gitlab-ci.yml执行出现conda: command not found

记录下自己第一次写gitlab-ci.yml文件的经历。我简单了解了一下CI/CD就准备自己上手看看,果然就遇到了一个错误:conda: command not found。因为实验室都配置好了,所以我不用配置runner和docker,而这也导致了我对CI/CD整个流程的不熟悉以至于碰到问题像个无头苍蝇一样。
问了师兄才知道原来gitlab-runner用户并没有安装anaconda,于是我进入服务器给gitlab-runner用户安装了anaconda并且配置了环境,当我觉得万事大吉的时候,现实给了我当头一棒,还是conda: command not found这个错误。在参考了https://github.com/conda/conda/issues/7980这篇文章后顺利的解决了这个问题
gitlab-ci.yml执行出现conda: command not found_第1张图片加入这段代码:

- source ~/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh
- conda activate my_env(自己配置的环境,若没有不需要加)

以下是我测试用的demo


before_script:
 - echo "berfore script" 
after_script:
 - echo "after script"

stages:
 - build
 - test
build-job:
  stage: build
  script: 
    - pwd
    - whoami
    - source ~/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh
    - conda list
    - conda activate rdkit-env
    - python -V
  when: always 

test-job:
  stage: test
  script:
   - pwd
  when: always

其实把这个问题解决以后剩下的部分就简单多了

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