论文绘图-教你如何绘制响应面

目录

一、写在前面

二、数据

三、代码-多元线性回归

3.1 导入库

3.2 导入数据

3.3 多元线性回归模型

3.3.1 多元线性回归-OLS

3.3.2 多元线性回归模型预测值相对误差

3.3.3 残差图

3.3.4 预测值与真实值分布图

四、代码-响应曲面

4.1 高斯消元

4.2 响应曲面绘制代码

4.3 调用matching_3D绘制响应曲面



一、写在前面

多项式回归结合响应面分析方法,可以利用响应面图直观反应复杂的三维关系,从而清晰呈现两个自变量和一个因变量之间关系的技术方法。

二、数据

论文绘图-教你如何绘制响应面_第1张图片

除25组数据外,还加一组自然情况下的基准数据 :

No.   Temperature pH  Fe2+ Cu2+ Fe3+  Y
30 6.5 0 0 7.55

三、代码-多元线性回归

3.1 导入库

from mpl_toolkits.mplot3d.axes3d import Axes3D
from matplotlib import cm
from pylab import *
from numpy import *
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import math
import numpy as np
import copy
plt.rcParams['axes.unicode_minus']=False  #用于解决不能显示负号的问题
mpl.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']


3.2 导入数据

#26
xArr = [
    [1,30,6.5,0,0,0],
    [1,30,1.5,0,0,0],
    [1,30,2,1,3,1],
    [1,30,2.25,3,5,3],
    [1,30,2.27,5,8,5],
    [1,30,2.41,8,10,8],
    [1,35,1.5,1,5,5],
    [1,35,2,3,8,8],
    [1,35,2.5,5,10,0],
    [1,35,3,8,0,1],
    [1,35,2.61,0,3,3],
    [1,40,1.5,3,10,1],
    [1,40,2,5,0,3],
    [1,40,2.5,8,3,5],
    [1,40,2.28,0,5,8],
    [1,40,3.23,1,8,0],
    [1,45,1.5,5,3,8],
    [1,45,2,8,5,0],
    [1,45,2.5,0,8,1],
    [1,45,2.44,1,10,3],
    [1,45,2.26,3,0,5],
    [1,50,1.5,8,8,3],
    [1,50,2,0,10,5],
    [1,50,2.17,1,0,8],
    [1,50,3,3,3,0],
    [1,50,2.82,5,5,1]
]

#26
yArr = [
       7.55,
       7.14,
       7.2,
       7.05,
       6.82,
       6.51,
       6.73,
       6.69,
       6.46,
       6.75,
       6.70,
       6.55,
       6.3,
       6.21,
       6.18,
       5.97,
       5.95,
       5.9,
       5.5,
       5.72,
       5.6,
       5.62,
       5.29,
       5.57,
       5.30,
       5.21
        ]

# print(len(xArr),len(yArr))

3.3 多元线性回归模型

3.3.1 多元线性回归-OLS

这里插一点和题目不相关的东西,像这种有许多X与对应的Y的数据,可以考虑进行多元线性回归

回归代码如下:(最小二乘法)

#最小二乘法 OLS
def standRegres(xArr,yArr):
    xMat = mat(xArr)
    yMat = mat(yArr).T
    xTx = xMat.T*xMat
    if linalg.det(xTx) == 0.0:
        print("This matrix is singular, cannot do inverse")
        return
    ws = xTx.I * (xMat.T*yMat)
#     print(ws)
    return ws

3.3.2 多元线性回归模型预测值相对误差

采用多元线性回归方程对验证每组数据相对误差:

mySum = 0
sse = 0
yPerList = []

#采用全部数据进行训练
ws = standRegres(xArr,yArr)          #ws即为方程系数
print(ws) 
for index,x in enumerate(xArr):
    yPer = float(x*ws)               #yPer即为预测值
    yPerList.append(yPer)           
    mySum += abs(yPer-yArr[index])*100
    sse = (yPer-yArr[index])**2 
    error = abs(yPer-yArr[index])/yArr[index]*100       #相对误差
#     print(yArr[index],round(yPer,2),str(round(error,2))+"%")
    plt.plot(index,error,"o")


plt.title("                            ",fontsize=13) #图片上方留白
plt.rc('font',family='Arial')                         #设置字体
plt.rcParams['xtick.direction'] = 'in'                #刻度线朝内
plt.rcParams['ytick.direction'] = 'in'
plt.tick_params(labelsize=18)                         #刻度大小
plt.xlabel("Test No.",fontsize=18)
plt.ylabel("Relative Error/%",fontsize=18)
plt.savefig("线性回归模型各拟合值相对误差",dpi=500,bbox_inches = 'tight') #dpi-清晰度
plt.show()

print("SSE=",sse,"平均相对误差=",round(mySum/sum(yArr),2))
print(corrcoef(yPerList,yArr)[0][1])

