horsefish
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methylKit 统计方法

methylKit可以用来寻找DMR/DMC，其统计方法如下：

  1. logistic regression
  2. Fisher exact test

有重复时methylKit调用 logistic regression，无重复时调用Fisher exact test

methylKit也有自己独特的p-adjust方法SLIM
用户也可以根据自己的需要选择传统的BH等p值校正方法。

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