centOS6.5下openfoam-2.4.0安装及并行实现

在华为云进行openfoam并行测试，采用nfs共享进行openfoam-2.4.0的安装并行。

系统为centOS6.5,只支持openfoam-2.4.0以下版本的源代码编译。

参考：

https://blog.csdn.net/ztq157677114/article/details/49819925

1. 安装包准备 
   所需程序安装包包括
   Openfoam-2.4.0、Thirdparty-2.4.0
   依赖库安装包包括：
   gcc-4.8.5,gmp-5.1.2,mpfr-3.1.2,mpc-1.0.1,boost-1.55.0,llvm-3.4.src.tar.gz, qt-everywhere-opensource-src-4.7.3.tar.gz
   并行安装包
   Mpich-3.3或openmpi-1.8.5，openfoam第三方库中的openmpi-1.8.5有问题，需要重新下载。采用mpich并行需要修改openfoam-2.4.0/etc/config下的setting.sh文件以及openfoam-2.4.0/etc/bashrc文件。
2. 安装步骤
   a) 创建路径，解压缩。安装目录/opt/OpenFOAM。
       /opt/OpenFOAM为安装包默认安装路径，尝试过修改为其他路径，但总是出现脚本路径报错。脚本中路径逻辑关系太烦了，就用的默认路径。
       mkdir /opt/OpenFOAM
       tar -zxf OpenFOAM-2.4.0.tgz -C /opt/OpenFOAM/
       tar -zxf ThirdParty-2.4.0.tgz -C /opt/OpenFOAM/
       cd /opt/OpenFOAM
   b) 修改配置文件
       需要修改的文件有两个，分别是位于/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.0/etc/bashrc和/opt/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.0/etc/config/settings.sh。
   
   
   foamInstall 修改文件安装目录
   foamCompiler 选择编译器，ThirdParty表示采用ThirdParty中的第三方编译器及其他库来进行编译。Openfoam不支持混合编译，如gcc用系统自带，cgal用thirdParty中的软件，这种不支持。需要全部用系统自带或者全部为第三方库。
   虽然我安装服务器为centOS中gcc为4.8.5，但依然选用ThirdParty
   WM_MPLIB=MPICH，选择并行软件，默认systemOpenMPI。选择openmpi，默认版本为1.8.5。我在安装时openmpi-1.8.5不能实现并行，无论是采用thirdParty自带openmpi或者官方下载的openmpi。根据官方论坛所述，系统自带openmpi存在问题，在2.4.5后续版本已经修复。
   选择MPICH,系统默认版本为mpich2-1.1.1p1，需要在setting.sh中修改为mpich3.3。安装时要保持文件夹名称一致。

setting.sh

 

1. 修改ThirdParty下依赖库版本号
2. 修改MPICH下并行软件版本号

注意：严格按照settings.sh文件中规定的版本下载相应的包并解压到ThirdParty目录下，解压后的名字和图片中的一致。需要下载的包有gcc-4.8.2，mpfr-3.1.2, gmp-5.1.2, mpc-1.0.1, boost-1.55.0，llvm-3.4.src.tar.gz,qt-everywhere-opensource-src-4.7.3.tar.gz

加入环境变量：

vim ~/.bashrc

source /opt/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.0/etc/bashrc

export PLATFORM=/opt/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.0/platforms

关闭.bashrc

生效source ~/.bashrc

配置完成 开始编译

1. 编译gcc
   cd /opt/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.0
   tar -jxvf gcc-4.8.5.tar.bz2
   mkdir gcc-4.8.5
   进入安装目录
   ./configure –prefix=/opt/OpenFOAM/ ThirdParty-2.4.0/ gcc-4.8.5
   make
   make install
   gcc –v     ###正确后将编译后文件拷贝到$PLATFORM/linux64/gcc-4.8.5/目录
   vim /root/.bashrc    //加入环境变量
   export PATH=$PLATFORM/linux64/gcc-4.8.5/bin:$PATH
   LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64/gcc4.8.5/lib:$PLATFORM/lnux64/gcc4.8.2/lib64:$PLATFORM/linux64/mpc1.0.1/lib:$PLATFORM/linux64/mpfr-3.1.2/lib:$PLATFORM/linux64/gmp5.1.2/lib:$LD_LIBRARY_PATH
   export LD_LIBRAYR_PATH
   ###保存退出
   source /root/.bashrc
   安装完成查看版本gcc –version，若为4.8.5则安装成功
2. 编译cmake
   ./makeCmake
   编译成功后，添加环境变量
   export PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/cmake-2.8.12.1/bin:$PATH
   若自带脚本编译不成功，可独立编译。参考gcc编译过程
3. 编译cgal
   makeCGAL的软件安装包名称需要修改。
   
   
   ./makeCGAL
   export PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/CGAL-4.6/bin:$PATH
   export LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/CGAL4.6/lib:$LD_LIBRARY_PATH
4. 编译llvm
   ./makeLLVM
   export PATH=$PLATFORM/linux64/llvm-3.4/bin:$PATH
   export LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64/llvm-3.4/lib:$LD_LIBRARY_PATH
5. 编译qt
   ./makeQt
   export PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/qt-4.7.3/bin:$PATH
   export LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/qt-4.7.3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
6. 编译Scotch
   cd /opt/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.0/scotch_6.0.3/src
   make
   make install
   完成后将编译后文件夹拷贝到$PLATFORM/linux64/ scotch_6.0.3/目录
   或者./Allwmake 编译
7. 编译mpich-3.3
   进入安装文件夹
   ./configure  --prefix=/opt/OpenFOAM/ ThirdParty-2.4.0/ mpich-3.3
   make
   make install
   export PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/mpich2-1.1.1p1/bin:$PATH
   export LD_LIBRARY_PATH=$PLATFORM/linux64Gcc/mpich2-1.1.1p1/include: $LD_LIBRARY_PATH
   测试是否成功: whereis mpirun 显示安装目录则成功
8. OpenFOAM编译
   cd /opt/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.0
   ./Allwmake
   编译成功，若需日志，可采用./Allwmake >allmake.log  2>&1 &