学习小组Day4-Yep

今日学习的是R语言基础，由于之前了解过R语言， 已经安装上RStiudo,安装过程就省略掉。（安装很久过程已经忘记了）

学习R语言首先要了解R语言是什么

R语言在生信分析中常用的是画图软件，但是R语言是统计分析和绘图非常强大的工具，可以对数据进行分析处理制图等。
RStudio是r的集成开发环境(IDE)，它包括一个控制台、语法高亮显示编辑器，支持直接执行代码，以及绘图、历史记录、调试和工作空间管理工具。

Rstudio

相关功能

简单相关函数的应用（要多查询，看到有个啥+（）就查是干嘛的

• 使用rnorm()绘图(一般函数括号内就是参数设置对对象，函数套函数就是括号套括号，plot（）也是一个函数，所以是plot(rnorm()）)
  rnorm()函数会随机正态分布，然后随机抽样 或者取值 n 次,而rnorm(50)
  中的50是指50个随机数，符合正态分布。plot()函数是常用的绘图函数，可以绘制散点图曲线图等等。

plot(rnorm(50))

plot(rnorm())

可以设置其参数，如rnorm(50,3,4)产生5个均值是3，方差是4的随机数
运行参数的时候也会出现报错，查看一下，发现应该是逗号出现问题，应该使用英文输入法下的逗号，而不是中文。改掉就可以出图了。

polt()

有均值和方差

• 画箱线图，使用示例,boxpolt()是绘制箱线图的函数，用于展示数据的整体分布，包括是利用数据中的五个统计量：最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数与最大值来描述数据的一种方法，它也可以粗略地看出数据是否具有有对称性，分布的分散程度等信息，特别可以用于对几个样本的比较。

boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))

箱线图

查看iris$Species是什么

iris是一个R语言自带的数据框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。后面的是箱线图画图用的颜色。说明画箱线图是需要数据框的，那什么是数据框？

• 数据框是R中最常处理的数据结构，数据框不同的列可以包含不同模式（数值型、字符型等）的数据。
  https://blog.csdn.net/weixin_41577291/article/details/79186924

work<-c(PE,Chinese,English)
work<-c('PE','Chinese','English')
Source<-c(85,95,60)
number<-data.frame(Day,work,Source)
number

• <-是赋值，相当于将work等定义，项、而work是被定义的对象，随便什么名字都可以,c()函数: 将括号中的元素连接起来，并不创建向量，向量也是R中的一种数据类型。data.frame（）就是形成数据框

创建一个数据框

那如果想要知道一组数据是什么数据类型，比如想要知道是否是数据框还是向量？
可以使用class()查看数据的类型

查看数据类型

• 查看函数除了百度，还可以直接在R查阅使用方法
  使用？？+要查的函数

?? data.entry

查询相关函数的使用方法

• 设置字体的大小，选择最大的做了个比较（也可以改变颜色等等）

选择36号字体

选择10号字体

R语言的基本操作

• 用Rproject管理工作目录
  https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA
  首先新建目录，建立时需要命名新的目录名字以及存放的位置
  
  新建目录
  
  
  创建成功
  
  使用getwd()查看当前目录所在位置
  
  查看当前路径
• 查看文件列表,把那个查看目录中文件的多少

dir()
list.files()
write.table( number, "number.txt", sep="\t", quote = F, row.names = F, col.names = F )
number<-c(1,1,2,3,4)
write.table( number, "number.txt", sep="\t", quote = F, row.names = F, col.names = F )
dir()
list.files()

查看目录

创建一个文本

创建文本的显示

• 实现简单的运算

  
  
  加减乘除
• 删除变量（跟linux的rm一样）（rm(list=ls()为清空所有变量)
  
  删除
  
  
  清空所有变量
• 查看历史命令

history（）

查看历史命令

• 清空ctrl+l

  
  
  清空

思维导图

思维导图

今日作业就完成啦。