Mac下用aspera上传重测序数据遇到的坑

关于Mac aspera的问题,困扰了几个月。

1.没有此目录

解决办法:添加环境变量

2.string not in pwd

找了很久,这样可以解决:

/Users/apple/Applications/Aspera\ Connect.app/Contents/Resources

添加一个转义字符\,解决啦,开心!!!

3.NCBI连接不上去,加了端口也没用

好吧,转战NGDC,和ncbi命令行差不多

/Users/apple/Applications/Aspera\ Connect.app/Contents/Resources/ascp -P33001 -i /Users/apple/Documents/test/aspsub_rsa -QT -l100m -k1 -d  /Volumes/Tan/raw/[email protected]:uploads/[email protected]_5404ea8d/GSA/

NGDC填写文件太烦了,尤其是那个md5码,一下子填了600多个伤不起,难免和文件对不上,有几个文件就会验证失败。2T多的数据保守估计要传六天左右,真是崩溃。

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