xjview脑区结果怎么看

view界面

按照下列顺序记录

1 脑区结果

1-5大概对应下图，半球水平-叶-回-组织-cell（Lancaster，2000）。

半球水平：大脑中最大的解剖结构（大脑，小脑和脑干）被分配到半球水平。
叶水平：对于大脑，由四个主要的额叶，颞叶，顶叶和枕叶和一个边缘叶组成。
回：包括主要叶的回和子叶区域内的各种深灰质结构。
组织水平：包括灰质，白质和脑脊髓液（CSF）。
Cell Level： The brain was labeled by cell-type in the cortex using Brodmann’s scheme [Garey, 1994] and tracts, spaces, and sub-nuclear regions for other portions of the brain. Forty-seven Brodmann areas (BA) labels were defined.

6 AAL Automated Anatomical Labeling

见参考文献2，也是命名系统
摘录一下标记方法
We implemented three procedures for the automatic anatomical labeling of the functional activation map: (1) local maxima labeling, (2) extended local maxima labeling, and (3) cluster labeling. Each type of labeling procedure assumes that the functional map has been spatially normalized using the MNI template. In the first step, the functional map is thresholded and then both the local maxima and the clusters are extracted. The three procedures are described bellow and graph- ically illustrated in Fig. 5.

参考
[1] LANCASTER J L, WOLDORFF M G, PARSONS L M, et al. Automated Talairach Atlas Labels for Functional Brain Mapping[J/OL]. Human Brain Mapping, 2000, 10(3): 120–131. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/1097-0193(200007)10:3%3C120::AID-HBM30%3E3.0.CO;2-8. DOI:10.1002/1097-0193(200007)10:3<120::AID-HBM30>3.0.CO;2-8.
[2] LANDEAU B, PAPATHANASSIOU D, CRIVELLO F, et al. Automated Anatomical Labeling of Activations in SPM Using a Macroscopic Anatomical Parcellation of the MNI MRI Single-Subject Brain[J]. 2002, 289: 273–289. . DOI:10.1006/nimg.2001.0978.

3 用表格输出结果

1 点击volume，出现表格
2 右键print，结果会在MATLAB的命令行输出

表格内容可以看到有cluster水平和voxel水平，xjview界面有三种p值，按需选择p值，FWE最严格。

分享个小tip【如果有能直接保存表格的，请踢我，学习一下】
print输出如下

复制文本-word粘贴-选中添加表格（文本转表格）——选择制表符作为分行标志

2 脑区对应的点

用xjview最主要是想将表格输出的点和脑区对应，上述仅输出了激活统计结果，如果一个个输坐标再复制脑区就略慢。点击report，MATLAB会输出和表格对应的脑区结果。
注：表格中有几个cluster水平，输出的脑区peak就会有几个，之前以为一张结果统计数据只输出一个cluster peak，不是的，注意看一下命令行结果。
见下图，cluster主要输出了6个，和volume结果的cluster水平（也是6个cluster）是一一对应的。注意peakMNI并不一定是voxels最大的，但是一般只要peak的点。把脑区结果补充到刚才转换过的统计结果图里，后续写作的时候再按需查找。

4 Render view 主要是结果图的呈现，可以拿自己的结果图试试

点击小图可以单独保存某个脑图，选择保存格式的时候，如果插文章里要选图片格式。这个默认是基于MATLAB的图。

5 Slices view

只分享一点，这个的呈现和选择的模板相关，选哪种呈现哪种。


该图选择的是ch2