2020-06-24 prefetch 调用 aspera 下载SRA数据踩坑

最近课题需要，要下载几个SRA数据，没想到小小的更新了一下软件，浪费了我大半天时间除bug。因为距离我上一次使用prefetch和aspera下载数据已经有大半年，于是我先把服务器上的prefetch和aspera全部更新到了最新版

conda installsra-tools=2.10.7

conda install-chccaspera-cli=3.9.1

结果当我如往常一样，用下面命令下载数据时

prefetch-tascp-a"/home/lwu/opt/miniconda3/envs/biopy3/bin/ascp|/home/lwu/opt/miniconda3/envs/biopy3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh"SRR10009433-O~/tmp

诡异的事情发生了：

各种google，百度搜索解决办法，都没有效果，并且我在sra-tools的github issues下发现了这个，perfetch已经不支持aspera下载了，令人绝望。具体参考链接：https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/255

莫非只能用http下载了，不甘心的我继续搜寻，发现似乎可以通过版本回退解决这个问题，于是经过本人的多次尝试，以下版本是可以调用aspera的：

conda installsra-tools=2.9.2

conda install-chccaspera-cli=3.7.6

安装成功后，下载命令如下：

prefetch-tascp-a"/home/lwu/opt/miniconda3/envs/biopy3/bin/ascp|/home/lwu/opt/miniconda3/envs/biopy3/etc/asperaweb_id_dsa.openssh"SRR10009433-O~/tmp

折腾了一下午，终于搞定！总结经验，千万不要随随便便更新，有时候旧版本更好用！