在windows 10上安装Linux版Rstudio?

前言

看到标题肯定有人会问,Windows明明可以安装Rstudio 啊,而且安装也相当简单,为什么还要安装linux版呢?答案很简单,windows版有限制,而且用起来总有些地方让人很不舒服,我举三个例子:

  • windows版的Rstudio高分屏优化巨差,在2K以上的屏幕上渲染出来的图片边缘都有锯齿
  • windows版的Rstudio因为依托的是windows,很多源码包无法安装,要么需要r-tools,要么直接平台无法支持,特别是一些单细胞分析的R包
  • windows版的Rstudio的多进程操作受限于windwos的进程调用,不如linux版

如果你不在乎以上几点的话,完全可以继续使用windows版的,但是如果想使用linux版的,我们依然有办法实现,而且体验优良

实现的原理

没错,看到标题你大概能够想到,微软在windows10中引入了linux子系统的概念,即WSL,我们可以通过在WSL中安装R-studio-server的方法,实现弯道救国

方法

既然提到了wsl,那么为了获得完整的性能,我建议还是需要将你的windows更新到最新版的系统,因为windows10在2004版本后将wsl1更新到了wsl2wsl的linux内核并不完整,而wsl2基于Hyper-V功能的子集提供了“真正的 Linux 内核",因此,我建议使用wsl2版本的Ubuntu子系统

版本

安装windows和升级版本的方法大家可以查阅官方教程,这里就不再赘述了,
安装linux子系统,可以参考win10安装Linux子系统
wsl升级可以参考WSL2来了!但是能正常使用并不简单

当然,安装完以上,我还推荐安装windwos 新版终端,从而有一个舒适的写命令环境,可以参考安装和设置 Windows 终端

执行完以上步骤,你就应该可以获得下面的窗口了

wsl2

安装R-base

首先要先安装R, Ubuntu自带的apt库中最新的R版本为3.6, 我们需要安装最新的4.0版,所以添加最新的R源

编辑 sudo vim /etc/apt/sources.list.d/r-tuna.list 输入deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu focal-cran40/

注意,要注意你的ubuntu的版本,如果你是20.04版的话,就是focal前缀,不然需要更换对应的版本。

然后执行

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base-dev

接下来在终端执行R,看一下R的版本是否为最新

R

安装Rstudio server

这一步就非常简单了,执行执行下面的三条命令即可

sudo apt-get install gdebi-core
wget https://download2.rstudio.org/server/bionic/amd64/rstudio-server-1.3.1093-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-1.3.1093-amd64.deb

打开Rstudio

其实执行完上面的过程,默认配置的Rstudio-server就已经安装完成并运行起来了,我们直接在浏览器中输入
http://127.0.0.1:8787/就可以打开安装好的Rstudio-server了
如果你想要自定义配置,例如端口号码的话,可以参考文章Rstudio-server安装配置

windows版和linux版画图对比

linux版

windows版

上图中,windwos由于是使用了mingw64的编译系统,因此显示的是这个平台。而linux就显示gnu了

接下来,对比一下两个平台相同参数生成的图片

局部方法图

因为我只使用了300的分辨率,因此放大后会显得有点模糊了,如果想要更清楚,可以调大分辨率或直接使用pdf或svg生成矢量图。

这里一个显而易见的结论是,ubuntu版的尽管会模糊,但是边缘不会生成锯齿,而windows则出现比较明显的锯齿,这种图是让人无法接受的。

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