小飞棍来喽~
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常用生物信息学数据库简介

常用生物信息学数据库简介

  • 1、常用数据库
    • NCBI（美国国家生物数据库）
    • EnsemBI（欧洲生物数据库）
    • Uniprot（蛋白质数据库）
  • 2、[在线工具galaxy](https://usegalaxy.org/)
  • 3、文献检索工具
    • PUBMED生物医学文献数据库
    • [HighWire Press全球最大提供免费全文的学术文献出版商](http://highwire.stanford.edu/)
    • [ISI Web of Knowledge可以找到某一领域引用文献数量最多的综述](http://wokinfo.com/)

1、常用数据库

NCBI（美国国家生物数据库）

NCBI中的常用网站
Genbank基因数据库（可以查到大部分DNA和RNA的序列和注释数据
Genome生物基因组数据库
Refseq
Homogene同源基因组数据库（搜索目标基因作为关键词）
GEO收集存贮原始基因芯片数据（发文章需预先提交到该数据库并拿到分配到的基因ID

EnsemBI（欧洲生物数据库）

相比NCBI的优势：可以查找基因的所有转录本序列，可以查找基因所有可变剪切体的数据

Uniprot（蛋白质数据库）

整合了Swiss-Prot、TrEMBL、PIR-PSD三大数据库的数据，包含了大量蛋白质的生物功能信息和蛋白质序列信息

2、在线工具galaxy

集成很多工具，只要上传数据就可以利用在线工具完成本需使用Linux完成的数据处理，也可以做测序数据的分析

3、文献检索工具

PUBMED生物医学文献数据库

HighWire Press全球最大提供免费全文的学术文献出版商

ISI Web of Knowledge可以找到某一领域引用文献数量最多的综述

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