 效果:

论文绘图-教你如何绘制响应面_第2张图片

3.3.3 残差图

相关代码:

#残差图
mySum = 0
sse = 0
yPerList = []

#采用全部数据进行训练
ws = standRegres(xArr,yArr)
# print(ws)
for index,x in enumerate(xArr):
    yPer = float(x*ws)
    residua = yArr[index] - yPer

    plt.plot(index,residua,"bo")
    x = np.linspace(0,25,100)
    plt.plot(x,np.zeros(len(x)),"r")


plt.title("                          ",fontsize=13)
plt.rcParams['xtick.direction'] = 'in'
plt.rcParams['ytick.direction'] = 'in'
plt.rc('font',family='Arial')
plt.tick_params(labelsize=18)
plt.xlabel("Test No.",fontsize=18)
plt.ylabel("Residua",fontsize=18)
plt.ylim((-0.5, 0.5))
plt.savefig("残差图.jpg",dpi=500,bbox_inches = 'tight')
plt.show()

效果:

论文绘图-教你如何绘制响应面_第3张图片

3.3.4 预测值与真实值分布图

相关代码:



#分布图
mySum = 0
sse = 0
yPerList = []

#采用全部数据进行训练
ws = standRegres(xArr,yArr)
# print(ws)
for index,x in enumerate(xArr):
    yPer = float(x*ws)
    yPerList.append(yPer)
plt.plot(list(range(len(xArr))),yPerList,"bo",label="Fitted value")
plt.plot(list(range(len(xArr))),yArr,"r*",label="Measurement value")


plt.title("                              ",fontsize=13)
plt.rc('font',family='Arial')
plt.rcParams['xtick.direction'] = 'in'
plt.rcParams['ytick.direction'] = 'in'
plt.tick_params(labelsize=18)
plt.legend(framealpha=0,loc=(0.45, 0.55),fontsize=15)
plt.xlabel("Test No.",fontsize=18)
plt.ylabel("Oxygen solubility/mg·${{L^-}^1}$",fontsize=18)
plt.savefig("分布图.jpg",dpi=500,bbox_inches = 'tight')
plt.show()

效果:

论文绘图-教你如何绘制响应面_第4张图片

四、代码-响应曲面

4.1 高斯消元

相关代码:

#最小二乘法曲面拟合
def fun(x): 
    round(x, 2)
    if x >= 0:
        return '+'+str(x)
    else:
        return str(x)

def get_res(X, Y, Z, n):
    # 求方程系数
    sigma_x = 0
    for i in X: sigma_x += i
    sigma_y = 0
    for i in Y: sigma_y += i
    sigma_z = 0
    for i in Z: sigma_z += i
    sigma_x2 = 0
    for i in X: sigma_x2 += i * i
    sigma_y2 = 0
    for i in Y: sigma_y2 += i * i
    sigma_x3 = 0
    for i in X: sigma_x3 += i * i * i
    sigma_y3 = 0
    for i in Y: sigma_y3 += i * i * i
    sigma_x4 = 0
    for i in X: sigma_x4 += i * i * i * i
    sigma_y4 = 0
    for i in Y: sigma_y4 += i * i * i * i
    sigma_x_y = 0
    for i in range(n):
        sigma_x_y += X[i] * Y[i]
    # print(sigma_xy)
    sigma_x_y2 = 0
    for i in range(n): sigma_x_y2 += X[i] * Y[i] * Y[i]
    sigma_x_y3 = 0
    for i in range(n): sigma_x_y3 += X[i] * Y[i] * Y[i] * Y[i]
    sigma_x2_y = 0
    for i in range(n): sigma_x2_y += X[i] * X[i] * Y[i]
    sigma_x2_y2 = 0
    for i in range(n): sigma_x2_y2 += X[i] * X[i] * Y[i] * Y[i]
    sigma_x3_y = 0
    for i in range(n): sigma_x3_y += X[i] * X[i] * X[i] * Y[i]
    sigma_z_x2 = 0
    for i in range(n): sigma_z_x2 += Z[i] * X[i] * X[i]
    sigma_z_y2 = 0
    for i in range(n): sigma_z_y2 += Z[i] * Y[i] * Y[i]
    sigma_z_x_y = 0
    for i in range(n): sigma_z_x_y += Z[i] * X[i] * Y[i]
    sigma_z_x = 0
    for i in range(n): sigma_z_x += Z[i] * X[i]
    sigma_z_y = 0
    for i in range(n): sigma_z_y += Z[i] * Y[i]
    # print("-----------------------")
    # 给出对应方程的矩阵形式
    a = np.array([[sigma_x4, sigma_x3_y, sigma_x2_y2, sigma_x3, sigma_x2_y, sigma_x2],
                  [sigma_x3_y, sigma_x2_y2, sigma_x_y3, sigma_x2_y, sigma_x_y2, sigma_x_y],
                  [sigma_x2_y2, sigma_x_y3, sigma_y4, sigma_x_y2, sigma_y3, sigma_y2],
                  [sigma_x3, sigma_x2_y, sigma_x_y2, sigma_x2, sigma_x_y, sigma_x],
                  [sigma_x2_y, sigma_x_y2, sigma_y3, sigma_x_y, sigma_y2, sigma_y],
                  [sigma_x2, sigma_x_y, sigma_y2, sigma_x, sigma_y, n]])
    b = np.array([sigma_z_x2, sigma_z_x_y, sigma_z_y2, sigma_z_x, sigma_z_y, sigma_z])
    # 高斯消元解线性方程
    res = np.linalg.solve(a, b)
    return res

