【工具】Galaxy（training）生信平台资源

Galaxy(https://galaxyproject.org/use/)生物信息分析平台是目前生物医学研究领域最受欢迎的在线生物信息分析工具之一，其后台封装了很多高端的计算工具，并且在网页的前端给这些工具以直观的使用界面而把计算和存储管理的细节隐藏起来。

生信平台化是以后的一大趋势，目前国内外多个公司都建立了自己的生信分析平台，有全免费的也有部分免费的。目前开放的比较有名的有：Galaxy，GenePattern，GenomeQuest，UCSC，DNAnexus等。

Galaxy大部分是免费的，官网的原话：

• Almost all of them are free to use (Commercial clouds are the exception)
• Almost all of them are open to everyone (Academic clouds are the exception).
• All of the resources can be used, either immediately, or shortly after getting an account.

首页对各类服务器进行了分类：

image.png

比如，这里找了个Metabolomics workflow：
https://galaxyproject.org/use/workflow4metabolomics/

更多详细的资源在这个界面，旁边有非常多的工具https://usegalaxy.org/：

image.png

这里怎么有个人去世了，年纪轻轻的，是因为新冠吗？

没用过，现在也不知道怎么用，尤其是部署自己的服务器，对Galaxy平台进行本地化搭建，貌似有些麻烦，后续有机会摸索。

此外，在Github上收集了不少Galaxy Training的内容，资源不是一般多，关键怎么利用的问题。https://galaxyproject.github.io/training-material/

仅仅Proteomics就有一系列内容https://galaxyproject.github.io/training-material/topics/proteomics/

image.png

image.png

Ref：
https://www.jianshu.com/p/8084f27b91e9
https://www.bioinfo-scrounger.com/archives/683/