A Dluter

gmx-MMPBSA — error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file

操作系统Centos8
运行gmx_MMPBSA时，出现error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file错误：

[userrr@localhost gmx_MMPBSA]$ gmx_MMPBSA -O -i mmpbsa.in -cs md.tpr -ci index.ndx -cg 1 14 -ct fbd.xtc -lm UNK_bcc_gaff.mol2
[INFO   ] Starting
[INFO   ] Command-line
  gmx_MMPBSA -O -i mmpbsa.in -cs md.tpr -ci index.ndx -cg 1 14 -ct fbd.xtc -lm UNK_bcc_gaff.mol2

[WARNING] protein_forcefield and ligand_forcefield variables are deprecate since version 1.4.1 and will be remove in the next version. Please, use forcefield instead.
[WARNING] entropy variable is deprecate since version 1.4.2 and will be remove in v1.5.0. Please, use qh_entropy for Quasi-Harmonic approximation and i_entropy for Interaction entropy approximation instead.
[WARNING] entropy_seg variable is deprecate since version 1.4.2 and will be remove in v1.5.0. Please, use ie_segment instead.
[WARNING] entropy_temp variable is deprecated and will be remove in next versions!. Please, use temperature variable instead
[WARNING] offset and probe are molsurf-only options
[INFO   ] Checking external programs...
[INFO   ] cpptraj found! Using /home/user/software/Amber20/amber20/bin/cpptraj
[INFO   ] tleap found! Using /home/user/software/Amber20/amber20/bin/tleap
[INFO   ] parmchk2 found! Using /home/user/software/Amber20/amber20/bin/parmchk2
[INFO   ] mmpbsa_py_energy found! Using /home/user/software/Amber20/amber20/bin/mmpbsa_py_energy
[INFO   ] Using GROMACS version > 5.x.x!
[INFO   ] gmx found! Using /usr/local/gromacs/bin/gmx
[INFO   ] Checking external programs...Done.

[INFO   ] Building AMBER Topologies from GROMACS files...
[INFO   ] Checking gmxMMPBSA data folder exists in Amber data...
[INFO   ] Get PDB files from GROMACS structures files...
[INFO   ] Making gmx_MMPBSA index for complex...
[INFO   ] Running command: echo name 1 GMXMMPBSA_REC\n name 14 GMXMMPBSA_LIG\n  1 | 14\n q\n | /usr/local/gromacs/bin/gmx make_ndx -n index.ndx -o _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] Normal Complex: Saving group 1_14 in _GMXMMPBSA_COM_index.ndx file as _GMXMMPBSA_COM.pdb
[INFO   ] Running command: echo GMXMMPBSA_REC_GMXMMPBSA_LIG | /usr/local/gromacs/bin/gmx editconf -f md.tpr -o _GMXMMPBSA_COM.pdb -n _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] Generating ligand parameters from UNK_bcc_gaff.mol2 file...
[INFO   ] Running command: /home/user/software/Amber20/amber20/bin/parmchk2 -i UNK_bcc_gaff.mol2 -f mol2 -o _GMXMMPBSA_UNK_bcc_gaff.frcmod
[INFO   ] No receptor structure file was defined. Using ST approach...
[INFO   ] Using receptor structure from complex to generate AMBER topology
[INFO   ] Normal Complex: Saving group 1 in _GMXMMPBSA_COM_index.ndx file as _GMXMMPBSA_REC.pdb
[INFO   ] Running command: echo 1 | /usr/local/gromacs/bin/gmx editconf -f md.tpr -o _GMXMMPBSA_REC.pdb -n _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] No ligand structure file was defined. Using ST approach...
[INFO   ] Using ligand structure from complex to generate AMBER topology
[INFO   ] Normal ligand: Saving group 14 in _GMXMMPBSA_COM_index.ndx file as _GMXMMPBSA_LIG.pdb
[INFO   ] Running command: echo 14 | /usr/local/gromacs/bin/gmx editconf -f md.tpr -o _GMXMMPBSA_LIG.pdb -n _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] Chains ID found. Ignoring chains ID assignation...
[INFO   ] Generating AMBER Compatible PDB Files...
[INFO   ] Building tleap input files...
[INFO   ] Running command: /home/user/software/Amber20/amber20/bin/tleap -f _GMXMMPBSA_leap.in -I /home/user/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/GMXMMPBSA/data
[INFO   ] Cleaning normal complex trajectories...
[INFO   ] Running command: echo GMXMMPBSA_REC_GMXMMPBSA_LIG | /usr/local/gromacs/bin/gmx trjconv -f fbd.xtc -s md.tpr -o COM_traj_0.xtc -n _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] Building AMBER Topologies from GROMACS files...Done.

[INFO   ] Loading and checking parameter files for compatibility...

