分享一个PyTorch医学图像分割开源库

点击上方“小白学视觉”，选择加"星标"或“置顶”

重磅干货，第一时间送达

本文转载自：我爱计算机视觉

分享一位52CV粉丝Ellis开发的基于PyTorch的专注于医学图像分割的开源库，其支持模型丰富，方便易用。其可算为torchio的一个实例，作者将其综合起来，包含众多经典算法，实用性比较强。

地址在这里：

https://github.com/MontaEllis/Pytorch-Medical-Segmentation

该库特点：

1. 支持2D和3D医学图像分割，可以修改hparam.py文件来确定是2D分割还是3D分割以及是否可以进行多分类。

2. 支持绝大数主流分割模型，几乎提供了所有的2D和3D分割的算法。

3. 兼容几乎所有的医学数据格式(例如 nii.gz, nii, mhd, nrrd, ...)，修改hparam.py的fold_arch即可。

作者提供了训练和测试推断的代码，简单配置后训练和推断都仅需要一行命令。

已包含的分割模型：

• 2D

  •  unet

  •  unet++

  •  miniseg

  •  segnet

  •  pspnet

  •  highresnet(copy from https://github.com/fepegar/highresnet, Thank you to fepegar for your generosity!)

  •  deeplab

  •  fcn

• 3D

  •  unet3d

  •  densevoxelnet3d

  •  fcn3d

  •  vnet3d

  •  highresnert(copy from https://github.com/fepegar/highresnet, Thank you to fepegar for your generosity!)

  •  densenet3d

下载1：OpenCV-Contrib扩展模块中文版教程

在「小白学视觉」公众号后台回复：扩展模块中文教程，即可下载全网第一份OpenCV扩展模块教程中文版，涵盖扩展模块安装、SFM算法、立体视觉、目标跟踪、生物视觉、超分辨率处理等二十多章内容。

下载2：Python视觉实战项目52讲

在「小白学视觉」公众号后台回复：Python视觉实战项目，即可下载包括图像分割、口罩检测、车道线检测、车辆计数、添加眼线、车牌识别、字符识别、情绪检测、文本内容提取、面部识别等31个视觉实战项目，助力快速学校计算机视觉。

下载3：OpenCV实战项目20讲

在「小白学视觉」公众号后台回复：OpenCV实战项目20讲，即可下载含有20个基于OpenCV实现20个实战项目，实现OpenCV学习进阶。

交流群

欢迎加入公众号读者群一起和同行交流，目前有SLAM、三维视觉、传感器、自动驾驶、计算摄影、检测、分割、识别、医学影像、GAN、算法竞赛等微信群（以后会逐渐细分），请扫描下面微信号加群，备注：”昵称+学校/公司+研究方向“，例如：”张三 + 上海交大 + 视觉SLAM“。请按照格式备注，否则不予通过。添加成功后会根据研究方向邀请进入相关微信群。请勿在群内发送广告，否则会请出群，谢谢理解~