咋回事儿啊？
咋回事儿啊？

关于KEGG报错找不到物种的解决办法

clusterProfiler包最近变得奇怪起来了，经常找不到物种

从网上汇总了一下解决办法，就是修改clusterProfiler包里面下载数据库的option

建明：library(R.utils)

R.utils::setOption( "clusterProfiler.download.method",'auto')


Y叔官方

R.utils::setOption( "clusterProfiler.download.method",'wininet')

我改了一下，都是不行，但是clusterProfiler的option其实还是有很多选项的

"wininet","auto","libcurl","wget","curl"

每个都试一试吧，我试到wget就成功了，有可能是linux系统用wget，windows用wininet吧

实在不行只能卸载包重新安装了

remove.packages(c("clusterProfiler"))
 

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