Preparing trajectories for simulation...
/home/user/software/Amber20/amber20/bin/cpptraj: error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
  File "/home/user/anaconda3/bin/gmx_MMPBSA", line 8, in <module>
    sys.exit(gmxmmpbsa())
  File "/home/user/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/GMXMMPBSA/app.py", line 97, in gmxmmpbsa
    app.file_setup()
  File "/home/user/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/GMXMMPBSA/main.py", line 146, in file_setup
    self.external_progs['cpptraj'], self.pre)
  File "/home/user/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/GMXMMPBSA/make_trajs.py", line 68, in make_trajectories
    traj = Trajectory(FILES.complex_prmtop, FILES.complex_trajs, cpptraj)
  File "/home/user/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/GMXMMPBSA/make_trajs.py", line 471, in __init__
    self.Query()
  File "/home/user/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/GMXMMPBSA/make_trajs.py", line 606, in Query
    raise TrajError('%s failed when querying %s' % (self.exe, traj))
TrajError: /home/user/software/Amber20/amber20/bin/cpptraj failed when querying COM_traj_0.xtc
Exiting. All files have been retained.

1）在路径/home/user/software/Amber20/amber20/lib/ 和 /home/user/software/Amber20/amber20/lib64/ 下均没有libgfortran.so.3
2）在conda下有libgfortran.so.4.0.0

[userrr@localhost gmx_MMPBSA]$ ll /home/user/anaconda3/lib/libgfortran.so*
lrwxrwxrwx. 1 user user      20 May 28 02:50 /home/user/anaconda3/lib/libgfortran.so -> libgfortran.so.4.0.0
lrwxrwxrwx. 1 user user      20 May 28 02:50 /home/user/anaconda3/lib/libgfortran.so.4 -> libgfortran.so.4.0.0
-rwxrwxr-x. 2 user user 5925928 Aug 18  2018 /home/user/anaconda3/lib/libgfortran.so.4.0.0

3） /usr/lib64/路径下有libgfortran.so.5.0.0

[userrr@localhost gmx_MMPBSA]$ ll /usr/lib64/libgfortran.so.*
lrwxrwxrwx. 1 root root      20 Oct 12  2020 /usr/lib64/libgfortran.so.5 -> libgfortran.so.5.0.0
-rwxr-xr-x. 1 root root 2622416 Oct 12  2020 /usr/lib64/libgfortran.so.5.0.0

解决办法：
libgfortran.so.3 安装网站

[userrr@localhost ~]$ sudo dnf install compat-libgfortran-48
[sudo] password for userrr:
Repository AppStream is listed more than once in the configuration
Repository extras is listed more than once in the configuration
Repository PowerTools is listed more than once in the configuration
Repository centosplus is listed more than once in the configuration
Last metadata expiration check: 2:23:10 ago on Fri 23 Jul 2021 01:56:49 AM EDT.
Dependencies resolved.
=============================================================================================================================================================================================================================
 Package                                                       Arch                                           Version                                                Repository                                         Size
=============================================================================================================================================================================================================================
Installing:
 compat-libgfortran-48                                         x86_64                                         4.8.5-36.1.el8                                         AppStream                                         275 k

Transaction Summary
=============================================================================================================================================================================================================================
Install  1 Package

Total download size: 275 k
Installed size: 1.1 M
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
compat-libgfortran-48-4.8.5-36.1.el8.x86_64.rpm                                                                                                                                              200 kB/s | 275 kB     00:01
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Total                                                                                                                                                                                         57 kB/s | 275 kB     00:04
Running transaction check
Transaction check succeeded.
Running transaction test
Transaction test succeeded.
Running transaction
  Preparing        :                                                                                                                                                                                                     1/1
  Installing       : compat-libgfortran-48-4.8.5-36.1.el8.x86_64                                                                                                                                                         1/1
  Running scriptlet: compat-libgfortran-48-4.8.5-36.1.el8.x86_64                                                                                                                                                         1/1
/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_ops_train.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_ops_infer.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_cnn_train.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_cnn_infer.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_adv_train.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_adv_infer.so.8 is not a symbolic link


/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_ops_train.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_ops_infer.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_cnn_train.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_cnn_infer.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_adv_train.so.8 is not a symbolic link

/sbin/ldconfig: /usr/local/cuda-11.2/targets/x86_64-linux/lib/libcudnn_adv_infer.so.8 is not a symbolic link


  Verifying        : compat-libgfortran-48-4.8.5-36.1.el8.x86_64                                                                                                                                                         1/1

Installed:
  compat-libgfortran-48-4.8.5-36.1.el8.x86_64

Complete!

