聚类轮廓系数java_轮廓系数的应用:kmeans聚类理论篇K的选择(轮廓系数)

前言javascript

kmeans是最简单的聚类算法之一,可是运用十分普遍。最近在工做中也常常遇到这个算法。kmeans通常在数据分析前期使用,选取适当的k,将数据分类后,而后分类研究不一样聚类下数据的特色。html

本文记录学习kmeans算法相关的内容,包括算法原理,收敛性,效果评估聚,最后带上R语言的例子,做为备忘。java

算法原理算法

kmeans的计算方法以下:shell

1 随机选取k个中心点app

2 遍历全部数据,将每一个数据划分到最近的中心点中机器学习

3 计算每一个聚类的平均值,并做为新的中心点ide

4 重复2-3,直到这k个中线点再也不变化(收敛了),或执行了足够多的迭代函数

时间复杂度:O(I*n*k*m)post

空间复杂度:O(n*m)

其中m为每一个元素字段个数,n为数据量,I为跌打个数。通常I,k,m都可认为是常量,因此时间和空间复杂度能够简化为O(n),即线性的。

算法收敛

从kmeans的算法能够发现,SSE实际上是一个严格的坐标降低(Coordinate Decendet)过程。设目标函数SSE以下:

SSE(,,…,) =

采用欧式距离做为变量之间的聚类函数。每次朝一个变量的方向找到最优解,也就是求偏倒数,而后等于0,可得

c_i= 其中m是c_i所在的簇的元素的个数

也就是当前聚类的均值就是当前方向的最优解(最小值),这与kmeans的每一次迭代过程同样。因此,这样保证SSE每一次迭代时,都会减少,最终使SSE收敛。

因为SSE是一个非凸函数(non-convex function),因此SSE不能保证找到全局最优解,只能确保局部最优解。可是能够重复执行几回kmeans,选取SSE最小的一次做为最终的聚类结果。

0-1规格化

因为数据之间量纲的不相同,不方便比较。举个例子,好比游戏用户的在线时长和活跃天数,前者单位是秒,数值通常都是几千,然后者单位是天,数值通常在个位或十位,若是用这两个变量来表征用户的活跃状况,显然活跃天数的做用基本上能够忽略。因此,须要将数据统一放到0~1的范围,将其转化为无量纲的纯数值,便于不一样单位或量级的指标可以进行比较和加权。具体计算方法以下:

其中属于A。

轮廓系数

轮廓系数(Silhouette Coefficient)结合了聚类的凝聚度(Cohesion)和分离度(Separation),用于评估聚类的效果。该值处于-1~1之间,值越大,表示聚类效果越好。具体计算方法以下:

对于第i个元素x_i,计算x_i与其同一个簇内的全部其余元素距离的平均值,记做a_i,用于量化簇内的凝聚度。

选取x_i外的一个簇b,计算x_i与b中全部点的平均距离,遍历全部其余簇,找到最近的这个平均距离,记做b_i,用于量化簇之间分离度。

对于元素x_i,轮廓系数s_i = (b_i – a_i)/max(a_i,b_i)

计算全部x的轮廓系数,求出平均值即为当前聚类的总体轮廓系数

从上面的公式,不难发现若s_i小于0,说明x_i与其簇内元素的平均距离小于最近的其余簇,表示聚类效果很差。若是a_i趋于0,或者b_i足够大,那么s_i趋近与1,说明聚类效果比较好。

K值选取

在实际应用中,因为Kmean通常做为数据预处理,或者用于辅助分类贴标签。因此k通常不会设置很大。能够经过枚举,令k从2到一个固定值如10,在每一个k值上重复运行数次kmeans(避免局部最优解),并计算当前k的平均轮廓系数,最后选取轮廓系数最大的值对应的k做为最终的集群数目。

实际应用

下面经过例子(R实现,完整代码见附件)讲解kmeans使用方法,会将上面提到的内容所有串起来

加载实验数据iris,这个数据在机器学习领域使用比较频繁,主要是经过画的几个部分的大小,对花的品种分类,实验中须要使用fpc库估计轮廓系数,若是没有能够经过install.packages安装。

对iris的4个feature作数据正规化,每一个feature均是花的某个不为的尺寸。

评估k,因为通常K不会太大,太大了也不易于理解,因此遍历K为2到8。因为kmeans具备必定随机性,并非每次都收敛到全局最小,因此针对每个k值,重复执行30次,取并计算轮廓系数,最终取平均做为最终评价标准,能够看到以下的示意图,

当k取2时,有最大的轮廓系数,虽然实际上有3个种类。

聚类完成后,有源原始数据是4纬,没法可视化,因此经过多维定标(Multidimensional scaling)将纬度将至2为,查看聚类效果,以下

能够发现原始分类中和聚类中左边那一簇的效果仍是拟合的很好的,右测原始数据就连在一块儿,kmeans没法很好的区分,须要寻求其余方法。

kmeans最佳实践

1. 随机选取训练数据中的k个点做为起始点

2. 当k值选定后,随机计算n次,取获得最小开销函数值的k做为最终聚类结果,避免随机引发的局部最优解

3. 手肘法选取k值:绘制出k--开销函数闪点图,看到有明显拐点(以下)的地方,设为k值,能够结合轮廓系数。

4. k值有时候须要根据应用场景选取,而不能彻底的依据评估参数选取。

参考

你可能感兴趣的:(聚类轮廓系数java)