安装madRoot

Github网址:

davidjamesbryant/MADroot: Efficient implementation of the MAD method for inferring the location of the root in a large phylogeny. (github.com)

1. 下载安装包

安装madRoot_第1张图片

原本应该用git clone --recursive [email protected]:davidjamesbryant/MADroot.git,但有点问题,就手动下了

1)在以上界面 Code→download zip

2)在davidjamesbryant/Phylib at 25b9c273b7066a08e5c45497778e39f9f6288df8 (github.com)

Code→download zip,保存到Phlib文件夹里

把下载完的文件拖进服务器

2.安装

# unzip MADroot-master.zip
cd MADroot-master
make
# 会有g++ -I Phylib madRoot.cpp -o madRoot -O3 --std=c++11的命令行输出
export PATH=$PATH:.

3.调用

安装madRoot_第2张图片

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