再次搜索/usr/lib/路径下的libgfortran.so.*，已经有了libgfortran.so.3

[userr@localhost gmx_MMPBSA]$ ll /usr/lib64/libgfortran.so.*
lrwxrwxrwx  1 root root      20 May 13  2019 /usr/lib64/libgfortran.so.3 -> libgfortran.so.3.0.0
-rwxr-xr-x  1 root root 1194336 May 13  2019 /usr/lib64/libgfortran.so.3.0.0
lrwxrwxrwx. 1 root root      20 Oct 12  2020 /usr/lib64/libgfortran.so.5 -> libgfortran.so.5.0.0
-rwxr-xr-x. 1 root root 2622416 Oct 12  2020 /usr/lib64/libgfortran.so.5.0.0

运行gmx_MMPBSA:，没有报错，已经正常计算

[userrr@localhost gmx_MMPBSA]$ gmx_MMPBSA -O -i mmpbsa.in -cs md.tpr -ci index.ndx -cg 1 14 -ct fbd.xtc -lm UNK_bcc_gaff.mol2
[INFO   ] Starting
[INFO   ] Command-line
  gmx_MMPBSA -O -i mmpbsa.in -cs md.tpr -ci index.ndx -cg 1 14 -ct fbd.xtc -lm UNK_bcc_gaff.mol2

[WARNING] protein_forcefield and ligand_forcefield variables are deprecate since version 1.4.1 and will be remove in the next version. Please, use forcefield instead.
[WARNING] entropy variable is deprecate since version 1.4.2 and will be remove in v1.5.0. Please, use qh_entropy for Quasi-Harmonic approximation and i_entropy for Interaction entropy approximation instead.
[WARNING] entropy_seg variable is deprecate since version 1.4.2 and will be remove in v1.5.0. Please, use ie_segment instead.
[WARNING] entropy_temp variable is deprecated and will be remove in next versions!. Please, use temperature variable instead
[WARNING] offset and probe are molsurf-only options
[INFO   ] Checking external programs...
[INFO   ] cpptraj found! Using /home/user/software/Amber20/amber20/bin/cpptraj
[INFO   ] tleap found! Using /home/user/software/Amber20/amber20/bin/tleap
[INFO   ] parmchk2 found! Using /home/user/software/Amber20/amber20/bin/parmchk2
[INFO   ] mmpbsa_py_energy found! Using /home/user/software/Amber20/amber20/bin/mmpbsa_py_energy
[INFO   ] Using GROMACS version > 5.x.x!
[INFO   ] gmx found! Using /usr/local/gromacs/bin/gmx
[INFO   ] Checking external programs...Done.

[INFO   ] Building AMBER Topologies from GROMACS files...
[INFO   ] Checking gmxMMPBSA data folder exists in Amber data...
[INFO   ] Get PDB files from GROMACS structures files...
[INFO   ] Making gmx_MMPBSA index for complex...
[INFO   ] Running command: echo name 1 GMXMMPBSA_REC\n name 14 GMXMMPBSA_LIG\n  1 | 14\n q\n | /usr/local/gromacs/bin/gmx make_ndx -n index.ndx -o _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] Normal Complex: Saving group 1_14 in _GMXMMPBSA_COM_index.ndx file as _GMXMMPBSA_COM.pdb
[INFO   ] Running command: echo GMXMMPBSA_REC_GMXMMPBSA_LIG | /usr/local/gromacs/bin/gmx editconf -f md.tpr -o _GMXMMPBSA_COM.pdb -n _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] Generating ligand parameters from UNK_bcc_gaff.mol2 file...
[INFO   ] Running command: /home/user/software/Amber20/amber20/bin/parmchk2 -i UNK_bcc_gaff.mol2 -f mol2 -o _GMXMMPBSA_UNK_bcc_gaff.frcmod
[INFO   ] No receptor structure file was defined. Using ST approach...
[INFO   ] Using receptor structure from complex to generate AMBER topology
[INFO   ] Normal Complex: Saving group 1 in _GMXMMPBSA_COM_index.ndx file as _GMXMMPBSA_REC.pdb
[INFO   ] Running command: echo 1 | /usr/local/gromacs/bin/gmx editconf -f md.tpr -o _GMXMMPBSA_REC.pdb -n _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] No ligand structure file was defined. Using ST approach...
[INFO   ] Using ligand structure from complex to generate AMBER topology
[INFO   ] Normal ligand: Saving group 14 in _GMXMMPBSA_COM_index.ndx file as _GMXMMPBSA_LIG.pdb
[INFO   ] Running command: echo 14 | /usr/local/gromacs/bin/gmx editconf -f md.tpr -o _GMXMMPBSA_LIG.pdb -n _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] Chains ID found. Ignoring chains ID assignation...
[INFO   ] Generating AMBER Compatible PDB Files...
[INFO   ] Building tleap input files...
[INFO   ] Running command: /home/user/software/Amber20/amber20/bin/tleap -f _GMXMMPBSA_leap.in -I /home/user/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/GMXMMPBSA/data
[INFO   ] Cleaning normal complex trajectories...
[INFO   ] Running command: echo GMXMMPBSA_REC_GMXMMPBSA_LIG | /usr/local/gromacs/bin/gmx trjconv -f fbd.xtc -s md.tpr -o COM_traj_0.xtc -n _GMXMMPBSA_COM_index.ndx
[INFO   ] Building AMBER Topologies from GROMACS files...Done.

