve")
grid(5, 5, lwd = 1)
accuracy
七、Reference
[1]Tom Fawcett:An introduction to ROC analysis
[2]Jesse Davis，Mark Goadrich：The Relationship Between Precision-Recall and ROC Curves
[3]https://en.wikipedia.org/wiki/Receiver_operating_characteristic
[4]http://baike.baidu.com/view/42249.htm