Day4——李棉袄

前言：今天开始接触R语言的学习。由于在学校上课时已安装R 3.6.4和R studio，这里就不再写安装步骤。
(P.S. 安装的时候有个大坑，必须确保自己的电脑用户名是英文，因为它不能识别中文路径orz...) 若发现是中文用户名，找生信星球 → 当Rstudio杠上中文用户名

什么是R、Rstudio、R包？

1.R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。
2.R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。
3.RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。
4.R包是函数、数据和文档（documentation）的集合，是对R基础功能的扩展。R包只需安装一次，但每次打开新的session都要重新加载。

Rstudio工作界面 (图片出自公众号生信星球)

Rstudio工作界面功能介绍 (图片出自公众号生信星球)

接下来我们学做两个简单的图

1.利用runif/rnorm函数作图

plot(rnorm(50))
or #这个不用打啊，只是二选一的意思
plot(runif(50)) #plot在统计分析学上的意义可理解为每个影响整体的关键事件节点

runif & rnorm区别

runif(5)        # 生成 5 个介于 0 和 1 之间的均匀分布的随机数
runif(5, 1,10)  # 生成 5 个介于 0 和 10 之间的均匀分布的随机数
rnorm(5)        # 生成 5 个正态分布的随机数，它们的中位数为 0，标准差为 1
rnorm(5, 3, 7)  # 生成 5 个正态分布的随机数，它们的中位数为 3，标准差为 7

2.boxplot图的制作

boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink")) #颜色可以自选
#In descriptive statistics, a box plot or boxplot is a method for graphically depicting groups of numerical data through their quartiles. 显示总体样本的变化

boxplot图显示结果 (图片出自公众号生信星球)

所学的其他R语言指令小合集（*所有符号记得检查是否用的英文模式！！！）

setwd("路径文本") →设置该路径为工作目录（记得加引号！！！）
getwd()→查看工作目录
dir()或者list.files()→显示所在工作目录下的所有文件，相当于linux中的ls
<-→赋值，把3+2赋值给a就是a <- 3+2（快捷键Alt+-即可打出赋值号）
rm()→删除变量，如删除上面的变量a就是rm(a)
rm(list = ls( ))→这个够狠，一下子所有变量都清空了 :)
install.packages("包名称")→下载安装R包，记得有引号 (P.S. tidyverse是一个R包合集，ggplot2,tibble,reader,purrr,dplyr被称为tidyr的核心)
library(包名称)→加载R包
history()→列出一大堆历史记录（当双击某个命令时它会跳到console的大于号后面，我们可以对某条命令修改并运行）
history(5)→只列出最近的5条记录
save.image→保存数据和绘图函数
ctrl+l→清空控制台