[INFO   ] Loading and checking parameter files for compatibility...

Preparing trajectories for simulation...
46 frames were processed by cpptraj for use in calculation.

Running calculations on normal system...

Beginning GB calculations with /home/user/software/Amber20/amber20/bin/mmpbsa_py_energy
  calculating complex contribution...
  calculating receptor contribution...
  calculating ligand contribution...

Beginning PB calculations with /home/user/software/Amber20/amber20/bin/mmpbsa_py_energy
  calculating complex contribution...

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Shell是Linux和Unix的外壳，类似衣服，负责外界与Linux和Unix内核的交互联系。例如接收终端用户及各种应用程序的命令，把接收的命令翻译成内核能理解的语言，传递给内核，并把内核处理接收的命令的结果返回给外界，即Shell是外界和内核沟通的桥梁或大门。Linux和Unix提供了多种Shell，其中有种bash，当然还有其他好多种。Mac电脑中不但有bash，还有一个zsh，预装的，据说
Linux MariaDB使用OpenSSL安装SSL证书 Meta39 MySQL Oracle MariaDB Linux Windows ssl linux mariadb
进入到证书存放目录，批量删除.pem证书警告：确保已经进入到证书存放目录find.-typef-iname\*.pem-delete查看是否安装OpenSSLopensslversion没有则安装yuminstallopensslopenssl-devel开启SSL编辑/etc/my.cnf文件（没有的话就创建，但是要注意，在/etc/my.cnf.d/server.cnf配置了datadir的，
简单了解 JVM 记得开心一点啊 jvm
目录♫什么是JVM♫JVM的运行流程♫JVM运行时数据区♪虚拟机栈♪本地方法栈♪堆♪程序计数器♪方法区/元数据区♫类加载的过程♫双亲委派模型♫垃圾回收机制♫什么是JVMJVM是JavaVirtualMachine的简称，意为Java虚拟机。虚拟机是指通过软件模拟的具有完整硬件功能的、运行在一个完全隔离的环境中的完整计算机系统（如：JVM、VMwave、VirtualBox）。JVM和其他两个虚拟机
1分钟解决 -bash: mvn: command not found，在Centos 7中安装Maven Energet!c 开发语言
1分钟解决-bash:mvn:commandnotfound，在Centos7中安装Maven检查Java环境1下载Maven2解压Maven3配置环境变量4验证安装5常见问题与注意事项6总结检查Java环境Maven依赖Java环境，请确保系统已经安装了Java并配置了环境变量。可以通过以下命令检查：java-version如果未安装，请先安装Java。1下载Maven从官网下载：前往Apach
CentOS的根目录下，/bin 和 /sbin 用途和权限 Energet!c Linux日常 centos linux 运维
CentOS的根目录下，/bin和/sbin用途和权限一、/bin(Binary)二、/sbin(SystemBinary)三、总结在CentOS的根目录下，/bin和/sbin目录有不同的用途和权限一、/bin(Binary)用途:存放系统的基本命令，这些命令对所有用户都是可用的。例如：ls、cp、mv、rm等。权限:普通用户和系统管理员都可以使用这些命令。二、/sbin(SystemBinar
【从浅识到熟知Linux】Linux发展史 Jammingpro 从浅学到熟知Linux linux 运维服务器
归属专栏：从浅学到熟知Linux个人主页：Jammingpro每日努力一点点，技术变化看得见文章前言：本篇文章记录Linux发展的历史，因在介绍Linux过程中涉及的其他操作系统及人物，本文对相关内容也有所介绍。文章目录Unix发展史Linux发展史开源Linux官网企业应用情况发行版本在学习Linux前，我们可能都会问Linux从哪里来？它是如何发展的。但在介绍Linux之前，需要先介绍一下Un
linux 发展史种树的猴子内核 java 操作系统 linux 大数据
linux发展史说明此前对linux认识模糊一知半解，近期通过学习将自己对于linux的发展总结一下方便大家日后的学习。那Linux是目前一款非常火热的开源操作系统，可是linux是什么时候出现的，又是因为什么样的原因被开发出来的呢。以下将对linux的发展历程进行详细的讲解。目录一、Linux发展背景二、UINIX的诞生三、UNIX的重要分支-BSD的诞生四、Minix的诞生五、GNU与Free
Linux sh命令 fengyehongWorld Linux linux
