参考 生信星球 公众号教程
- 向量
- 从向量中提取元素
- 数据框
1.向量
c( ) 你可以理解为combine 把几个元素合一起
向量：多个元素组成的变量
a<- c(6,8,8)
a<- c('wo','帅气', '1')
标量：一个元素组成的变量
b<-'帅气'
b<-'2'
x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<-(1:8) #1到8 ： 1 2 3 4 5 6 7 8
x<-seq(1,6,by = 2) #1到6，间隔是2 ： 1 3 5
x<-rep(1:2,times=2) #1到2重复2次 ： 1 2 1 2
你赋值的变量 都在Rstudio右上角看得到
右上角
2. 从向量中提取元素
（1）根据元素位置
x<-c(1:10) # 先让赋值给x ,10个元素
#这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4] # x第4个元素
x[-4] # 排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4] # 第2到4个元素
x[-(2:4)] # 除了……
x[c(1,5)] # 第1个和第5个元素
（2）根据值的大小
x<-c(-1,0,1,2,10) #先给x个赋值
x[x==10] # 返回等于10的元素
x[x<0] # 返回<0的元素
x[x %in% c(1,2,5)] # 存在于向量c（1，2，5）中的元素
3. 数据框
（1）读取本地数据
在公众号【生信星球】后台回复：“数据类型”即可获得 示例数据
读取要记得 设置你文件所在的目录
setwd('C:\\Users\\XFY\\Desktop\\生信\\豆花分享') #设置工作目录
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #读取文件，分隔符为Tab，有表头
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a
NA表示空值
点击Rstudio右上角 数据框 a 显示此界面
（2）设置行名和列名
1.读取csv文件，查看行列名
#在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
X<-read.csv('doudou.txt')
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
读取csv文件，查看行列名
（3）修改行名 、列名
# 将 【列名】 第一个修改为 ‘bioplanet’
colnames(X)[1]<-"bioplanet"
# 修改 行名， 改第二行
rownames(X)[2]<-'试一试'
（4) 读取csv时 row.names=F 或T 感受一下
#最后row.names的意思是修改第一列为行名
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)
row.names=T 时
（5）数据框的导出
导出txt格式：
分隔符是逗号 sep = ","
引号不要 quote=F
#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)
（6）变量的保存与重新加载
学会保存和重新加载
有的数据是代码运行很久得到的，可以保存，下次直接调用
保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData") # 保存当前所有变量
save(a,file="自己命名.RData") # 保存其中一个变量
load("自己命名.RData") # 再次使用RData时的加载命令
（7）提取元素
x [x,y] 逗号左边x代表行，逗号右边代表列
X[1, 2 ] # 第1行第2列
X[2,] # 第2行
X[ , 3] # 第3列
X[ 3] # 也是第3列
X[2:4] # 第2列到第4列
X[ ,2:4]
X[c(6,8)] # 第6列和第8列
X$ 列名 # 也可以提取列 美元符号$ 提取