NCBI|转录组原始数据上传

数据上传NCBI系列又来啦！今天小编来为大家演示的是转录组原始数据上传NCBI哦~

01.申请Biosample编号

1.首先我们需要进入NCBI网页https://www.ncbi.nlm.nih.gov/，进行注册或登录，操作如下：

如果你有NCBI账号可以直接登录

如果你没有NCBI账号，就进行注册操作

你可以选择以下注册平台进行注册

注册完成后，就可以进入NCBI页面啦~

2.点击上传模块，开始申请编号操作啦！

点击我的提交

进入Biosample

点击新的提交

3.接下来填写提交者的基本信息

4.点击继续，进入下一步选择释放日期和样本数量

5.选择样品的类型，小编这里以真核藻类样品为例选择

7.填写表格数据，小编以下载Excel表格为例进行操作：

这里注意一下，绿色为必填项，如果任何必填字段的信息不可用，请酌情输入“not collected”、“not applicable”或“missing”。蓝色为选填项，但至少填写一个，如果任何必填字段的信息不可用，请酌情输入“not collected”、“not applicable”或“missing”。黄色为非填项，可以不予填写。每一个单元格填写是有格式的，可以点击需要填写的列名查看其格式哦！

8.当表格填写完成后，就可以把表格进行上传啦~

如果你在上传表格后出现以下错误，就说明你的样本编号错了，解决方法一可以把样品编号加上大写的字母

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解决方法二在表格最后一列添加如下问题：

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9.问题解决完成后点击继续，检查一下信息是否正确，就可以进行提交，我们的第一步也算完成啦~

02.申请BioProject编号

1.回到最初的提交页面

2.点击BioProject按钮，开始我们的第二步

点击新的提交

填写提交者基本信息，与申请BioSample编号信息填写要一致

3.选择项目类型，一般是选择原始序列读取

选择样本的示例范围

4.填写样本的目标

5.填写释放日期和样本的公开说明

6.填写BioSample编号

进入Biosample

点击申请编号对象

复制第一个编号

回到页面，填写上复制的编号

7.编号填写完成后，点击继续到最后，检查信息是否填写正确后就可以提交啦！这样我们的第二步也完成啦~

03.申请SRA编号和数据上传

1.回到最初的提交页面

2.开始申请SRA编号，操作如下：进入SRA

点击新的提交

填写提交者信息与之前填写信息一致

填写BioProject编号，回到提交页面

进入BioProject查看编号

复制编号后回到提交页面

进入SRA未完成的位置

将编号填写进去并选择释放日期，需与之前填写的释放日期一致

3.编号填写和释放日期选择完成后，点击继续，进行填写表格操作，小编依旧以下载的Excel表格为例进行操作。

打开下载后的表格进行填写

第一列填写BioSample编号

回到NCBI网页，返回至提交页面

进入Biosample查看编号

将下列图中的编号填写进表格第一列

表格第二列可自行填写

表格第三列填写测序类型+某物种，如RNAseq of water

表格第四列填写测序技术

表格第五列填写组学

表格第六列填写选择

表格第七列填写样本数量

表格第八列填写测序平台

表格第九列

表格第十列填写样本说明

表格第十一列填写原始数据的文件类型

表格第十二和十三列填写原始数据文件名

到这里表格就填写完成了，保存表格并上传

4.将原始数据上传到NCBI上

5.将原始数据上传完成后就可以点击提交

提交完成后可以回到提交页面查看提交状态哦~

提交成功后等待1-2天时间会收到数据上传成功的邮件，至此我们的转录组原始数据上传就完成啦！