目录一.基本语法二.选项2.1-c字符串中读取内容，并执行2.1.1基本用法2.1.2获取当前目录下失效的超链接2.2-x每个命令执行之前，将其打印出来2.3结合Here文档使用一.基本语法⏹Linux和Unix系统中用于执行shell脚本或运行命令的命令。sh[选项][脚本文件][参数...]⏹选项-c：从字符串中读取内容，并执行。-x：在每个命令执行之前，将其打印出来。-s：从标准流中读取内容
Linux vi常用命令 fengyehongWorld Linux linux
参考资料viコマンド（vimコマンド）リファレンス目录一.保存系命令二.删除系命令三.移动系命令四.复制粘贴系命令一.保存系命令⏹保存并退出:wq⏹强制保存并退出:wq!⏹退出(文件未编辑):q⏹强制退出(忽略已编辑内容):q!⏹另存为:w新文件名二.删除系命令⏹删除当前行dd⏹清空整个文档gg：移动到文档顶部dG：删除到最后一行ggdG三.移动系命令⏹移动到文档顶部gg⏹移动到文档底部#方式1G
CentOS 7官方源停服，配置本机光盘yum源码哝小鱼 linux运维 centos linux 运维
1、挂载系统光盘mkdir/mnt/isomount-oloop/tools/CentOS-7-x86_64-DVD-1810.iso/mnt/isocd/mnt/iso/Packages/rpm-ivh/mnt/iso/Packages/yum-utils-1.1.31-50.el7.noarch.rpm(图形界面安装，默契已安装）如安装yum-utils依赖错误，按提示安装依赖包rpm-ivh
第1步win10宿主机与虚拟机通过NAT共享上网互通学习3人组大数据大数据
VM的CentOS采用NAT共用宿主机网卡宿主机器无法连接到虚拟CentOS要实现宿主机与虚拟机通信，原理就是给宿主机的网卡配置一个与虚拟机网关相同网段的IP地址，实现可以互通。1、查看虚拟机的IP地址2、编辑虚拟机的虚拟网络的NAT和DHCP的配置，设置虚拟机的网卡选择NAT共享模式3、宿主机的IP配置，确保vnet8的IPV4属性与虚拟机在同一网段4、ping测试连通性[root@localh
Linux查看服务器日志 TPBoreas 运维 linux 运维
一、tail这个是我最常用的一种查看方式用法如下：tail-n10test.log查询日志尾部最后10行的日志;tail-n+10test.log查询10行之后的所有日志;tail-fn10test.log循环实时查看最后1000行记录(最常用的)一般还会配合着grep用，(实时抓包)例如:tail-fn1000test.log|grep'关键字'（动态抓包）tail-fn1000test.log
科幻游戏《外卖员模拟器》主要地理环境设定 (1) 穷人小水滴游戏科幻设计
游戏名称:《外卖员模拟器》(英文名称:waimai_se)作者:穷人小水滴本故事纯属虚构,如有雷同实属巧合.故事发生在一个(架空)平行宇宙的地球,21世纪(超低空科幻流派).相关文章:https://blog.csdn.net/secext2022/article/details/141790630目录1星球整体地理设定2巨蛇国主要设定3海蛇市主要设定3.1主要地标建筑3.2交通3.3能源(电力)
笋丁网页自动回复机器人V3.0.0免授权版源码希希分享软希网58soho_cn 源码资源笋丁网页自动回复机器人
笋丁网页机器人一款可设置自动回复，默认消息，调用自定义api接口的网页机器人。此程序后端语言使用Golang，内存占用最高不超过30MB，1H1G服务器流畅运行。仅支持Linux服务器部署，不支持虚拟主机，请悉知！使用自定义api功能需要有一定的建站基础。源码下载：https://download.csdn.net/download/m0_66047725/89754250更多资源下载：关注我。安
Linux CTF逆向入门蚁景网络安全 linux 运维 CTF
1.ELF格式我们先来看看ELF文件头，如果想详细了解，可以查看ELF的manpage文档。关于ELF更详细的说明：e_shoff：节头表的文件偏移量（字节）。如果文件没有节头表，则此成员值为零。sh_offset：表示了该section（节）离开文件头部位置的距离+-------------------+|ELFheader|---++--------->+-------------------
NPM私库搭建-verdaccio（Linux） Beam007 npm linux 前端
1、安装nodelinux服务器安装nodea)、官网下载所需的node版本https://nodejs.org/dist/v14.21.0/b)、解压安装包若下载的是xxx.tar.xz文件，解压命令为tar-xvfxxx.tar.xzc)、修改环境变量修改：/etc/profile文件#SETPATHFORNODEJSexportNODE_HOME=NODEJS解压安装的路径exportPAT
每日OJ_牛客_马戏团（模拟最长上升子序列） GR鲸鱼 c++算法开发语言牛客数据结构
目录牛客_马戏团（模拟最长上升子序列）解析代码牛客_马戏团（模拟最长上升子序列）马戏团__牛客网搜狐员工小王最近利用假期在外地旅游，在某个小镇碰到一个马戏团表演，精彩的表演结束后发现团长正和大伙在帐篷前激烈讨论，小王打听了下了解到，马戏团正打算出一个新节目“最高罗汉塔”，即马戏团员叠罗汉表演。考虑到安全因素，要求叠罗汉过程中，站在某个人肩上的人应该既比自己矮又比自己瘦，或相等。团长想要本次节目中的
