2022-03-11

Blood Can Dis | UBTF串联重复与儿童急性髓系白血病复发的关系

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急性髓系白血病（AML）始于骨髓，但通常也很快进入血液。大多数类型的AML的主要治疗方法是化疗，有时还包括靶向治疗药物。接下来可能会进行干细胞移植。当AML复发时，治疗更加困难。现在，St. Jude儿童研究医院的科学家们报告说，他们发现了儿童AML中的一种突变，医生可以用它来识别高危患者，更好地指导治疗。

他们的研究结果发表在《Blood Cancer Discovery》杂志上的一篇题为“Integrated genomic analysis identifies UBTF tandem duplications as a recurrent lesion in pediatric acute myeloid leukemia”的论文中。

研究人员评估了136名接受复发性AML治疗的St. Jude患者的基因组学。

“儿童复发性AML的遗传学尚未得到全面定义。”研究人员写道，“在这里，我们展示了136例复发性儿童AML的基因组改变谱。我们在9%的复发性AML病例中发现了UBTF中的复发性外显子13串联重复（TD）。UBTF-TD AML通常具有正常的核型或8号染色体三体，并伴有WT1突变或FLT3-ITD，但没有其他已知的致癌融合。”

“我们从广泛的角度出发，是因为很明显，我们对为什么患有AML的儿童首先会复发没有足够深入的了解。”共同通讯作者、St. Jude病理学系医学博士Jeffery Klco说，“我们在St.Jude进行了大量针对复发性AML的临床试验，这使我们能够获得大量样本，这就是与我们在计算生物学领域的同事的合作对帮助我们分析遗传学非常有益的地方。”

“很早以前就很清楚，有一组病例的这种基因UBTF发生了奇怪的改变，这在过去只是表面上被考虑过。”Klco说。

UBTF-TD AML在儿童中比成人更常见。它还与不良预后和微小残留病（MRD）发病率增加有关。

这种突变在以前的研究中未被发现。St. Jude的研究人员开发了一种计算方法来识别这种突变，这种突变可能存在于AML和其他癌症中。

“这是一种极难检测的突变，因此在开发正确的算法方面做了大量工作。我们必须从头开始开发我们的方法。”共同通讯作者、St. Jude计算生物学系的Xiaotu Ma博士说，“大多数现有方法都假设只有一个事件会产生这类突变，但与UBTF-TD一样，情况并非总是如此。”

“现在我们知道我们在寻找什么以及如何找到它，我们可以很容易地将其纳入临床基因组学中。”Ma说。

这些发现为针对UBTF-TD产生的蛋白质的新策略铺平了道路，并确定了这种肽是如何导致白血病的。