1118 chapter 20

简介

• R markdown 速查表，RStudio IDE，Help→cheatsheets → R Markdown Cheat Sheet
• 用户指南： Help→cheatsheets → R Markdown Reference Guide
• R Markdown： .Rmd,三个重要组成部分:
  Markdown文本，代码段，YAML文件头

p297练习题

3.关闭控制台后，R notebook在编辑器里显示结果。
R markdown在控制台显示输出结果。
此外，二者的YAML的文件头显示不一样

分别是 ouptut: html_notebook和ouptut: html_document
修改文件头可以修改文件格式

格式化文本

和的用法差不多

代码段

插入代码的3种方法

• ctrl+shift+I
• Insert按钮
• 手工输入 ```{r} 和···
  实用组合键
  ctrl+ enter || ctrl + shift + enter

代码段名称

{r by-name}给代码起名字的好处

• 方便浏览特定的代码段
• 使代码段生成的图形具有意义的名称
• 建立缓存代码段的网络
  setup，处于笔记本模式时，名称为setup的代码段会先自动运行一次

代码段选项

eval = FALSE
include = FALSE
echo = FALSE，禁止代码出现在最终报告
message = FALSE
results = ‘hide’
error = TRUE

表格

• knitr::kable()用表格来显示数据
• 更深入的定制包， xtable， stargazer， pander， tables和ascii等

缓存

• cache = TRUE ，knitr默认情况下只检查代码
• 霸道的cache.extra
• file.info()
• knitr::clean_cache(),定期清理所有缓存

内联代码

format()、 digits()、big.mark

排错

run一遍先
getwd(), print(), str()

YAML 文件头

文档参数（params
）+参考文献（pandoc）

• 参考文献格式： BibLaTeX,bIBtEX,endnote，medline
  引用：csl
  references or bibliography