【2023年】云计算金砖牛刀小试6 geekgold 云计算服务器网络 kubernetes 容器
第一套【任务1】私有云服务搭建[10分]【题目1】基础环境配置[0.5分]使用提供的用户名密码，登录提供的OpenStack私有云平台，在当前租户下，使用CentOS7.9镜像，创建两台云主机，云主机类型使用4vCPU/12G/100G_50G类型。当前租户下默认存在一张网卡，自行创建第二张网卡并连接至controller和compute节点（第二张网卡的网段为10.10.X.0/24，X为工位号
C++常见知识掌握 nfgo c++开发语言
1.Linux软件开发、调试与维护内核与系统结构Linux内核是操作系统的核心，负责管理硬件资源，提供系统服务，它是系统软件与硬件之间的桥梁。主要组成部分包括：进程管理：内核通过调度器分配CPU时间给各个进程，实现进程的创建、调度、终止等操作。使用进程描述符（task_struct）来存储进程信息，包括状态（就绪、运行、阻塞等）、优先级、内存映射等。内存管理：包括物理内存和虚拟内存管理。通过页表映
Spring4.1新特性——Spring MVC增强 jinnianshilongnian spring 4.1
目录 Spring4.1新特性——综述 Spring4.1新特性——Spring核心部分及其他 Spring4.1新特性——Spring缓存框架增强 Spring4.1新特性——异步调用和事件机制的异常处理 Spring4.1新特性——数据库集成测试脚本初始化 Spring4.1新特性——Spring MVC增强 Spring4.1新特性——页面自动化测试框架Spring MVC T
mysql 性能查询优化 annan211 java sql 优化 mysql 应用服务器
1 时间到底花在哪了？ mysql在执行查询的时候需要执行一系列的子任务，这些子任务包含了整个查询周期最重要的阶段，这其中包含了大量为了检索数据列到存储引擎的调用以及调用后的数据处理，包括排序、分组等。在完成这些任务的时候，查询需要在不同的地方花费时间，包括网络、cpu计算、生成统计信息和执行计划、锁等待等。尤其是向底层存储引擎检索数据的调用操作。这些调用需要在内存操
windows系统配置 cherishLC windows
删除Hiberfil.sys ：使用命令powercfg -h off 关闭休眠功能即可： http://jingyan.baidu.com/article/f3ad7d0fc0992e09c2345b51.html 类似的还有pagefile.sys msconfig 配置启动项 shutdown 定时关机 ipconfig 查看网络配置 ipconfig /flushdns
人体的排毒时间 Array_06 工作
======================== || 人体的排毒时间是什么时候？|| ======================== 转载于： http://zhidao.baidu.com/link?url=ibaGlicVslAQhVdWWVevU4TMjhiKaNBWCpZ1NS6igCQ78EkNJZFsEjCjl3T5EdXU9SaPg04bh8MbY1bR
ZooKeeper cugfy zookeeper
Zookeeper是一个高性能，分布式的，开源分布式应用协调服务。它提供了简单原始的功能，分布式应用可以基于它实现更高级的服务，比如同步，配置管理，集群管理，名空间。它被设计为易于编程，使用文件系统目录树作为数据模型。服务端跑在java上，提供java和C的客户端API。 Zookeeper是Google的Chubby一个开源的实现，是高有效和可靠的协同工作系统，Zookeeper能够用来lea
网络爬虫的乱码处理随意而生爬虫网络
下边简单总结下关于网络爬虫的乱码处理。注意，这里不仅是中文乱码，还包括一些如日文、韩文、俄文、藏文之类的乱码处理，因为他们的解决方式是一致的，故在此统一说明。网络爬虫，有两种选择，一是选择nutch、hetriex，二是自写爬虫，两者在处理乱码时，原理是一致的，但前者处理乱码时，要看懂源码后进行修改才可以，所以要废劲一些；而后者更自由方便，可以在编码处理
Xcode常用快捷键张亚雄 xcode
一、总结的常用命令：隐藏xcode command+h 退出xcode command+q 关闭窗口 command+w 关闭所有窗口 command+option+w 关闭当前
mongoDB索引操作 adminjun mongodb 索引
一、索引基础： MongoDB的索引几乎与传统的关系型数据库一模一样，这其中也包括一些基本的优化技巧。下面是创建索引的命令： > db.test.ensureIndex({"username":1}) 可以通过下面的名称查看索引是否已经成功建立： &nbs
成都软件园实习那些话 aijuans 成都软件园实习
无聊之中，翻了一下日志，发现上一篇经历是很久以前的事了，悔过~~ 　　断断续续离开了学校快一年了，习惯了那里一天天的幼稚、成长的环境，到这里有点与世隔绝的感觉。不过还好，那是刚到这里时的想法，现在感觉在这挺好，不管怎么样，最要感谢的还是老师能给这么好的一次催化成长的机会，在这里确实看到了好多好多能想到或想不到的东西。　　都说在外面和学校相比最明显的差距就是与人相处比较困难，因为在外面每个人都