labelName = ["Oxygen solubility/mg·${{L^-}^1}$",
            "T/$^\circ$C",
            "pH",
            "c(${{Fe^2}^+}$)/g·${{L^-}^1}$",
            "c(${{Cu^2}^+}$)/g·${{L^-}^1}$",
            "c(${{Fe^3}^+}$)/g·${{L^-}^1}$",]
print(labelName)

4.2 响应曲面绘制代码

绘图的核心代码在这里,感兴趣的自己研究研究吧

变量res的系数就是用4.1节的高斯消元算法生成的系数

def matching_3D(X, Y, Z,xLabelIndex,yLabelIndex,name,arg1=37,arg2=-72):
    n = len(X)
    res = get_res(X, Y, Z, n)
    # 输出方程形式
    print("z=%.6s*x^2%.6s*xy%.6s*y^2%.6s*x%.6s*y%.6s" % (
    fun(res[0]), fun(res[1]), fun(res[2]), fun(res[3]), fun(res[4]), fun(res[5])))
    # 画曲面图和离散点
    fig = plt.figure()  # 建立一个空间
    ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')  # 3D坐标


    xgrid = np.linspace(min(X),max(X),100)
    ygrid = np.linspace(min(Y),max(Y),100)
    x,y = np.meshgrid(xgrid,ygrid)
    
    # 给出方程
    z = res[0] * x * x + res[1] * x * y + res[2] * y * y + res[3] * x + res[4] * y + res[5]

    # 画出曲面
    sp = ax.plot_surface(x, y, z, rstride=3, cstride=3, cmap=cm.jet)
    ax.contourf(x,y,z,zdir='z',offset=5,cmap = plt.get_cmap('rainbow'))
    # 画出点
    ax.scatter(X, Y, Z, c='r',label="实测点",alpha=0)
    
    
    plt.rc('font',family='Arial')
    plt.xlabel(labelName[xLabelIndex])
    plt.xticks(rotation=30,fontsize=9)
    plt.ylabel(labelName[yLabelIndex])
    ax.set_zlabel(labelName[0])

    
#     show_text(ax)
#     ax.legend()
    fig.colorbar(sp)
    ax.view_init(elev=arg1, azim=arg2)
    plt.rcParams['xtick.direction'] = 'in'
    plt.rcParams['ytick.direction'] = 'in'
    plt.savefig(name,dpi=500,bbox_inches = 'tight')
    fig.show()

4.3 调用matching_3D绘制响应曲面

代码:

和4.2节matching_3D的参数对照看

X与Y为自变量列表-分别为X轴与Y轴

yArr为因变量-Z轴坐标

1、4即为对应4.1节中labelName列表对应的名字 ,用于自动生成响应的坐标名称

T-cu2+即为保存的图片文件名

37,-72用于调整图片视角

%matplotlib notebook
X = []
Y = []
for x,y in zip(xArrMat[:,1],xArrMat[:,4]):
    X.append(float(x))
    Y.append(float(y))
matching_3D(X,Y,yArr,1,4,"T-cu2+曲面图",37,-72)

效果:论文绘图-教你如何绘制响应面_第5张图片论文绘图-教你如何绘制响应面_第6张图片

 论文绘图-教你如何绘制响应面_第7张图片

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