单细胞转录组数据分析课件||4. Removal of confounding factors in scRNA-seq data

本文介绍了单细胞数据分析中一个分析点：如何消除混杂因素？

• 何为混杂因素（confounding factors） ？
• 它与批次效应有何区别与联系？
• 如题，如何去除混杂因素
• 在已有的方法中均是消除连续变量型的混杂因素（如“nCount_RNA”），要是离散变量呢？
• 在R中的几种实现方法。
• 主要基于回归的方法。

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This lecture by Bishwa Ghimire (University of Helsinki) is part of the course "Single cell RNA-seq data analysis with R" (27.-29.5.2019). Please see https://www.csc.fi/web/training/-/scr... for the full course description and all the materials.