Linux下FTP服务器安装及配置 ayaoxinchao linux FTP服务器 vsftp
检测是否安装了FTP [root@localhost ~]# rpm -q vsftpd 如果未安装：package vsftpd is not installed 安装了则显示：vsftpd-2.0.5-28.el5累死的版本信息安装FTP 运行yum install vsftpd命令，如[root@localhost ~]# yum install vsf
使用mongo-java-driver获取文档id和查找文档 BigBird2012 driver
注：本文所有代码都使用的mongo-java-driver实现。在MongoDB中，一个集合（collection）在概念上就类似我们SQL数据库中的表（Table），这个集合包含了一系列文档（document）。一个DBObject对象表示我们想添加到集合（collection）中的一个文档（document），MongoDB会自动为我们创建的每个文档添加一个id，这个id在
JSONObject以及json串 bijian1013 json JSONObject
一.JAR包简介要使程序可以运行必须引入JSON-lib包，JSON-lib包同时依赖于以下的JAR包： 1.commons-lang-2.0.jar 2.commons-beanutils-1.7.0.jar 3.commons-collections-3.1.jar &n
[Zookeeper学习笔记之三]Zookeeper实例创建和会话建立的异步特性 bit1129 zookeeper
为了说明问题，看个简单的代码， import org.apache.zookeeper.*; import java.io.IOException; import java.util.concurrent.CountDownLatch; import java.util.concurrent.ThreadLocal
【Scala十二】Scala核心六：Trait bit1129 scala
Traits are a fundamental unit of code reuse in Scala. A trait encapsulates method and field definitions, which can then be reused by mixing them into classes. Unlike class inheritance, in which each c
weblogic version 10.3破解 ronin47 weblogic
版本：WebLogic Server 10.3 说明：%DOMAIN_HOME%：指WebLogic Server 域(Domain）目录例如我的做测试的域的根目录 DOMAIN_HOME=D:/Weblogic/Middleware/user_projects/domains/base_domain 1.为了保证操作安全，备份%DOMAIN_HOME%/security/Defa
求第n个斐波那契数 BrokenDreams
今天看到群友发的一个问题：写一个小程序打印第n个斐波那契数。自己试了下，搞了好久。。。基础要加强了。 &nbs
读《研磨设计模式》-代码笔记-访问者模式-Visitor bylijinnan java 设计模式
声明：本文只为方便我个人查阅和理解，详细的分析以及源代码请移步原作者的博客http://chjavach.iteye.com/ import java.util.ArrayList; import java.util.List; interface IVisitor { //第二次分派，Visitor调用Element void visitConcret
MatConvNet的excise 3改为网络配置文件形式 cherishLC matlab
MatConvNet为vlFeat作者写的matlab下的卷积神经网络工具包，可以使用GPU。主页： http://www.vlfeat.org/matconvnet/ 教程： http://www.robots.ox.ac.uk/~vgg/practicals/cnn/index.html 注意：需要下载新版的MatConvNet替换掉教程中工具包中的matconvnet： http
ZK Timeout再讨论 chenchao051 zookeeper timeout hbase
http://crazyjvm.iteye.com/blog/1693757 文中提到相关超时问题，但是又出现了一个问题，我把min和max都设置成了180000，但是仍然出现了以下的异常信息： Client session timed out, have not heard from server in 154339ms for sessionid 0x13a3f7732340003
CASE WHEN 用法介绍 daizj sql group by case when
CASE WHEN 用法介绍 1. CASE WHEN 表达式有两种形式 --简单Case函数 CASE sex WHEN '1' THEN '男' WHEN '2' THEN '女' ELSE '其他' END --Case搜索函数 CASE WHEN sex = '1' THEN
PHP技巧汇总:提高PHP性能的53个技巧 dcj3sjt126com PHP
