gromacs续跑

跑模拟总要遇到续跑的问题,因为经常会由于网络或服务器的原因导致模拟中断。gromacs中续跑的指令是 mdrun -s *.tpr -cpi

有时也会因为初始设定的模拟时间不够长,想延长模拟时间。这时候用到的指令是tpbconv,以改变.tpr里设定的模拟时间。再用mdrun -s *.tpr -cpi续跑。

这里提供一个新的思路。先在初始的.mdp文件里更改模拟时间nsteps,用grompp重新生成.tpr文件,再用新生成的.tpr文件mdrun -s *.tpr -cpi续跑。亲测有效。

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