Linux下miniconda的安装使用

Anaconda与Miniconda的区别

• Anaconda是一个打包的集合器皿，里面预装好了conda、某个版本的python、众多packages、科学计算工具等等，所以也称为Python的一种发行版。
• Miniconda只包含最基本的内容——python与conda，以及相关的必须依赖项，一般生信分析建议安装miniconda

Miniconda的安装

• Miniconda的官网Miniconda — Conda documentation，可以选择适合的版本
• 用wget命令下载

wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

• 授予权限并且运行

chmod 777 Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh
sh Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh

这里一路点击确定yes，并且需要记录conda的安装路径

2.jpg

最后询问是不是要初始化miniconda的时候，选择no

Screenshot 2021-06-05 124712.jpg

• 编辑 .bashrc文件
  .bashrc 是一个隐藏文件，你可以通过ls -a命令看到，用vim命令修改该文件

vim ~/.bashrc

加入miniconda3的安装目录作为环境变量，这里就是上步我截图那个地址

export  PATH="/home/zhuchengqi/miniconda2/bin:"$PATH"

source ~./bashrc

• 验证是否安装成功

conda   #如果有反应，则说明安装成功

添加频道

有一位up主说的很有道理，我引用他的话 “跟家里的电视机是一样一样的，安装conda就相当于买了一台电视机，但是有电视了不意味着你就能看节目了，你要手动添加频道才能看你想看的电视节目conda的安装与使用（2021-04-27更新） - (jianshu.com)”

• 这里可以安装清华的镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

• 查看已经添加的channels

conda config --get channels

希望可以帮助大家！

Reference:

conda的安装与使用（2021-04-27更新） - (jianshu.com)
Linux系统下conda的安装与使用_怀里的折耳猫的博客-CSDN博客