lefse分析本地实现方法带全部安装文件和所有细节,保证成功。

本人在win7-64和win10-64均完整安装使用,其他系统本人能力所限没安装成功。
lefse本地分析包。(https://download.csdn.net/download/weixin_43585681/11530367)
安装python2.7。(https://download.csdn.net/download/weixin_43585681/11530532)
R语言3.6.1(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/base/R-3.6.1-win.exe)
这个是我总结的安装需求

  • R 语言: splines, stats4, survival, mvtnorm, modeltools, coin, MASS
  • python libraries: rpy2 , numpy(1.11), matplotlib (1.5), argparse
    其中R语言应该只需要安装mvtnorm, modeltools, coin就可以了

R的安装脚本如下:
install.packages(“mvtnorm”)
install.packages(“modeltools”)
install.packages(“coin”)

那么R的就需求包已经安装完成接下来python的四个包需要注意了,我们倒着说。
其中argparse应该是自带的不需要安装的
可以如下图所示验证一下就可以了lefse分析本地实现方法带全部安装文件和所有细节,保证成功。_第1张图片
matplotlib 可以在线安装的,安装脚本如下
pip install matplotlib==1.5
这里看清楚了是安装1.5版本的&#x

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