mac下如何使用ENA File Downloader与Aspera下载相关文件

EMBL-EBI数据下载

本人的电脑系统为Mac os 12

准备工作

ENA File Downloader软件下载

ENA File Downloader[https://github.com/enasequence/ena-ftp-downloader],由于电脑系统为Macos,因此就需要下载jar格式的软件,同时也可以下载完整ena-file-downloader-v1.2.2-with-runtime.zip的压缩包,然后解压找到jar运行文件

Aspera-connect软件下载

下载地址:[https://www.ibm.com/aspera/connect/]
默认就是下载的dmg文件,然后你就可以一步一步的安装了。

java 安装

java下载与安装:[https://www.java.com/zh-CN/]

软件运行

java -jar ena-file-downloader-v1.2.2.jar

运行程序

parameters:com.sun.javafx.application.ParametersImpl@3de38711
16:07:14.411 [JavaFX Application Thread] INFO uk.ac.ebi.ena.downloader.gui.Main - parameters:com.sun.javafx.application.ParametersImpl@3de38711
/Users/zhangjian/Downloads
16:07:14.783 [JavaFX Application Thread] INFO u.a.e.e.d.gui.SearchController - Configuration loaded from /Users/zhangjian/Downloads/ena-file-downloader.settings
16:07:34.145 [JavaFX Application Thread] INFO u.a.e.e.d.gui.SearchController - Please enter a valid accession.

截屏2021-08-16 17.40.27.png

启用Aspera

在下载方法哪里选择Aspera

同时在Aspera软件位置与Aspera公共密匙出填写相关文件位置

软件位置

/Users/zhangjian/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources/ascp

公共密匙位置

/Users/zhangjian/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources/asperaweb_id_dsa.openssh


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就是上面的相关文件的位置如何找到

1.就是安装Aspera-connect就会在/Users/zhangjian/Applications下找到三个软件,但是你会发现就是如果点击就会启动软件,因此需要在终端下才能够进入到相关文件夹下。
2.cd /Users/zhangjian/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources #使用cd命令转到该文件夹下。
3.然后你就可以找到相关的文件了。

ls ascp
ascp
ls *.openssh
asperaweb_id_dsa.openssh


截屏2021-08-16 17.41.34.png

下载相关的文档

以PRJNA287523为例
1.在accession位置填写PRJNA287523,点击search搜索;
2.在弹出的对话框中选择要下载的数据,同时指定下载的地址;
3.点击下载就可以了;

其下载速度几乎可以到达该网络的最大值;

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