2021-09-11 基于CRISPR的便携式新冠病毒检测

  COVID-19大流行依旧继续着,有些人放弃了,但有些人还在坚持着,以他们自己的方式在对抗着。
  目前,针对COVID-19的诊断还是主要以基于Taqman探针法的RT-qPCR方法进行。但如何根据快速而准确地进行诊断筛选也是研究者们不断探索的方向。今天分享的这项研究就是基于CRISPR开发的,无需进行样本扩增即可实现新冠病毒快速检测的方法——FIND-IT。

FIND-IT

FIND-IT原理:靶向RNA的Cas13a在识别到目标RNA后,除了Cas13a本身可以切割目标RNA外,其旁切活性(无差别降解RNA的能力)也会被激活,从而导致携带Csm6的激活因子释放,Csm6激活后可以更加快速切割荧光探针,实现定量检测。
PS.
1.其实本身基于Cas13a的旁切活性就可以进行新冠病毒的快速检测(Ref 1),但是这种方法的检测灵敏度偏低,仅能达到约1600拷贝/μL样本;而结合Csm6后,其检测灵敏度可以提高到30拷贝/μL样本。

Reference

  1. Fozouni, P. et al. Amplification-free detection of SARS-CoV-2 with CRISPR-Cas13a and mobile phone microscopy. Cell 184 (2021).
  2. Liu, T. Y. et al. Accelerated RNA detection using tandem CRISPR nucleases. Nat Chem Biol 17, 982-988 (2021).

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