Rstudio--“ComplexHeatmap“超级热图绘制包的安装

首先，表示一下对顾祖光博士的崇敬膜拜之情。

1.需要3.5版本的Rstudio

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("ComplexHeatmap")

2.基于github网站下载安装"ComplexHeatmap"

install.packages("devtools") #这是为了让你的Rstudio有“install_github"这个安装命令
library(devtools)
install_github("jokergoo/ComplexHeatmap")

这个时候可能还会出现一些程辑包缺失的情况，此时就是缺什么安装什么，直至全部安齐，这个过程中就需要用library(ComplexHeatmap)不断地检查缺失什么。

library(ComplexHeatmap)
#Error: package or namespace load failed for ‘ComplexHeatmap’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
 不存在叫‘Cairo’这个名字的程辑包
install.packages("Cairo")
library(ComplexHeatmap)
#Error: package or namespace load failed for ‘ComplexHeatmap’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
 不存在叫‘GetoptLong’这个名字的程辑包
install.packages("GetoptLong")

 

 出现上面这幅图，就表示你安装成功了。

3.有的大神也用了另外一种方法，我没有安装成功，作为一直菜鸟实在没有搞懂为什么，所以就继续查了其他方法。同学们可以试一下，如果出现安装缓慢的时候，就换一个CRAN地址，可能会好很多。

 

if(!requireNamespace("BiocManager", quietly = T))
install.packages("BiocManager")  #菜鸟们注意，这两行是一道命令，不是两道，应该是一个if循环。（本人也是一个菜鸟，注释不带有歧视与偏见）
BiocManager::install("ComplexHeatmap")

欢迎大家留言交流。