cworld

使用conda安装

##创建cworld环境,安装相关依赖(**注意版本要求**)
conda create -n cworld -y
conda activate cworld
conda install python=2.7.9 numpy=1.11.3 matplotlib=1.5.3 spicy=0.19.0 h5py=2.7.1 pysam=0.15.3 scikit-learn=0.18.1 bedtools=2.30.0 -y

##安装GD模块,使用下面命令查看自己是否已安装GD模块及其版本信息
perl -MGD -e 'print $GD::VERSION ."\n";'
##若提示未安装,运行下方命令进行安装
##前往--https://github.com/libgd/libgd/releases 下载最新版本libgd的安装包libgd-2.3.2.tar.gz并提取文件进行安装
cd libgd-2.3.2
./configure
make
sudo make install
##安装GD模块
sudo cpan install GD
##若提示未安装libcpanplus-perl,则按提示先安装
sudo apt install libcpanplus-perl
##成功安装,再安装GD模块
sudo cpan install GD
##此时再运行下方命令查看,成功显示版本信息
perl -MGD -e 'print $GD::VERSION ."\n";'
2.73
##前往--https://github.com/dekkerlab/cworld-dekker 下载最新版本安装包
cd cworld-dekker-master
perl Build.PL
##若提示未安装Build模块
sudo cpan install MODULE::Build
安装成功之后再执行命令
perl Build.PL
./Build
sudo ./Build install
安装成功
后续可以运行相应脚本







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