PHP技巧汇总:提高PHP性能的53个技巧　　用单引号代替双引号来包含字符串，这样做会更快一些。因为PHP会在双引号包围的字符串中搜寻变量，　　单引号则不会，注意：只有echo能这么做，它是一种可以把多个字符串当作参数的函数译注：　　PHP手册中说echo是语言结构，不是真正的函数，故把函数加上了双引号)。　　1、如果能将类的方法定义成static，就尽量定义成static，它的速度会提升将近4倍
Yii框架中CGridView的使用方法以及详细示例 dcj3sjt126com yii
CGridView显示一个数据项的列表中的一个表。表中的每一行代表一个数据项的数据,和一个列通常代表一个属性的物品(一些列可能对应于复杂的表达式的属性或静态文本)。　　CGridView既支持排序和分页的数据项。排序和分页可以在AJAX模式或正常的页面请求。使用CGridView的一个好处是,当用户浏览器禁用JavaScript,排序和分页自动退化普通页面请求和仍然正常运行。实例代码如下：
Maven项目打包成可执行Jar文件 dyy_gusi assembly
Maven项目打包成可执行Jar文件在使用Maven完成项目以后，如果是需要打包成可执行的Jar文件，我们通过eclipse的导出很麻烦，还得指定入口文件的位置，还得说明依赖的jar包，既然都使用Maven了，很重要的一个目的就是让这些繁琐的操作简单。我们可以通过插件完成这项工作，使用assembly插件。具体使用方式如下： 1、在项目中加入插件的依赖： <plugin>
php常见错误 geeksun PHP
1. kevent() reported that connect() failed (61: Connection refused) while connecting to upstream, client: 127.0.0.1, server: localhost, request: "GET / HTTP/1.1", upstream: "fastc
修改linux的用户名 hongtoushizi linux change password
Change Linux Username 更改Linux用户名，需要修改4个系统的文件： /etc/passwd /etc/shadow /etc/group /etc/gshadow 古老/传统的方法是使用vi去直接修改，但是这有安全隐患（具体可自己搜一下），所以后来改成使用这些命令去代替： vipw vipw -s vigr vigr -s 具体的操作顺
第五章常用Lua开发库1-redis、mysql、http客户端 jinnianshilongnian nginx lua
对于开发来说需要有好的生态开发库来辅助我们快速开发，而Lua中也有大多数我们需要的第三方开发库如Redis、Memcached、Mysql、Http客户端、JSON、模板引擎等。一些常见的Lua库可以在github上搜索，https://github.com/search?utf8=%E2%9C%93&q=lua+resty。 Redis客户端 lua-resty-r
zkClient 监控机制实现 liyonghui160com zkClient 监控机制实现
直接使用zk的api实现业务功能比较繁琐。因为要处理session loss，session expire等异常，在发生这些异常后进行重连。又因为ZK的watcher是一次性的，如果要基于wather实现发布/订阅模式，还要自己包装一下，将一次性订阅包装成持久订阅。另外如果要使用抽象级别更高的功能，比如分布式锁，leader选举
在Mysql 众多表中查找一个表名或者字段名的 SQL 语句 pda158 mysql
在Mysql 众多表中查找一个表名或者字段名的 SQL 语句：　　方法一：SELECT table_name, column_name from information_schema.columns WHERE column_name LIKE 'Name'; 　　方法二：SELECT column_name from information_schema.colum
程序员对英语的依赖 Smile.zeng 英语程序猿
1、程序员最基本的技能，至少要能写得出代码，当我们还在为建立类的时候思考用什么单词发牢骚的时候，英语与别人的差距就直接表现出来咯。 2、程序员最起码能认识开发工具里的英语单词，不然怎么知道使用这些开发工具。 3、进阶一点，就是能读懂别人的代码，有利于我们学习人家的思路和技术。 4、写的程序至少能有一定的可读性，至少要人别人能懂吧... 以上一些问题，充分说明了英语对程序猿的重要性。骚年
Oracle学习笔记(8) 使用PLSQL编写触发器 vipbooks oracle sql 编程活动 Access
时间过得真快啊，转眼就到了Oracle学习笔记的最后个章节了，通过前面七章的学习大家应该对Oracle编程有了一定了了解了吧，这东东如果一段时间不用很快就会忘记了，所以我会把自己学习过的东西做好详细的笔记，用到的时候可以随时查找，马上上手！希望这些笔记能对大家有些帮助！这是第八章的学习笔记，学习完第七章的子程序和包之后

gmx-MMPBSA — error while loading shared libraries: libgfortran.so.3: cannot open shared object file

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