Ubuntu20.04 安装 DeSeq2报错解决

问题描述

ubuntu20.04，安装好了R(4.2.0)和Rstudio Server, 按照如下脚本安装包时报错：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
 install.packages("BiocManager")

  BiocManager::install("DESeq2")
  BiocManager::install("GEOquery")
  BiocManager::install("canvasXpress")
  BiocManager::install("ggplot2")
  BiocManager::install("clinfun")
  BiocManager::install("GGally")
  BiocManager::install("factoextra")

以root用户安装以下包解决：

sudo apt-get install -y libxml2-dev libcurl4-openssl-dev libssl-dev