小麦参考基因组下载及相关文件说明

小麦基因组下载地址

ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-44/fasta/triticum_aestivum/dna/

其他植物基因组下载地址

http://ensemblgenomes.org/info/genomes?division=4

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pipeline 生信流程

NCBI和ensemble相同版本的基因组注释差别大的原因

答：因为两个组织注释的方法不同啊！
如果你都打开hg38，比较每一条染色体的长度和具体信息，都是完全一致的。
gene注释的话，NCBI应该是RefSeq + 部分预测， Ensembl是自己的Havana + 部分预测，方法和策略都不相同。数目的差异主要集中在lncRNA等非编码RNA的数量上。
所以，如果你有兴趣，比较一下protein coding gene的数目，那两者应该是几乎完全一样的。