R语言相关性分析

通过样品之间的相关性分析可以观察组内样品之间的生物学重复。同时组内样品相对组间样品的相关系数越高,获得的差异代谢物越可靠。将皮尔逊相关系数r(Pearson’s Correlation Coefficient)作为生物学重复相关性的评估指标。皮尔逊相关系数利用R软件的内置cor函数计算,|r|越接近1,说明两个重复样品相关性越强


library(corrplot)
a <- mtcars
M = cor(a)
corrplot(abs(M), type = 'lower', 
         method = 'color', 
 

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